HAL - Contributions de l’utilisateur [fr]

Politiques des établissements pour la Science Ouverte

2023-11-30T08:56:39Z

Mlarrieu :

== Organismes de recherche ==
* ENPC, 2018-10, [https://espacechercheurs.enpc.fr/fr/plan-science-ouverte Le Plan Science Ouverte de l’École des Ponts ParisTech]
* CNRS, 2018-11, [https://www.science-ouverte.cnrs.fr/ Feuille de route pour la Science Ouverte]
* IFSTTAR, 2019-11, [https://www.ifsttar.fr/ressources-en-ligne/lactualite-ifsttar/toute-lactualite/fil-info/article/un-vade-mecum-pour-une-recherche-ouverte-a-la-societe/ Pour une Recherche Ouverte à la société, le Vade-mecum de l'Ifsttar]
* Institut Pasteur, 2021-05, [https://research.pasteur.fr/fr/open-science/ Politique de science ouverte pour les publications et les données]

== Universités, groupements d'universités ==
* Sorbonne Université, 2019-03, [https://hal.sorbonne-universite.fr/page/charte-de-sorbonne-universite Charte de Sorbonne Université pour le libre accès aux publications]
* Université Toulouse Jean Jaurès, 2019-07, [https://blogs.univ-tlse2.fr/vie-etablissement/pour-une-science-ouverte/ Charte de l'université Toulouse Jean-Jaurès pour une Science Ouverte]
* Université Clermont Auvergne, 2020-01, [https://alambic.hypotheses.org/6985 Feuille de route pour la Science Ouverte de Université Clermont Auvergne]
* Université Paul Sabatier Toulouse 3, 2020-07, [http://www.curif.org/fr/la-curif-sengage-pour-la-science-ouverte/ Membre de la Coordination des universités de recherche intensive françaises (CURIF)] *Lien mort*
* Université Jean Moulin Lyon 3, 2020-11, [https://www.univ-lyon3.fr/medias/fichier/charte-science-ouverte-lyon3-web_1608112950703-pdf Charte pour la science ouverte de l'Université Jean-Moulin Lyon 3]
* Université Claude Bernard Lyon 1, 2021-02, [https://www.univ-lyon1.fr/actualites/lettre-de-mission-de-la-referente-science-ouverte-pour-lucbl Lettre de mission de la référente Science Ouverte pour Lyon 1]
* Aix-Marseille Université, 2021-07, [https://www.univ-amu.fr/system/files/2021-09/Politique_Science_Ouverte_AMU.pdf Charte d’Aix-Marseille Université en faveur de la science ouverte]
* Université de Lille, 2021, [https://bu.univ-lille.fr/fileadmin/user_upload/SCD/Recherche/FdRouteSO_A4print.pdf Feuille de route pour la science ouverte de l'Université de Lille]
* Université Sorbonne Paris Nord, 2022-03, [https://www.univ-spn.fr/wp-content/uploads/Charte-de-luniversite-SCIENCE-OUVERTE.pdf Charte de l'Université Sorbonne Paris Nord pour la science ouverte]
* Université de Reims Champagne-Ardennes, 2022-06, [https://www.univ-reims.fr/science-ouverte/la-science-ouverte-a-l-urca/la-charte-pour-la-science-ouverte/la-charte-pour-la-science-ouverte,25509,42127.html Charte URCA (Université de Reims Champagne-Ardennes) pour la science ouverte]
* Université de Bordeaux, 2022-06 [https://bibliotheques.u-bordeaux.fr/content/download/129090/954188/version/1/file/2021_03_Charte_Science-Ouverte-1.pdf Charte "Pour une science ouverte"]
* U Grenoble Alpes, 2022-12, [https://scienceouverte.univ-grenoble-alpes.fr/wp-content/uploads/2023/01/Charte-SO_UGA_2022-12-08.pdf Charte Science Ouverte Université Grenoble Alpes]
* Université de Bourgogne, 2022-(?), [https://bu.u-bourgogne.fr/EXPLOITATION/basicfilesdownload.ashx?repositoryId=1&itemId=13064 feuille de route science ouverte de l'Université de Bourgogne]
* Université d'Artois, 2022(?), [https://science-ouverte.univ-artois.fr/wp-content/uploads/2022/06/roadmap-V3.pdf Feuille de route de l'Université d'Artois pour la science ouverte]
* Université Lumière Lyon 2, 2022-10 [https://www.univ-lyon2.fr/universite/actualites-universitaires/une-feuille-de-route-pour-la-science-ouverte Feuille de route science ouverte de l'Université Lumière Lyon 2]
* Université Paris Cité, 2022-06, [https://u-paris.fr/science-ouverte/feuille-de-route/ Feuille de route pour la Science Ouverte]
* Université de Tours, 2022-06 [https://www.univ-tours.fr/medias/fichier/charte-science-ouverte_1662627501636-pdf?ID_FICHE=446271&INLINE=FALSE Charte pour la science ouverte de l’université de Tours]
* Avignon Université, 2023-04, [https://univ-avignon.fr/recherche/science-ouverte/ Charte pour la science ouverte Avignon Université]
* Université Côte d'Azur, 2023(?), [https://univ-cotedazur.fr/recherche-innovation/science-ouverte/science-ouverte-a-universite-cote-dazur/charte-de-la-science-ouverte Charte science ouverte de l'Université Côte d'Azur]

== Écoles, Grands établissements ==
* AgroParisTech, 2020-01, [http://www2.agroparistech.fr/Science-ouverte-4495.html Politique science ouverte]
* ENS Lyon, 2023-07, [https://www.ens-lyon.fr/sites/default/files/2023-10/FdR_SO_2023.pdf Feuille de route science ouverte]
== Unités de recherche (laboratoires, équipes, etc.) ==
* UMR Ambiances Architectures Urbanités, 2021-02 [https://aau.archi.fr/laboratoire-aau/engagement-science-ouverte/ Engagement pour la Science ouverte]

== Voir aussi ==

* [https://bridge-science-ouverte.fr/ Projet ANR BRIDGE] "partage et l’ouverture des données de la recherche dans le contexte des UMR (Unités Mixtes de Recherche)"
* [https://www.ccsd.cnrs.fr/assemblee-partenaires-hal/?cat=2362#/ CCSD assemblée des partenaires et leurs politiques science ouverte]

Les incertitudes sur les dates sont signalées par des "(?)" (année, mois). Si plusieurs dates sont trouvées, c'est celle du vote en CA qui a été préférée, sinon la mise en ligne, sinon la date signalée sur le document.

Politiques des établissements pour la Science Ouverte

2023-03-27T09:17:24Z

Mlarrieu :

* ENPC, 2018-10, [https://espacechercheurs.enpc.fr/fr/plan-science-ouverte Le Plan Science Ouverte de l’École des Ponts ParisTech]
* CNRS, 2018-11, [https://www.science-ouverte.cnrs.fr/ Feuille de route pour la Science Ouverte]
* SU, 2019-03, [https://hal.sorbonne-universite.fr/page/charte-de-sorbonne-universite Charte de Sorbonne Université pour le libre accès aux publications]
* UT2J, 2019-07, [https://blogs.univ-tlse2.fr/vie-etablissement/pour-une-science-ouverte/ Charte de l'université Toulouse Jean-Jaurès pour une Science Ouverte]
* IFSTTAR, 2019-11, [https://www.ifsttar.fr/ressources-en-ligne/lactualite-ifsttar/toute-lactualite/fil-info/article/un-vade-mecum-pour-une-recherche-ouverte-a-la-societe/ Pour une Recherche Ouverte à la société, le Vade-mecum de l'Ifsttar]
* UC2A, 2020-01, [https://alambic.hypotheses.org/6985 Feuille de route pour la Science Ouverte de Université Clermont Auvergne]
* AgroParisTech, 2020-01, [http://www2.agroparistech.fr/Science-ouverte-4495.html Politique science ouverte]
* UT3, 2020-07 [http://www.curif.org/fr/la-curif-sengage-pour-la-science-ouverte/ Membre de la Coordination des universités de recherche intensive françaises (CURIF)]
* Université Claude Bernard Lyon 1, 2021-02, [https://www.univ-lyon1.fr/actualites/lettre-de-mission-de-la-referente-science-ouverte-pour-lucbl Lettre de mission de la référente Science Ouverte pour Lyon 1]
* UMR Ambiances Architectures Urbanités, 2021-02 [https://aau.archi.fr/laboratoire-aau/engagement-science-ouverte/ Engagement pour la Science ouverte]
* Institut Pasteur, 2021-05, [https://research.pasteur.fr/fr/open-science/ Politique de science ouverte pour les publications et les données]
* Université Paris Cité, 2022-06, [https://u-paris.fr/science-ouverte/feuille-de-route/ Feuille de route pour la Science Ouverte]

Voir aussi sur le site du CCSD [https://www.ccsd.cnrs.fr/assemblee-partenaires-hal/?cat=2362#/ la liste des établissements avec portail HAL et politique Science ouverte]

Exemples de sites intégrant un flux provenant de HAL

2023-03-20T12:14:19Z

Mlarrieu :

* Au niveau des laboratoires (UMR, UAR, UR ...)

[https://www.ipgp.fr/en/research/publications/ Publications de l'IPGP ] 
[https://lce.univ-amu.fr/docs/2019/_1 Laboratoire LCE (Addon Drupal AMU)] 
[http://www.uvsq.fr/laboratoire-des-sciences-du-climat-et-de-l-environnement-lsce-umr-8212-cnrs-cea-uvsq--10461.kjsp Les pages laboratoires du site de l'UVSQ (HalTools)] 
[https://www.pacte-grenoble.fr/publications Laboratoire Pacte (UMR 5194)] 
[http://aau.archi.fr/laboratoire-aau/publications/?type=OUV Laboratoire ambiances architectures urbanités (UMR 1563)] 
[http://eda.recherche.parisdescartes.fr/publications2-eda-sur-hal-shs/ Laboratoire EDA (HalTools)] 
[http://iramis.cea.fr/nimbe/Phocea/Vie_des_labos/Ast/ast_groupe.php?id_groupe=448&voir=publis Laboratoire LSDRM (haltools)] 
[https://stl.univ-lille.fr/productions-scientifiques/les-publications Laboratoire STL (UMR 8163)] 

 
* Au niveau des auteurs

[http://framespa.univ-tlse2.fr/actualites/pratique/annuaire/debax-helene-24329.kjsp?RH=annuaire_framespa Annuaire du Framespa (UMR 5136)] 
[http://clle.univ-tlse2.fr/accueil/actualites/annuaire/fabre-cecile-29294.kjsp?RH=Annuaire_CLLE2 Annuaire du CLLE (UMR 5263)] 
[http://artehis.u-bourgogne.fr/annuaire/124-annuaire/membres-titulaires/200-bully-sebastien.html Annuaire Artehis (UMR 6298)] 
[https://tagc.univ-amu.fr/en/users/rihet-pascal Liste des publications de Pascal Rihet (HAL/Drupal dev. par AMU)] 
[https://pro.univ-lille.fr/fabienne-blaise/publications/#descr Liste de publications de Fabienne BLAISE (UMR 8163)] 
[http://iramis.cea.fr/Pisp/thibault.charpentier/ Page personnelle de Thibault CHARPENTIER (Iramis)]

Exemples de sites intégrant un flux provenant de HAL

2023-01-27T12:46:39Z

Mlarrieu : retrait des sites non fonctionnels. Ajout entre parenthèse de l'outil utilisé quand il est connu. Répartition en deux niveaux laboratoire & auteurs

* Au niveau des laboratoires (UMR, UAR, UR ...)

[https://www.ipgp.fr/en/research/publications/ Publications de l'IPGP ] 
[https://lce.univ-amu.fr/docs/2019/_1 Laboratoire LCE (Addon Drupal AMU)] 
[http://www.uvsq.fr/laboratoire-des-sciences-du-climat-et-de-l-environnement-lsce-umr-8212-cnrs-cea-uvsq--10461.kjsp Les pages laboratoires du site de l'UVSQ (HalTools)] 
[https://www.pacte-grenoble.fr/publications Laboratoire Pacte (UMR 5194)] 
[http://aau.archi.fr/laboratoire-aau/publications/?type=OUV Laboratoire ambiances architectures urbanités (UMR 1563)] 
[http://eda.recherche.parisdescartes.fr/publications2-eda-sur-hal-shs/ Laboratoire EDA (HalTools)] 
[http://iramis.cea.fr/nimbe/Phocea/Vie_des_labos/Ast/ast_groupe.php?id_groupe=448&voir=publis Laboratoire LSDRM (haltools)] 
[https://stl.univ-lille.fr/productions-scientifiques/les-publications Laboratoire STL (UMR 8163)] 

 
* Au niveau des auteurs

[http://framespa.univ-tlse2.fr/actualites/pratique/annuaire/debax-helene-24329.kjsp?RH=annuaire_framespa Annuaire du Framespa (UMR 5136)] 
[http://clle.univ-tlse2.fr/accueil/actualites/annuaire/fabre-cecile-29294.kjsp?RH=Annuaire_CLLE2 Annuaire du CLLE (UMR 5263)] 
[http://artehis.u-bourgogne.fr/annuaire/124-annuaire/membres-titulaires/200-bully-sebastien.html Annuaire Artehis (UMR 6298)] 
[https://tagc.univ-amu.fr/en/users/rihet-pascal Liste des publications de Pascal Rihet (HAL/Drupal dev. par AMU])]
[https://pro.univ-lille.fr/fabienne-blaise/publications/#descr Liste de publications de Fabienne BLAISE (UMR 8163)] 
[http://iramis.cea.fr/Pisp/thibault.charpentier/ Page personnelle de Thibault CHARPENTIER (Iramis)]

Politiques des établissements pour la Science Ouverte

2022-06-03T14:45:55Z

Mlarrieu :

Politiques des établissements pour la Science Ouverte

2022-03-05T15:30:01Z

Mlarrieu :

* ENPC, 2018-10, [https://espacechercheurs.enpc.fr/fr/plan-science-ouverte Le Plan Science Ouverte de l’École des Ponts ParisTech]
* CNRS, 2018-11, [https://www.science-ouverte.cnrs.fr/ Feuille de route pour la Science Ouverte]
* SU, 2019-03, [https://hal.sorbonne-universite.fr/page/charte-de-sorbonne-universite Charte de Sorbonne Université pour le libre accès aux publications]
* UT2J, 2019-07, [https://blogs.univ-tlse2.fr/vie-etablissement/pour-une-science-ouverte/ Charte de l'université Toulouse Jean-Jaurès pour une Science Ouverte]
* IFSTTAR, 2019-11, [https://www.ifsttar.fr/ressources-en-ligne/lactualite-ifsttar/toute-lactualite/fil-info/article/un-vade-mecum-pour-une-recherche-ouverte-a-la-societe/ Pour une Recherche Ouverte à la société, le Vade-mecum de l'Ifsttar]
* UC2A, 2020-01, [https://alambic.hypotheses.org/6985 Feuille de route pour la Science Ouverte de Université Clermont Auvergne]
* AgroParisTech, 2020-01, [http://www2.agroparistech.fr/Science-ouverte-4495.html Politique science ouverte]
* UT3, 2020-07 [http://www.curif.org/fr/la-curif-sengage-pour-la-science-ouverte/ Membre de la Coordination des universités de recherche intensive françaises (CURIF)]
* Université Claude Bernard Lyon 1, 2021-02, [https://www.univ-lyon1.fr/actualites/lettre-de-mission-de-la-referente-science-ouverte-pour-lucbl Lettre de mission de la référente Science Ouverte pour Lyon 1]
* UMR Ambiances Architectures Urbanités, 2021-02 [https://aau.archi.fr/laboratoire-aau/engagement-science-ouverte/ Engagement pour la Science ouverte]
* Institut Pasteur, 2021-05, [https://research.pasteur.fr/fr/open-science/ Politique de science ouverte pour les publications et les données]
* Université de Paris, 2022-02, [https://u-paris.fr/science-ouverte/feuille-de-route/ Feuille de route pour la Science Ouverte]

Politiques des établissements pour la Science Ouverte

2022-03-05T15:29:30Z

Mlarrieu :

* ENPC, 2018-10, [https://espacechercheurs.enpc.fr/fr/plan-science-ouverte Le Plan Science Ouverte de l’École des Ponts ParisTech]
* CNRS, 2018-11, [https://www.science-ouverte.cnrs.fr/ Feuille de route pour la Science Ouverte]
* SU, 2019-03, [https://hal.sorbonne-universite.fr/page/charte-de-sorbonne-universite Charte de Sorbonne Université pour le libre accès aux publications]
* UT2J, 2019-07, [https://blogs.univ-tlse2.fr/vie-etablissement/pour-une-science-ouverte/ Charte de l'université Toulouse Jean-Jaurès pour une Science Ouverte]
* IFSTTAR, 2019-11, [https://www.ifsttar.fr/ressources-en-ligne/lactualite-ifsttar/toute-lactualite/fil-info/article/un-vade-mecum-pour-une-recherche-ouverte-a-la-societe/ Pour une Recherche Ouverte à la société, le Vade-mecum de l'Ifsttar]
* UC2A, 2020-01, [https://alambic.hypotheses.org/6985 Feuille de route pour la Science Ouverte de Université Clermont Auvergne]
* AgroParisTech, 2020-01, [http://www2.agroparistech.fr/Science-ouverte-4495.html Politique science ouverte]
* UT3, 2020-07 [http://www.curif.org/fr/la-curif-sengage-pour-la-science-ouverte/ Membre de la Coordination des universités de recherche intensive françaises (CURIF)]
* Université Claude Bernard Lyon 1, 2021-02, [https://www.univ-lyon1.fr/actualites/lettre-de-mission-de-la-referente-science-ouverte-pour-lucbl Lettre de mission de la référente Science Ouverte pour Lyon 1]
* UMR Ambiances Architectures Urbanités, 2021-02 [https://aau.archi.fr/laboratoire-aau/engagement-science-ouverte/ Engagement pour la Science ouverte]
* Institut Pasteur, 2021-05, [https://research.pasteur.fr/fr/open-science/ Politique de science ouverte pour les publications et les données]
* Université de Paris, 2022-02, [https://u-paris.fr/science-ouverte/feuille-de-route/ Feuille de route]

Outils et services développés localement pour améliorer ou faciliter l'utilisation de HAL

2021-03-28T13:16:13Z

Mlarrieu :

Cette page recense des outils et services développés localement pour améliorer et/ou faciliter l’utilisation de [http://hal.archives-ouvertes.fr/ HAL] :
== Outils facilitant le dépôt des publications dans HAL ==

* '''[http://perso.ens-lyon.fr/martin.verot/HAL.php mHALoDOI]''' : une petite série de scripts (javascript) pour vérifier qu'une liste de DOI a bien des notices correspondantes déposées dans HAL avec la bonne affiliation. Plutôt qu'un outil unique avec beaucoup de paramètres, l'accent a été mis sur le fait d'avoir des étapes les plus simples possibles : récupérer les DOI puis chercher les publications sur HAL. Il y a également une option pour vérifier si [http://perso.ens-lyon.fr/martin.verot/DOI_orcid.php des publications ORCID sont sur HAL] ou [http://perso.ens-lyon.fr/martin.verot/HAL_findDOI.php trouver des DOI à partir d'une liste de titres].
:- Un tutoriel vidéo pour expliquer comment utiliser les scripts : https://www.youtube.com/watch?v=_3gjglWNoj8&list=PL_rdrSitJev4QqAUM25x3Nguw8UuBJeOG

* '''X2HAL''' : application web qui permet de déposer un lot de publications dans HAL à partir d’un fichier TEI ou BibTeX. Pour l’utiliser, il suffit d'avoir un compte personnel HAL. L'outil vous facilite le dépôt : en proposant les affiliations des auteurs à partir de celles existant dans HAL, en complétant certaines métadonnées manquantes avec des valeurs par défaut (Ex: x-audience, abstract, ...), en complétant certaines métadonnées manquantes à partir des référentiels. Documentation (Bib2HAL) : https://hal.archives-ouvertes.fr/section/imports-bib2hal Lien : https://x2hal.inria.fr/ (accès via compte personnel HAL)

* '''Bib2HAL et Zotero''' : certains établissements utilisent Bib2HAL couplé à [[Zotero]] pour l'alimentation rétrospective de leurs collections HAL : Zotero permet de construire des collections de documents (par labo, année, type) ; chacune de ces collections est ensuite exportée en format BibTeX, rapidement retravaillée (par exemple avec [http://assessmentlibrarian.fr/?p=2079 ce script]), puis importée dans HAL via Bib2HAL, outil qui facilite notamment le repérage des affiliations.

* '''[http://aigle.sf.net AIGLe]''' : Application web collaborative destinée à faciliter les tâches administratives et à valoriser le travail des chercheurs dans les laboratoires, AIGLe permet, entre autre, la gestion des publications. Une base locale contenant l'ensemble des publications des chercheurs du laboratoire est synchronisée avec HAL via les WebServices. Depuis l'interface, l'auteur peut importer des notices bibliographiques depuis PubMed, ArXiv, WoS, HAL puis après modifications éventuelles et toujours depuis l'interface de AIGLe, les "pousser" sur HAL. Il peut exporter dans de nombreux formats (Bibtex, RTF, Word ...). AIGLe peut informer les auteurs (et/ou les gestionnaires) de l'existence de notices trouvées sur WoS mais qui ne sont ni dans sa base ni sur HAL et les aider à en faire l'importation. AIGLe aide les gestionnaires de publications à détecter les doublons présents sur HAL, les erreurs d'orthographe sur les noms ou prénoms d'auteurs, les erreurs d'affectations etc ... '''AIGLe est compatible avec HAL V3''' depuis sa version 5.0.1

* '''OverHAL''' : version modifiée du programme CouvertureHAL, adaptée par Olivier Troccaz et Laurent Jonchère (Université de Rennes 1). OverHAL permet de comparer HAL et des listes de publications (WoS, Scopus, Zotero, Pubmed, etc.). Objectifs : identifier les publications absentes de HAL, créer un fichier TEI adapté à X2HAL, générer des emails de demande de post-prints aux auteurs correspondants.
:- Exemple d'application (Univ. de Rennes 1) : [https://halur1.univ-rennes1.fr/OverHAL.php https://halur1.univ-rennes1.fr/OverHAL.php]
:- Manuel d'utilisation(PDF) : [https://halur1.univ-rennes1.fr/Manuel-OverHAL.pdf https://halur1.univ-rennes1.fr/Manuel-OverHAL.pdf]
:- Présentation OverHAL mailing (PDF) : [https://halur1.univ-rennes1.fr/OverHAL-mailing.pdf Présentation CasuHAL mars 2019]
:- Plateformes utilisées pour la "veille post-print" (PDF) : [https://halur1.univ-rennes1.fr/OverHAL-liste-plateformes-editeurs.pdf Liste des plateformes éditeurs]
:- Télécharger le fichier et la procédure d'installation (format compressé) : [https://halur1.univ-rennes1.fr/OverHAL.7z https://halur1.univ-rennes1.fr/OverHAL.7z]

* '''HAL imports''' : permet d'importer automatiquement dans HAL les métadonnées des publications Scopus, puis d'envoyer aux auteurs des mails les incitant à ajouter le texte intégral de leur article, conformément à la loi pour une république numérique. Voir code python et documentation : [https://github.com/ml4rrieu/HAL_imports github.com/ml4rrieu/HAL_imports]

== Services et outils basés sur une réutilisation des dépôts HAL ==
=== Pages web dynamiques alimentées par les dépôts HAL ===
Il existe plusieurs outils plus ou moins élaborés permettant d’alimenter automatiquement la page web « publications » d’un laboratoire ou d’une équipe de recherche, à partir des dépôts dans HAL :
* [https://haltools.archives-ouvertes.fr/ HALtools] : outil développé par Inria qui permet de créer une page web de publications associée à un auteur, une équipe, un labo, une collection, un projet ... Solution iframe ou PHP adaptée à tous les CMS. Documentation : https://iww.inria.fr/hal/aide/spip.php%3Frubrique59&lang=fr.html
* Université Grenoble Alpes : Utiliser le service "Créer sa page web" pour intégrer proprement le résultat dans un site web via un plugin ou module adapté au CMS utilisé. Disponible pour Drupal, SPIP, Joomla, TYPO3. En projet, un module pour le CMS KSup. Documentés sur GitHub: https://github.com/Saga-UGA
* LOMA UMR CNRS 5798 : page web de la collection HAL intégrée dans la page du site web de l’unité au moyen d’une iframe. Lien : https://www.loma.cnrs.fr/production-scientifique/
* L’Université de Rennes 1 propose un service similaire, avec des fonctionnalités supplémentaires : moteur de recherche intégré, affichage et export des données au format bibliographique (CSV, RTF), pagination (10 références par page), demande de tiré à part (reprint request), mode affichage labo ou chercheur. Le service fonctionne à partir d’un script PHP mis au point par Olivier Troccaz, ingénieur informaticien à l'OSUR. Exemple : https://micmac.univ-rennes1.fr/nos-publications - Script PHP : télécharger la [https://halur1.univ-rennes1.fr/Publis-HAL-SCD.7z dernière version du script] Pensez à bien modifier les paramètres serveur - Télécharger la [https://halur1.univ-rennes1.fr/Publis-HAL-SCD - Liste des paramètres du script PHP HALv3.doc liste des champs] pour intégration de l'URL dans un iframe Pour tout renseignement, contacter [http://annuaire.univ-rennes1.fr/cvv.asp?nom=Jonchere&prenom=Laurent Laurent Jonchère]
* [http://aigle.sf.net AIGLe] : Application web collaborative destinée à faciliter les tâches administratives, AIGLe permet, entre autre, la '''valorisation''' des publications. Une base locale alimentée localement mais également automatiquement depuis HAL et contenant l'ensemble des publications des chercheurs du laboratoire est synchronisée avec HAL via les WebServices. AIGLe est fourni avec un plugin SPIP, un plugin FastBoil, un composant Joomla, une solution Iframe et un site Web minimaliste. Ces outils permettant d'afficher, dans presque n'importe quelle configuration de site web, la liste des publications produites par les auteurs du laboratoire, les pages web professionnelles des chercheurs incluant la liste de leur publications, les prochains séminaires/colloquiums, les congrès/workshops, un annuaire, un trombinoscope etc... AIGLe utilise MathJax pour le rendu des titres et des résumés de publication.
* [http://spirhal.murloc.fr/ SpirHAL] : Le connecteur SpirHAL (dispnible en open source) permet d’afficher automatiquement et de manière dynamique les documents d’un chercheur déposés sur HAL (avec texte intégral) directement sur sa page individuelle sur le site web du laboratoire et en affichant le style bibliographique utilisé par le laboratoire. L’interface d’administration [http://spirhal.univ-tlse2.fr spirhal.univ-tlse2.fr] permet également au chercheur de vérifier la complétude des métadonnées de ses dépôts dans HAL. [https://clle.univ-tlse2.fr/accueil/navigation/actualites/annuaire/lydia-mai-ho-dac--53145.kjsp?RH=1538405075995#/ Exemple]. (contact : Françoise Gouzi, Université Toulouse - Jean Jaurès, projet développé par Fabien Amarger, [https://framagit.org/Murloc6/Spirhal documentation]). [https://www.univ-tlse2.fr/accueil/navigation/recherche/information-scientifique-et-technique/groupe-de-travail-science-ouverte-gtso-ut2j-519621.kjsp?RH=1370426903643 En savoir plus].
* [https://doc.archives-ouvertes.fr/afficher-une-liste-de-publications-dans-wordpress/ Plugin HAL dans le CMS WordPress] : permet d’afficher les publications (d’un auteur, d’une structure de recherche, d’un projet ANR ou européen, d’une collection) dans une page WordPress.
:- Soit en ajoutant un widget pour afficher les dernières publications,
:- Soit en créant une page wordpress.

=== Visualisation d'informations extraites de HAL ===
* [https://github.com/anHALytics AnHALytics] est une plateforme d'analyse de contenu des publications de HAL (moissonage, extraction des métadonnées du texte intégral, analyse sémantique de contenu, normalisation des entités de la recherche : auteurs, affiliations et publications) : [http://traces1.saclay.inria.fr/anHALytics/search/ démo].
* [http://igm.univ-mlv.fr/~gambette/ExtractionHAL/InternationHAL.php InternationHAL] est une page web de visualisation des collaborations internationales, sous forme d'une liste des institutions internationales, rassemblées par pays, qui apparaissent comme affiliations dans une collection donnée selon la base de données de HAL.

=== Extraction et mise en forme des publications ===
* '''ExtractionHAL''' (contact : Philippe Gambette, HAL_UPEMLV@univ-mlv.fr) : Extraction et mise en forme des publications (Université Paris-Est Marne-La-Vallée). La version actuelle, basée sur l'API HAL, a été utilisée par une unité de recherche UPEM (MSME) pour récupérer un bilan bibliographique mis en forme de sa production scientifique : [http://igm.univ-mlv.fr/~gambette/ExtractionHAL/ExtractionHAL.php?team=MSME http://igm.univ-mlv.fr/~gambette/ExtractionHAL/ExtractionHAL.php?team=MSME] (il est possible de remplacer le "MSME" final par le code d'une autre collection). Elle se présente sous forme d'un fichier PHP qui est donc modifiable pour adapter la mise en forme. Evolutions prévues : soulignement des auteurs en fonction de leur affiliation.
* '''ExtrHAL''' : version modifiée du programme créé par Philippe Gambette (voir entrée précédente), adaptée par Olivier Troccaz et Laurent Jonchère (Université de Rennes 1). L'outil propose un choix très large de types de documents (articles, ouvrages, etc.), ainsi qu'un menu permettant de personnaliser la liste. Export des données en RTF, CSV ou Bibtex. Pour tout renseignement, contacter [https://www.univ-rennes1.fr/interlocuteurs/laurent-jonchere Laurent Jonchère]
:- Exemple d'application (Univ. de Rennes 1) : [https://halur1.univ-rennes1.fr/ExtrHAL.php https://halur1.univ-rennes1.fr/ExtrHAL.php]
:- Télécharger le '''fichier d'installation''' (format compressé) : [https://halur1.univ-rennes1.fr/ExtrHAL.7z https://halur1.univ-rennes1.fr/ExtrHAL.7z]. Voir procédure d'installation sur la page ExtrHAL.
* '''[http://aigle.sf.net AIGLe]''' : Application web collaborative destinée à faciliter les tâches administratives, [http://aigle.sf.net AIGLe] permet, entre autre, la gestion des publications. Une base locale alimentée localement mais également automatiquement depuis HAL et contenant l'ensemble des publications des chercheurs du laboratoire est synchronisées avec HAL via les WebServices. Les utilisateurs peuvent exporter des listes de publications choisies selon de multiples critères et dans divers formats (BibTex, Harvard RTF, Word, HTML etc ...).
* '''HALLO''' : HALLO est un programme PERL multi-plateforme développé par Yannick Parmentier, enseignant-chercheur à l’université d’Orléans. Il permet (i) d'extraire de HAL une liste de publications au format bibtex à partir d'un fichier texte contenant une (ou plusieurs) requête(s) et (ii) de convertir cette liste dans divers formats (e.g. html) au moyen de l'outil JabRef (intégré). HALLO fournit ainsi une alternative en ligne de commande à l'interface web d'interrogation de HAL.
:- Un exemple de page produite par HALLO est disponible à l'adresse suivante : [http://www.univ-orleans.fr/lifo/publications.php http://www.univ-orleans.fr/lifo/publications.php.]
:- Pour plus d'informations : [http://www.univ-orleans.fr/lifo/membres/Yannick.Parmentier/hallo.html http://www.univ-orleans.fr/lifo/membres/Yannick.Parmentier/hallo.html.]
* '''Widget d'export/téléchargement du CV HAL''' : à télécharger [http://igm.univ-mlv.fr/~gambette/ExtractionHAL/WidgetCvHAL.txt ici], et à insérer comme widget personnalisé dans le CV HAL, explications en début de fichier.

=== Contrôle bibliographique des collections HAL ===
* '''OCdHAL''' (Outil de Contrôle des données de HAL) : logiciel de contrôle des données d’une collection HAL, créé par Patricia Reynier (CNRS) et Pascal Bellemain (CNRS), au laboratoire GIPSA-lab. L'application permet de consulter, modifier et synchroniser l'ensemble des articles d'une collection HAL, présentés sous la forme d'un tableau dans lequel les articles s'affichent en ligne et leurs métadonnées en colonnes. L'application est interfacée avec HAL via les protocoles Solr et SWORD. Pour plus d'information ou pour obtenir le manuel d'utilisation contacter patricia.reynier[at]gipsa-lab.grenoble-inp.fr. Pour installer le logiciel, il faut compléter un CLUF (Contrat de Licence de l'Utilisateur Final). Le manuel d'utilisation est téléchargeable une fois l'application installée. OCdHAL est aussi disponible en tant qu'application Web, selon les mêmes conditions. En savoir plus : http://www.gipsa-lab.grenoble-inp.fr/valorisation/logiciels.php?id_valorisation=123 

* '''[http://aigle.sf.net AIGLe]''' : Application web collaborative destinée à faciliter les tâches administratives, [http://aigle.sf.net AIGLe] permet, entre autre, la valorisation des publications. Une base locale de publications (artilces et notices biblio) est synchronisée avec HAL via les WebServices. Lors des dépôts ou des synchronisations, [http://aigle.sf.net AIGLe] est capable de détecter les doublons sur HAL, les erreurs d'orthographes sur les noms ou les prénoms des auteurs du laboratoire, les erreurs d'affectation, de vérifier la conformité des codes DOI, [http://aigle.sf.net AIGLe] aide également le déposant à prendre connaissance des règles de publications édictées par l'éditeur de sa publication. Tous les auteurs du laboratoire peuvent éditer et modifier leurs publications sans avoir de compte sur HAL, les modifications étant automatiquement exportées sur HAL (en asynchrone en cas de problème sur les serveurs HAL).

* '''[http://igm.univ-mlv.fr/~gambette/ExtractionHAL/JournHAL.php JournHAL]''' : pour toute recherche d'une revue, affichage de statistiques à propos de l'audience (nationale ou internationale) de cette revue, en fonction des dépôts dans HAL d'articles de cette revue.

== Autres outils ==
* '''[https://marprod.in2p3.fr/limbra_cppm LIMBRA : LIstes et Métriques BibliogRaphiques Automatisées]''' (CPPM - Centre de Physique des Particules de Marseille )

Outil de bibliométrie pour la création de listes et le comptage des publications, afin d’obtenir un état actualisé de la production scientifique du laboratoire.
C'est une application web écrite en python et javascript. Elle utilise le framework web2py, la librairie javascript Ext JS pour l'interface utilisateur et MathJax pour le rendu des équations. La base de données interne est constituée par moissonnage des métadonnées (bases bibliographiques du [https://cds.cern.ch/ CERN] et [https://inspirehep.net/ Inspire HEP]) et par saisie manuelle. C'est une application générique qui pourrait être utilisée par d'autres institutions. Actuellement elle est en cours de développement dans les laboratoires de l'IN2P3.
'''[http://www.cppm.in2p3.fr CPPM / CNRS — Aix-Marseille Université]''' / contact : [[doc@cppm.in2p3.fr]]

* '''[http://ipag.osug.fr/ IPAG]''' (Institut de Planétologie et d’Astrophysique de Grenoble) : base de données des publications du laboratoire, alimentée par moissonnage de bases externes, dont les références peuvent être validées, corrigées et enrichies par les auteurs eux-mêmes : http://publi-ipag.osug.fr. La base a été conçue pour faciliter la production des rapports et alimenter la [http://ipag.osug.fr/spip.php?page=publi_ipag_short page web « publications »] de l’unité. Il est prévu d’adapter l’outil pour compléter le référencement bibliographique de la collection HAL du laboratoire : http://hal-insu.archives-ouvertes.fr/IPAG

* '''Publesia''' (LESIA - Laboratoire d'études spatiales et d'instrumentation en astrophysique, département de l'Observatoire de Paris) : outil de contrôle de publications, permettant le recensement des publications de l'Observatoire de Paris par les publiants eux-mêmes. L’objectif est de simplifier la saisie par les chercheurs, avec aide à la gestion des affiliations (imports depuis fichiers BibTex et bases bibliographiques : ADS, WOS, HAL…). L’application propose une fonctionnalité d’export des données pour les rapports (RTF), les publiants (BibTeX, EndNote), l’analyse (CSV). Les développements à venir porteront sur l'export vers HAL des notices, du texte intégral (HAL v3). Ce logiciel a été développé au sein du LESIA par Florence Henry et des développements ont été réalisés en partenariat avec l'ESPCI afin de l'étendre à l'ensemble des départements de l'Observatoire de Paris et à l'ESPCI. F. Henry déposera les sources sur [http://sourcesup.renater.fr/ Renater] quand les développements en cours seront jugés suffisants. Affichage des publications via Publesia : http://www.lesia.obspm.fr/-Catalogue-Publesia-.html

* '''CouvertureHAL''' : Outil de comparaison automatique de listes de publication Scopus et HAL. Les données de Scopus sont générées à partir de l'outil d'export de Scopus, et les données de HAL proviennent d'une requête pour l'[https://api.archives-ouvertes.fr/docs API HAL] fournie par l'utilisateur. L'objectif est d'obtenir la liste des résultats de Scopus absents de HAL, pour inciter les chercheurs auteurs de ces publications à les déposer dans HAL. Programmé en PHP et disponible sous licence libre GPL : http://igm.univ-mlv.fr/~gambette/ExtractionHAL/CouvertureHAL/.

* '''StructurHAL''' (École des Ponts - Direction de la Documentation) : Macro VBA Excel pour requêter toutes les structures parentes ou filles d'une structure initiale dans AuréHAL, et visualiser leur arborescence dans draw.io. Les structures AuréHAL sont souvent doublonnées ou mal enrichies et les liens entre elles désordonnés. L'objectif est de permettre de les visualiser pour pouvoir les nettoyer, par exemple pour favoriser l'affiliation correcte des auteurs sur quelques structures validées.
:- Disponible sur GitHub : https://github.com/RomBoistel/structurHAL

* '''Qualité Référentiel Structure ''' : Un dashboard pour travailler sur la qualité du référentiel structure de son institution. Toutes les structures filles non valides de l'institution sont récupérées, et pour chacune de celles-ci est extrait le nombre de doc associé et la date de mise à jour. Objectif : éliminer toutes les structures non valides d'une institution : gain de visibilité pour les laboratoires, faciliter l'ajout des affiliations lors du dépôt dans Hal pour les auteurs de son institution. https://github.com/ml4rrieu/AureHalStructQual

Outils et services développés localement pour améliorer ou faciliter l'utilisation de HAL

2021-02-03T09:38:27Z

Mlarrieu :

Cette page recense des outils et services développés localement pour améliorer et/ou faciliter l’utilisation de [http://hal.archives-ouvertes.fr/ HAL] :
== Outils facilitant le dépôt des publications dans HAL ==

* '''[http://perso.ens-lyon.fr/martin.verot/HAL.php mHALoDOI]''' : une petite série de scripts (javascript) pour vérifier qu'une liste de DOI a bien des notices correspondantes déposées dans HAL avec la bonne affiliation. Plutôt qu'un outil unique avec beaucoup de paramètres, l'accent a été mis sur le fait d'avoir des étapes les plus simples possibles : récupérer les DOI puis chercher les publications sur HAL. Il y a également une option pour vérifier si [http://perso.ens-lyon.fr/martin.verot/DOI_orcid.php des publications ORCID sont sur HAL] ou [http://perso.ens-lyon.fr/martin.verot/HAL_findDOI.php trouver des DOI à partir d'une liste de titres].
:- Un tutoriel vidéo pour expliquer comment utiliser les scripts : https://www.youtube.com/watch?v=_3gjglWNoj8&list=PL_rdrSitJev4QqAUM25x3Nguw8UuBJeOG

* '''X2HAL''' : application web qui permet de déposer un lot de publications dans HAL à partir d’un fichier TEI ou BibTeX. Pour l’utiliser, il suffit d'avoir un compte personnel HAL. L'outil vous facilite le dépôt : en proposant les affiliations des auteurs à partir de celles existant dans HAL, en complétant certaines métadonnées manquantes avec des valeurs par défaut (Ex: x-audience, abstract, ...), en complétant certaines métadonnées manquantes à partir des référentiels. Documentation (Bib2HAL) : https://hal.archives-ouvertes.fr/section/imports-bib2hal Lien : https://x2hal.inria.fr/ (accès via compte personnel HAL)

* '''Bib2HAL et Zotero''' : certains établissements utilisent Bib2HAL couplé à [[Zotero]] pour l'alimentation rétrospective de leurs collections HAL : Zotero permet de construire des collections de documents (par labo, année, type) ; chacune de ces collections est ensuite exportée en format BibTeX, rapidement retravaillée (par exemple avec [http://assessmentlibrarian.fr/?p=2079 ce script]), puis importée dans HAL via Bib2HAL, outil qui facilite notamment le repérage des affiliations.

* '''[http://aigle.sf.net AIGLe]''' : Application web collaborative destinée à faciliter les tâches administratives et à valoriser le travail des chercheurs dans les laboratoires, AIGLe permet, entre autre, la gestion des publications. Une base locale contenant l'ensemble des publications des chercheurs du laboratoire est synchronisée avec HAL via les WebServices. Depuis l'interface, l'auteur peut importer des notices bibliographiques depuis PubMed, ArXiv, WoS, HAL puis après modifications éventuelles et toujours depuis l'interface de AIGLe, les "pousser" sur HAL. Il peut exporter dans de nombreux formats (Bibtex, RTF, Word ...). AIGLe peut informer les auteurs (et/ou les gestionnaires) de l'existence de notices trouvées sur WoS mais qui ne sont ni dans sa base ni sur HAL et les aider à en faire l'importation. AIGLe aide les gestionnaires de publications à détecter les doublons présents sur HAL, les erreurs d'orthographe sur les noms ou prénoms d'auteurs, les erreurs d'affectations etc ... '''AIGLe est compatible avec HAL V3''' depuis sa version 5.0.1

* '''OverHAL''' : version modifiée du programme CouvertureHAL, adaptée par Olivier Troccaz et Laurent Jonchère (Université de Rennes 1). OverHAL permet de comparer HAL et des listes de publications (WoS, Scopus, Zotero, Pubmed, etc.). Objectifs : identifier les publications absentes de HAL, créer un fichier TEI adapté à X2HAL, générer des emails de demande de post-prints aux auteurs correspondants.
:- Exemple d'application (Univ. de Rennes 1) : [https://halur1.univ-rennes1.fr/OverHAL.php https://halur1.univ-rennes1.fr/OverHAL.php]
:- Manuel d'utilisation(PDF) : [https://halur1.univ-rennes1.fr/Manuel-OverHAL.pdf https://halur1.univ-rennes1.fr/Manuel-OverHAL.pdf]
:- Présentation OverHAL mailing (PDF) : [https://halur1.univ-rennes1.fr/OverHAL-mailing.pdf Présentation CasuHAL mars 2019]
:- Plateformes utilisées pour la "veille post-print" (PDF) : [https://halur1.univ-rennes1.fr/OverHAL-liste-plateformes-editeurs.pdf Liste des plateformes éditeurs]
:- Télécharger le fichier et la procédure d'installation (format compressé) : [https://halur1.univ-rennes1.fr/OverHAL.7z https://halur1.univ-rennes1.fr/OverHAL.7z]

* '''HAL imports auto''' : code python réalisé en 2020 par Maxence Larrieu. L'objectif est de faire du mailing aux auteurs de son établissement afin qu'ils déposent dans HAL, conformément à la loi pour une république numérique, le PDF de leurs récentes publications. Les publications sont extraites depuis Scopus ; le code verse les métadonnées automatiquement ; les documentalistes ajoutent, pour les publications sans accès ouvert, l'email d'un auteur ; le code envoi ensuite les emails qui contiennent le lien de la notice HAL créée et un rappel de leur droit. L'état d'accès ouvert des publications est obtenu avec Unpaywall.
:- Code et méthode : [https://github.com/ml4rrieu/HAL_imports github.com/ml4rrieu/HAL_imports]

== Services et outils basés sur une réutilisation des dépôts HAL ==
=== Pages web dynamiques alimentées par les dépôts HAL ===
Il existe plusieurs outils plus ou moins élaborés permettant d’alimenter automatiquement la page web « publications » d’un laboratoire ou d’une équipe de recherche, à partir des dépôts dans HAL :
* [https://haltools.archives-ouvertes.fr/ HALtools] : outil développé par Inria qui permet de créer une page web de publications associée à un auteur, une équipe, un labo, une collection, un projet ... Solution iframe ou PHP adaptée à tous les CMS. Documentation : https://iww.inria.fr/hal/aide/spip.php%3Frubrique59&lang=fr.html
* Université Grenoble Alpes : Utiliser le service "Créer sa page web" pour intégrer proprement le résultat dans un site web via un plugin ou module adapté au CMS utilisé. Disponible pour Drupal, SPIP, Joomla, TYPO3. En projet, un module pour le CMS KSup. Documentés sur GitHub: https://github.com/Saga-UGA
* LOMA UMR CNRS 5798 : page web de la collection HAL intégrée dans la page du site web de l’unité au moyen d’une iframe. Lien : https://www.loma.cnrs.fr/production-scientifique/
* L’Université de Rennes 1 propose un service similaire, avec des fonctionnalités supplémentaires : moteur de recherche intégré, affichage et export des données au format bibliographique (CSV, RTF), pagination (10 références par page), demande de tiré à part (reprint request), mode affichage labo ou chercheur. Le service fonctionne à partir d’un script PHP mis au point par Olivier Troccaz, ingénieur informaticien à l'OSUR. Exemple : https://micmac.univ-rennes1.fr/nos-publications - Script PHP : télécharger la [https://halur1.univ-rennes1.fr/Publis-HAL-SCD.7z dernière version du script] Pensez à bien modifier les paramètres serveur - Télécharger la [https://halur1.univ-rennes1.fr/Publis-HAL-SCD - Liste des paramètres du script PHP HALv3.doc liste des champs] pour intégration de l'URL dans un iframe Pour tout renseignement, contacter [http://annuaire.univ-rennes1.fr/cvv.asp?nom=Jonchere&prenom=Laurent Laurent Jonchère]
* [http://aigle.sf.net AIGLe] : Application web collaborative destinée à faciliter les tâches administratives, AIGLe permet, entre autre, la '''valorisation''' des publications. Une base locale alimentée localement mais également automatiquement depuis HAL et contenant l'ensemble des publications des chercheurs du laboratoire est synchronisée avec HAL via les WebServices. AIGLe est fourni avec un plugin SPIP, un plugin FastBoil, un composant Joomla, une solution Iframe et un site Web minimaliste. Ces outils permettant d'afficher, dans presque n'importe quelle configuration de site web, la liste des publications produites par les auteurs du laboratoire, les pages web professionnelles des chercheurs incluant la liste de leur publications, les prochains séminaires/colloquiums, les congrès/workshops, un annuaire, un trombinoscope etc... AIGLe utilise MathJax pour le rendu des titres et des résumés de publication.
* [http://spirhal.murloc.fr/ SpirHAL] : Le connecteur SpirHAL (dispnible en open source) permet d’afficher automatiquement et de manière dynamique les documents d’un chercheur déposés sur HAL (avec texte intégral) directement sur sa page individuelle sur le site web du laboratoire et en affichant le style bibliographique utilisé par le laboratoire. L’interface d’administration [http://spirhal.univ-tlse2.fr spirhal.univ-tlse2.fr] permet également au chercheur de vérifier la complétude des métadonnées de ses dépôts dans HAL. [https://clle.univ-tlse2.fr/accueil/navigation/actualites/annuaire/lydia-mai-ho-dac--53145.kjsp?RH=1538405075995#/ Exemple]. (contact : Françoise Gouzi, Université Toulouse - Jean Jaurès, projet développé par Fabien Amarger, [https://framagit.org/Murloc6/Spirhal documentation]). [https://www.univ-tlse2.fr/accueil/navigation/recherche/information-scientifique-et-technique/groupe-de-travail-science-ouverte-gtso-ut2j-519621.kjsp?RH=1370426903643 En savoir plus].
* [https://doc.archives-ouvertes.fr/afficher-une-liste-de-publications-dans-wordpress/ Plugin HAL dans le CMS WordPress] : permet d’afficher les publications (d’un auteur, d’une structure de recherche, d’un projet ANR ou européen, d’une collection) dans une page WordPress.
:- Soit en ajoutant un widget pour afficher les dernières publications,
:- Soit en créant une page wordpress.

=== Visualisation d'informations extraites de HAL ===
* [https://github.com/anHALytics AnHALytics] est une plateforme d'analyse de contenu des publications de HAL (moissonage, extraction des métadonnées du texte intégral, analyse sémantique de contenu, normalisation des entités de la recherche : auteurs, affiliations et publications) : [http://traces1.saclay.inria.fr/anHALytics/search/ démo].
* [http://igm.univ-mlv.fr/~gambette/ExtractionHAL/InternationHAL.php InternationHAL] est une page web de visualisation des collaborations internationales, sous forme d'une liste des institutions internationales, rassemblées par pays, qui apparaissent comme affiliations dans une collection donnée selon la base de données de HAL.

=== Extraction et mise en forme des publications ===
* '''ExtractionHAL''' (contact : Philippe Gambette, HAL_UPEMLV@univ-mlv.fr) : Extraction et mise en forme des publications (Université Paris-Est Marne-La-Vallée). La version actuelle, basée sur l'API HAL, a été utilisée par une unité de recherche UPEM (MSME) pour récupérer un bilan bibliographique mis en forme de sa production scientifique : [http://igm.univ-mlv.fr/~gambette/ExtractionHAL/ExtractionHAL.php?team=MSME http://igm.univ-mlv.fr/~gambette/ExtractionHAL/ExtractionHAL.php?team=MSME] (il est possible de remplacer le "MSME" final par le code d'une autre collection). Elle se présente sous forme d'un fichier PHP qui est donc modifiable pour adapter la mise en forme. Evolutions prévues : soulignement des auteurs en fonction de leur affiliation.
* '''ExtrHAL''' : version modifiée du programme créé par Philippe Gambette (voir entrée précédente), adaptée par Olivier Troccaz et Laurent Jonchère (Université de Rennes 1). L'outil propose un choix très large de types de documents (articles, ouvrages, etc.), ainsi qu'un menu permettant de personnaliser la liste. Export des données en RTF, CSV ou Bibtex. Pour tout renseignement, contacter [https://www.univ-rennes1.fr/interlocuteurs/laurent-jonchere Laurent Jonchère]
:- Exemple d'application (Univ. de Rennes 1) : [https://halur1.univ-rennes1.fr/ExtrHAL.php https://halur1.univ-rennes1.fr/ExtrHAL.php]
:- Télécharger le '''fichier d'installation''' (format compressé) : [https://halur1.univ-rennes1.fr/ExtrHAL.7z https://halur1.univ-rennes1.fr/ExtrHAL.7z]. Voir procédure d'installation sur la page ExtrHAL.
* '''[http://aigle.sf.net AIGLe]''' : Application web collaborative destinée à faciliter les tâches administratives, [http://aigle.sf.net AIGLe] permet, entre autre, la gestion des publications. Une base locale alimentée localement mais également automatiquement depuis HAL et contenant l'ensemble des publications des chercheurs du laboratoire est synchronisées avec HAL via les WebServices. Les utilisateurs peuvent exporter des listes de publications choisies selon de multiples critères et dans divers formats (BibTex, Harvard RTF, Word, HTML etc ...).
* '''HALLO''' : HALLO est un programme PERL multi-plateforme développé par Yannick Parmentier, enseignant-chercheur à l’université d’Orléans. Il permet (i) d'extraire de HAL une liste de publications au format bibtex à partir d'un fichier texte contenant une (ou plusieurs) requête(s) et (ii) de convertir cette liste dans divers formats (e.g. html) au moyen de l'outil JabRef (intégré). HALLO fournit ainsi une alternative en ligne de commande à l'interface web d'interrogation de HAL.
:- Un exemple de page produite par HALLO est disponible à l'adresse suivante : [http://www.univ-orleans.fr/lifo/publications.php http://www.univ-orleans.fr/lifo/publications.php.]
:- Pour plus d'informations : [http://www.univ-orleans.fr/lifo/membres/Yannick.Parmentier/hallo.html http://www.univ-orleans.fr/lifo/membres/Yannick.Parmentier/hallo.html.]
* '''Widget d'export/téléchargement du CV HAL''' : à télécharger [http://igm.univ-mlv.fr/~gambette/ExtractionHAL/WidgetCvHAL.txt ici], et à insérer comme widget personnalisé dans le CV HAL, explications en début de fichier.

=== Contrôle bibliographique des collections HAL ===
* '''OCdHAL''' (Outil de Contrôle des données de HAL) : logiciel de contrôle des données d’une collection HAL, créé par Patricia Reynier (CNRS) et Pascal Bellemain (CNRS), au laboratoire GIPSA-lab. L'application permet de consulter, modifier et synchroniser l'ensemble des articles d'une collection HAL, présentés sous la forme d'un tableau dans lequel les articles s'affichent en ligne et leurs métadonnées en colonnes. L'application est interfacée avec HAL via les protocoles Solr et SWORD. Pour plus d'information ou pour obtenir le manuel d'utilisation contacter patricia.reynier[at]gipsa-lab.grenoble-inp.fr. Pour installer le logiciel, il faut compléter un CLUF (Contrat de Licence de l'Utilisateur Final). Le manuel d'utilisation est téléchargeable une fois l'application installée. OCdHAL est aussi disponible en tant qu'application Web, selon les mêmes conditions. En savoir plus : http://www.gipsa-lab.grenoble-inp.fr/valorisation/logiciels.php?id_valorisation=123 

* '''[http://aigle.sf.net AIGLe]''' : Application web collaborative destinée à faciliter les tâches administratives, [http://aigle.sf.net AIGLe] permet, entre autre, la valorisation des publications. Une base locale de publications (artilces et notices biblio) est synchronisée avec HAL via les WebServices. Lors des dépôts ou des synchronisations, [http://aigle.sf.net AIGLe] est capable de détecter les doublons sur HAL, les erreurs d'orthographes sur les noms ou les prénoms des auteurs du laboratoire, les erreurs d'affectation, de vérifier la conformité des codes DOI, [http://aigle.sf.net AIGLe] aide également le déposant à prendre connaissance des règles de publications édictées par l'éditeur de sa publication. Tous les auteurs du laboratoire peuvent éditer et modifier leurs publications sans avoir de compte sur HAL, les modifications étant automatiquement exportées sur HAL (en asynchrone en cas de problème sur les serveurs HAL).

* '''[http://igm.univ-mlv.fr/~gambette/ExtractionHAL/JournHAL.php JournHAL]''' : pour toute recherche d'une revue, affichage de statistiques à propos de l'audience (nationale ou internationale) de cette revue, en fonction des dépôts dans HAL d'articles de cette revue.

== Autres outils ==
* '''[https://marprod.in2p3.fr/limbra_cppm LIMBRA : LIstes et Métriques BibliogRaphiques Automatisées]''' (CPPM - Centre de Physique des Particules de Marseille )

Outil de bibliométrie pour la création de listes et le comptage des publications, afin d’obtenir un état actualisé de la production scientifique du laboratoire.
C'est une application web écrite en python et javascript. Elle utilise le framework web2py, la librairie javascript Ext JS pour l'interface utilisateur et MathJax pour le rendu des équations. La base de données interne est constituée par moissonnage des métadonnées (bases bibliographiques du [https://cds.cern.ch/ CERN] et [https://inspirehep.net/ Inspire HEP]) et par saisie manuelle. C'est une application générique qui pourrait être utilisée par d'autres institutions. Actuellement elle est en cours de développement dans les laboratoires de l'IN2P3.
'''[http://www.cppm.in2p3.fr CPPM / CNRS — Aix-Marseille Université]''' / contact : [[doc@cppm.in2p3.fr]]

* '''[http://ipag.osug.fr/ IPAG]''' (Institut de Planétologie et d’Astrophysique de Grenoble) : base de données des publications du laboratoire, alimentée par moissonnage de bases externes, dont les références peuvent être validées, corrigées et enrichies par les auteurs eux-mêmes : http://publi-ipag.osug.fr. La base a été conçue pour faciliter la production des rapports et alimenter la [http://ipag.osug.fr/spip.php?page=publi_ipag_short page web « publications »] de l’unité. Il est prévu d’adapter l’outil pour compléter le référencement bibliographique de la collection HAL du laboratoire : http://hal-insu.archives-ouvertes.fr/IPAG

* '''Publesia''' (LESIA - Laboratoire d'études spatiales et d'instrumentation en astrophysique, département de l'Observatoire de Paris) : outil de contrôle de publications, permettant le recensement des publications de l'Observatoire de Paris par les publiants eux-mêmes. L’objectif est de simplifier la saisie par les chercheurs, avec aide à la gestion des affiliations (imports depuis fichiers BibTex et bases bibliographiques : ADS, WOS, HAL…). L’application propose une fonctionnalité d’export des données pour les rapports (RTF), les publiants (BibTeX, EndNote), l’analyse (CSV). Les développements à venir porteront sur l'export vers HAL des notices, du texte intégral (HAL v3). Ce logiciel a été développé au sein du LESIA par Florence Henry et des développements ont été réalisés en partenariat avec l'ESPCI afin de l'étendre à l'ensemble des départements de l'Observatoire de Paris et à l'ESPCI. F. Henry déposera les sources sur [http://sourcesup.renater.fr/ Renater] quand les développements en cours seront jugés suffisants. Affichage des publications via Publesia : http://www.lesia.obspm.fr/-Catalogue-Publesia-.html

* '''CouvertureHAL''' : Outil de comparaison automatique de listes de publication Scopus et HAL. Les données de Scopus sont générées à partir de l'outil d'export de Scopus, et les données de HAL proviennent d'une requête pour l'[https://api.archives-ouvertes.fr/docs API HAL] fournie par l'utilisateur. L'objectif est d'obtenir la liste des résultats de Scopus absents de HAL, pour inciter les chercheurs auteurs de ces publications à les déposer dans HAL. Programmé en PHP et disponible sous licence libre GPL : http://igm.univ-mlv.fr/~gambette/ExtractionHAL/CouvertureHAL/.

* '''StructurHAL''' (École des Ponts - Direction de la Documentation) : Macro VBA Excel pour requêter toutes les structures parentes ou filles d'une structure initiale dans AuréHAL, et visualiser leur arborescence dans draw.io. Les structures AuréHAL sont souvent doublonnées ou mal enrichies et les liens entre elles désordonnés. L'objectif est de permettre de les visualiser pour pouvoir les nettoyer, par exemple pour favoriser l'affiliation correcte des auteurs sur quelques structures validées.
:- Disponible sur GitHub : https://github.com/RomBoistel/structurHAL

* '''Qualité Référentiel Structure ''' : Un dashboard pour travailler sur la qualité du référentiel structure de son institution. Toutes les structures filles non valides de l'institution sont récupérées, et pour chacune de celles-ci est extrait le nombre de doc associé et la date de mise à jour. Objectif : éliminer toutes les structures non valides d'une institution : gain de visibilité pour les laboratoires, faciliter l'ajout des affiliations lors du dépôt dans Hal pour les auteurs de son institution. https://github.com/ml4rrieu/AureHalStructQual

SWORD

2021-02-01T21:55:23Z

Mlarrieu :

==API Sword==

===Définition===

Sword est un protocole de dialogue

[https://en.wikipedia.org/wiki/SWORD_%28protocol%29 Sword] Simple Web-service Offering Repository Deposit

L'API de dépôt SWORD permet l'import automatique de documents dans l'archive ouverte HAL

===Import Sword sur HAL===

Documentation:
*[http://api.archives-ouvertes.fr/docs/sword Import sword : documentation du CCSD]
*[https://api.archives-ouvertes.fr/documents/all.xml Format XML complet avec documentation intégrée]
*[https://github.com/CCSDForge/HAL/tree/master/Sword Documentation technique et des exemples pour chaque type de document sous github]
*[http://aramis.resinfo.org/wiki/lib/exe/fetch.php?media=ateliers:aramis-hal-v3-le-format-tei_25_02_2015.pdf Description du format TEI pour l'import sword (pdf)]
*[http://aramis.resinfo.org/wiki/lib/exe/fetch.php?media=ateliers:aramis-hal-v3-import-sword_25_02_2015.pdf Description de l'import sword via curl (pdf)]

=== Notes ===
* L'ajout d'un ISBN si le doctype est une communication (COMM) engendre une erreur (2020 06)

Outils et services développés localement pour améliorer ou faciliter l'utilisation de HAL

2021-01-07T07:54:12Z

Mlarrieu :

Cette page recense des outils et services développés localement pour améliorer et/ou faciliter l’utilisation de [http://hal.archives-ouvertes.fr/ HAL] :
== Outils facilitant le dépôt des publications dans HAL ==

* '''[http://perso.ens-lyon.fr/martin.verot/HAL.php mHALoDOI]''' : une petite série de scripts (javascript) pour vérifier qu'une liste de DOI a bien des notices correspondantes déposées dans HAL avec la bonne affiliation. Plutôt qu'un outil unique avec beaucoup de paramètres, l'accent a été mis sur le fait d'avoir des étapes les plus simples possibles : récupérer les DOI puis chercher les publications sur HAL. Il y a également une option pour vérifier si [http://perso.ens-lyon.fr/martin.verot/DOI_orcid.php des publications ORCID sont sur HAL] ou [http://perso.ens-lyon.fr/martin.verot/HAL_findDOI.php trouver des DOI à partir d'une liste de titres].
:- Un tutoriel vidéo pour expliquer comment utiliser les scripts : https://www.youtube.com/watch?v=_3gjglWNoj8&list=PL_rdrSitJev4QqAUM25x3Nguw8UuBJeOG

* '''X2HAL''' : application web qui permet de déposer un lot de publications dans HAL à partir d’un fichier TEI ou BibTeX. Pour l’utiliser, il suffit d'avoir un compte personnel HAL. L'outil vous facilite le dépôt : en proposant les affiliations des auteurs à partir de celles existant dans HAL, en complétant certaines métadonnées manquantes avec des valeurs par défaut (Ex: x-audience, abstract, ...), en complétant certaines métadonnées manquantes à partir des référentiels. Documentation (Bib2HAL) : https://hal.archives-ouvertes.fr/section/imports-bib2hal Lien : https://x2hal.inria.fr/ (accès via compte personnel HAL)

* '''Bib2HAL et Zotero''' : certains établissements utilisent Bib2HAL couplé à [[Zotero]] pour l'alimentation rétrospective de leurs collections HAL : Zotero permet de construire des collections de documents (par labo, année, type) ; chacune de ces collections est ensuite exportée en format BibTeX, rapidement retravaillée (par exemple avec [http://assessmentlibrarian.fr/?p=2079 ce script]), puis importée dans HAL via Bib2HAL, outil qui facilite notamment le repérage des affiliations.

* '''[http://aigle.sf.net AIGLe]''' : Application web collaborative destinée à faciliter les tâches administratives et à valoriser le travail des chercheurs dans les laboratoires, AIGLe permet, entre autre, la gestion des publications. Une base locale contenant l'ensemble des publications des chercheurs du laboratoire est synchronisée avec HAL via les WebServices. Depuis l'interface, l'auteur peut importer des notices bibliographiques depuis PubMed, ArXiv, WoS, HAL puis après modifications éventuelles et toujours depuis l'interface de AIGLe, les "pousser" sur HAL. Il peut exporter dans de nombreux formats (Bibtex, RTF, Word ...). AIGLe peut informer les auteurs (et/ou les gestionnaires) de l'existence de notices trouvées sur WoS mais qui ne sont ni dans sa base ni sur HAL et les aider à en faire l'importation. AIGLe aide les gestionnaires de publications à détecter les doublons présents sur HAL, les erreurs d'orthographe sur les noms ou prénoms d'auteurs, les erreurs d'affectations etc ... '''AIGLe est compatible avec HAL V3''' depuis sa version 5.0.1

* '''OverHAL''' : version modifiée du programme CouvertureHAL, adaptée par Olivier Troccaz et Laurent Jonchère (Université de Rennes 1). OverHAL permet de comparer HAL et des listes de publications (WoS, Scopus, Zotero, Pubmed, etc.). Objectifs : identifier les publications absentes de HAL, créer un fichier TEI adapté à X2HAL, générer des emails de demande de post-prints aux auteurs correspondants.
:- Exemple d'application (Univ. de Rennes 1) : [https://halur1.univ-rennes1.fr/OverHAL.php https://halur1.univ-rennes1.fr/OverHAL.php]
:- Manuel d'utilisation(PDF) : [https://halur1.univ-rennes1.fr/Manuel-OverHAL.pdf https://halur1.univ-rennes1.fr/Manuel-OverHAL.pdf]
:- Présentation OverHAL mailing (PDF) : [https://halur1.univ-rennes1.fr/OverHAL-mailing.pdf Présentation CasuHAL mars 2019]
:- Plateformes utilisées pour la "veille post-print" (PDF) : [https://halur1.univ-rennes1.fr/OverHAL-liste-plateformes-editeurs.pdf Liste des plateformes éditeurs]
:- Télécharger le fichier et la procédure d'installation (format compressé) : [https://halur1.univ-rennes1.fr/OverHAL.7z https://halur1.univ-rennes1.fr/OverHAL.7z]

== Services et outils basés sur une réutilisation des dépôts HAL ==
=== Pages web dynamiques alimentées par les dépôts HAL ===
Il existe plusieurs outils plus ou moins élaborés permettant d’alimenter automatiquement la page web « publications » d’un laboratoire ou d’une équipe de recherche, à partir des dépôts dans HAL :
* [https://haltools.archives-ouvertes.fr/ HALtools] : outil développé par Inria qui permet de créer une page web de publications associée à un auteur, une équipe, un labo, une collection, un projet ... Solution iframe ou PHP adaptée à tous les CMS. Documentation : https://iww.inria.fr/hal/aide/spip.php%3Frubrique59&lang=fr.html
* Université Grenoble Alpes : Utiliser le service "Créer sa page web" pour intégrer proprement le résultat dans un site web via un plugin ou module adapté au CMS utilisé. Disponible pour Drupal, SPIP, Joomla, TYPO3. En projet, un module pour le CMS KSup. Documentés sur GitHub: https://github.com/Saga-UGA
* LOMA UMR CNRS 5798 : page web de la collection HAL intégrée dans la page du site web de l’unité au moyen d’une iframe. Lien : https://www.loma.cnrs.fr/production-scientifique/
* L’Université de Rennes 1 propose un service similaire, avec des fonctionnalités supplémentaires : moteur de recherche intégré, affichage et export des données au format bibliographique (CSV, RTF), pagination (10 références par page), demande de tiré à part (reprint request), mode affichage labo ou chercheur. Le service fonctionne à partir d’un script PHP mis au point par Olivier Troccaz, ingénieur informaticien à l'OSUR. Exemple : https://micmac.univ-rennes1.fr/nos-publications - Script PHP : télécharger la [https://halur1.univ-rennes1.fr/Publis-HAL-SCD.7z dernière version du script] Pensez à bien modifier les paramètres serveur - Télécharger la [https://halur1.univ-rennes1.fr/Publis-HAL-SCD - Liste des paramètres du script PHP HALv3.doc liste des champs] pour intégration de l'URL dans un iframe Pour tout renseignement, contacter [http://annuaire.univ-rennes1.fr/cvv.asp?nom=Jonchere&prenom=Laurent Laurent Jonchère]
* [http://aigle.sf.net AIGLe] : Application web collaborative destinée à faciliter les tâches administratives, AIGLe permet, entre autre, la '''valorisation''' des publications. Une base locale alimentée localement mais également automatiquement depuis HAL et contenant l'ensemble des publications des chercheurs du laboratoire est synchronisée avec HAL via les WebServices. AIGLe est fourni avec un plugin SPIP, un plugin FastBoil, un composant Joomla, une solution Iframe et un site Web minimaliste. Ces outils permettant d'afficher, dans presque n'importe quelle configuration de site web, la liste des publications produites par les auteurs du laboratoire, les pages web professionnelles des chercheurs incluant la liste de leur publications, les prochains séminaires/colloquiums, les congrès/workshops, un annuaire, un trombinoscope etc... AIGLe utilise MathJax pour le rendu des titres et des résumés de publication.
* [http://spirhal.murloc.fr/ SpirHAL] : Le connecteur SpirHAL (dispnible en open source) permet d’afficher automatiquement et de manière dynamique les documents d’un chercheur déposés sur HAL (avec texte intégral) directement sur sa page individuelle sur le site web du laboratoire et en affichant le style bibliographique utilisé par le laboratoire. L’interface d’administration [http://spirhal.univ-tlse2.fr spirhal.univ-tlse2.fr] permet également au chercheur de vérifier la complétude des métadonnées de ses dépôts dans HAL. [https://clle.univ-tlse2.fr/accueil/navigation/actualites/annuaire/lydia-mai-ho-dac--53145.kjsp?RH=1538405075995#/ Exemple]. (contact : Françoise Gouzi, Université Toulouse - Jean Jaurès, projet développé par Fabien Amarger, [https://framagit.org/Murloc6/Spirhal documentation]). [https://www.univ-tlse2.fr/accueil/navigation/recherche/information-scientifique-et-technique/groupe-de-travail-science-ouverte-gtso-ut2j-519621.kjsp?RH=1370426903643 En savoir plus].
* [https://doc.archives-ouvertes.fr/afficher-une-liste-de-publications-dans-wordpress/ Plugin HAL dans le CMS WordPress] : permet d’afficher les publications (d’un auteur, d’une structure de recherche, d’un projet ANR ou européen, d’une collection) dans une page WordPress.
:- Soit en ajoutant un widget pour afficher les dernières publications,
:- Soit en créant une page wordpress.

=== Visualisation d'informations extraites de HAL ===
* [https://github.com/anHALytics AnHALytics] est une plateforme d'analyse de contenu des publications de HAL (moissonage, extraction des métadonnées du texte intégral, analyse sémantique de contenu, normalisation des entités de la recherche : auteurs, affiliations et publications) : [http://traces1.saclay.inria.fr/anHALytics/search/ démo].
* [http://igm.univ-mlv.fr/~gambette/ExtractionHAL/InternationHAL.php InternationHAL] est une page web de visualisation des collaborations internationales, sous forme d'une liste des institutions internationales, rassemblées par pays, qui apparaissent comme affiliations dans une collection donnée selon la base de données de HAL.

=== Extraction et mise en forme des publications ===
* '''ExtractionHAL''' (contact : Philippe Gambette, HAL_UPEMLV@univ-mlv.fr) : Extraction et mise en forme des publications (Université Paris-Est Marne-La-Vallée). La version actuelle, basée sur l'API HAL, a été utilisée par une unité de recherche UPEM (MSME) pour récupérer un bilan bibliographique mis en forme de sa production scientifique : [http://igm.univ-mlv.fr/~gambette/ExtractionHAL/ExtractionHAL.php?team=MSME http://igm.univ-mlv.fr/~gambette/ExtractionHAL/ExtractionHAL.php?team=MSME] (il est possible de remplacer le "MSME" final par le code d'une autre collection). Elle se présente sous forme d'un fichier PHP qui est donc modifiable pour adapter la mise en forme. Evolutions prévues : soulignement des auteurs en fonction de leur affiliation.
* '''ExtrHAL''' : version modifiée du programme créé par Philippe Gambette (voir entrée précédente), adaptée par Olivier Troccaz et Laurent Jonchère (Université de Rennes 1). L'outil propose un choix très large de types de documents (articles, ouvrages, etc.), ainsi qu'un menu permettant de personnaliser la liste. Export des données en RTF, CSV ou Bibtex. Pour utiliser l'outil dans votre établissement, installez le fichier PHP sur votre serveur et appelez le dans une page web (https://nomduserveur/ExtractionHAL.php).
:- Exemple d'application (Univ. de Rennes 1) : [https://halur1.univ-rennes1.fr/ExtractionHAL.php https://halur1.univ-rennes1.fr/ExtractionHAL.php]
:- Télécharger le '''fichier d'installation''' (format compressé) : [https://halur1.univ-rennes1.fr/ExtrHAL.7z https://halur1.univ-rennes1.fr/ExtrHAL.7z]
:- Procédure d'installation (fichier PDF) : [https://halur1.univ-rennes1.fr/installation/Installer-ExtrHAL.pdf https://halur1.univ-rennes1.fr/installation/Installer-ExtrHAL.pdf]
: Pour ajouter les fonctionnalités de soulignement des auteurs et d'affichage des rangs HCERES et CNRS, il faut créer un fichier php pour chaque liste. A titre d'exemple, voici les fichiers créés par Rennes 1 :
:- Revues HCERES en économie-gestion : [https://halur1.univ-rennes1.fr/installation/ExtractionHAL-rang-AERES-SHS.php https://halur1.univ-rennes1.fr/installation/ExtractionHAL-rang-AERES-SHS.php]
:- Revues CNRS en économie-gestion : [https://halur1.univ-rennes1.fr/installation/ExtractionHAL-rang-CNRS.php https://halur1.univ-rennes1.fr/installation/ExtractionHAL-rang-CNRS.php] Pour tout renseignement, contacter [https://www.univ-rennes1.fr/interlocuteurs/laurent-jonchere Laurent Jonchère]
* '''[http://aigle.sf.net AIGLe]''' : Application web collaborative destinée à faciliter les tâches administratives, [http://aigle.sf.net AIGLe] permet, entre autre, la gestion des publications. Une base locale alimentée localement mais également automatiquement depuis HAL et contenant l'ensemble des publications des chercheurs du laboratoire est synchronisées avec HAL via les WebServices. Les utilisateurs peuvent exporter des listes de publications choisies selon de multiples critères et dans divers formats (BibTex, Harvard RTF, Word, HTML etc ...).
* '''HALLO''' : HALLO est un programme PERL multi-plateforme développé par Yannick Parmentier, enseignant-chercheur à l’université d’Orléans. Il permet (i) d'extraire de HAL une liste de publications au format bibtex à partir d'un fichier texte contenant une (ou plusieurs) requête(s) et (ii) de convertir cette liste dans divers formats (e.g. html) au moyen de l'outil JabRef (intégré). HALLO fournit ainsi une alternative en ligne de commande à l'interface web d'interrogation de HAL.
:- Un exemple de page produite par HALLO est disponible à l'adresse suivante : [http://www.univ-orleans.fr/lifo/publications.php http://www.univ-orleans.fr/lifo/publications.php.]
:- Pour plus d'informations : [http://www.univ-orleans.fr/lifo/membres/Yannick.Parmentier/hallo.html http://www.univ-orleans.fr/lifo/membres/Yannick.Parmentier/hallo.html.]
* '''Widget d'export/téléchargement du CV HAL''' : à télécharger [http://igm.univ-mlv.fr/~gambette/ExtractionHAL/WidgetCvHAL.txt ici], et à insérer comme widget personnalisé dans le CV HAL, explications en début de fichier.

=== Contrôle bibliographique des collections HAL ===
* '''OCdHAL''' (Outil de Contrôle des données de HAL) : logiciel de contrôle des données d’une collection HAL, créé par Patricia Reynier (CNRS) et Pascal Bellemain (CNRS), au laboratoire GIPSA-lab. L'application permet de consulter, modifier et synchroniser l'ensemble des articles d'une collection HAL, présentés sous la forme d'un tableau dans lequel les articles s'affichent en ligne et leurs métadonnées en colonnes. L'application est interfacée avec HAL via les protocoles Solr et SWORD. Pour plus d'information ou pour obtenir le manuel d'utilisation contacter patricia.reynier[at]gipsa-lab.grenoble-inp.fr. Pour installer le logiciel, il faut compléter un CLUF (Contrat de Licence de l'Utilisateur Final). Le manuel d'utilisation est téléchargeable une fois l'application installée. OCdHAL est aussi disponible en tant qu'application Web, selon les mêmes conditions. En savoir plus : http://www.gipsa-lab.grenoble-inp.fr/valorisation/logiciels.php?id_valorisation=123 

* '''[http://aigle.sf.net AIGLe]''' : Application web collaborative destinée à faciliter les tâches administratives, [http://aigle.sf.net AIGLe] permet, entre autre, la valorisation des publications. Une base locale de publications (artilces et notices biblio) est synchronisée avec HAL via les WebServices. Lors des dépôts ou des synchronisations, [http://aigle.sf.net AIGLe] est capable de détecter les doublons sur HAL, les erreurs d'orthographes sur les noms ou les prénoms des auteurs du laboratoire, les erreurs d'affectation, de vérifier la conformité des codes DOI, [http://aigle.sf.net AIGLe] aide également le déposant à prendre connaissance des règles de publications édictées par l'éditeur de sa publication. Tous les auteurs du laboratoire peuvent éditer et modifier leurs publications sans avoir de compte sur HAL, les modifications étant automatiquement exportées sur HAL (en asynchrone en cas de problème sur les serveurs HAL).

* '''[http://igm.univ-mlv.fr/~gambette/ExtractionHAL/JournHAL.php JournHAL]''' : pour toute recherche d'une revue, affichage de statistiques à propos de l'audience (nationale ou internationale) de cette revue, en fonction des dépôts dans HAL d'articles de cette revue.

== Autres outils ==
* '''[https://marprod.in2p3.fr/limbra_cppm LIMBRA : LIstes et Métriques BibliogRaphiques Automatisées]''' (CPPM - Centre de Physique des Particules de Marseille )

Outil de bibliométrie pour la création de listes et le comptage des publications, afin d’obtenir un état actualisé de la production scientifique du laboratoire.
C'est une application web écrite en python et javascript. Elle utilise le framework web2py, la librairie javascript Ext JS pour l'interface utilisateur et MathJax pour le rendu des équations. La base de données interne est constituée par moissonnage des métadonnées (bases bibliographiques du [https://cds.cern.ch/ CERN] et [https://inspirehep.net/ Inspire HEP]) et par saisie manuelle. C'est une application générique qui pourrait être utilisée par d'autres institutions. Actuellement elle est en cours de développement dans les laboratoires de l'IN2P3.
'''[http://www.cppm.in2p3.fr CPPM / CNRS — Aix-Marseille Université]''' / contact : [[doc@cppm.in2p3.fr]]

* '''[http://ipag.osug.fr/ IPAG]''' (Institut de Planétologie et d’Astrophysique de Grenoble) : base de données des publications du laboratoire, alimentée par moissonnage de bases externes, dont les références peuvent être validées, corrigées et enrichies par les auteurs eux-mêmes : http://publi-ipag.osug.fr. La base a été conçue pour faciliter la production des rapports et alimenter la [http://ipag.osug.fr/spip.php?page=publi_ipag_short page web « publications »] de l’unité. Il est prévu d’adapter l’outil pour compléter le référencement bibliographique de la collection HAL du laboratoire : http://hal-insu.archives-ouvertes.fr/IPAG

* '''Publesia''' (LESIA - Laboratoire d'études spatiales et d'instrumentation en astrophysique, département de l'Observatoire de Paris) : outil de contrôle de publications, permettant le recensement des publications de l'Observatoire de Paris par les publiants eux-mêmes. L’objectif est de simplifier la saisie par les chercheurs, avec aide à la gestion des affiliations (imports depuis fichiers BibTex et bases bibliographiques : ADS, WOS, HAL…). L’application propose une fonctionnalité d’export des données pour les rapports (RTF), les publiants (BibTeX, EndNote), l’analyse (CSV). Les développements à venir porteront sur l'export vers HAL des notices, du texte intégral (HAL v3). Ce logiciel a été développé au sein du LESIA par Florence Henry et des développements ont été réalisés en partenariat avec l'ESPCI afin de l'étendre à l'ensemble des départements de l'Observatoire de Paris et à l'ESPCI. F. Henry déposera les sources sur [http://sourcesup.renater.fr/ Renater] quand les développements en cours seront jugés suffisants. Affichage des publications via Publesia : http://www.lesia.obspm.fr/-Catalogue-Publesia-.html

* '''CouvertureHAL''' : Outil de comparaison automatique de listes de publication Scopus et HAL. Les données de Scopus sont générées à partir de l'outil d'export de Scopus, et les données de HAL proviennent d'une requête pour l'[https://api.archives-ouvertes.fr/docs API HAL] fournie par l'utilisateur. L'objectif est d'obtenir la liste des résultats de Scopus absents de HAL, pour inciter les chercheurs auteurs de ces publications à les déposer dans HAL. Programmé en PHP et disponible sous licence libre GPL : http://igm.univ-mlv.fr/~gambette/ExtractionHAL/CouvertureHAL/.

* '''StructurHAL''' (École des Ponts - Direction de la Documentation) : Macro VBA Excel pour requêter toutes les structures parentes ou filles d'une structure initiale dans AuréHAL, et visualiser leur arborescence dans draw.io. Les structures AuréHAL sont souvent doublonnées ou mal enrichies et les liens entre elles désordonnés. L'objectif est de permettre de les visualiser pour pouvoir les nettoyer, par exemple pour favoriser l'affiliation correcte des auteurs sur quelques structures validées.
:- Disponible sur GitHub : https://github.com/RomBoistel/structurHAL

* '''Qualité Référentiel Structure ''' : Un dashboard pour travailler sur la qualité du référentiel structure de son institution. Toutes les structures filles non valides de l'institution sont récupérées, et pour chacune de celles-ci est extrait le nombre de doc associé et la date de mise à jour. Objectif : éliminer toutes les structures non valides d'une institution : gain de visibilité pour les laboratoires, faciliter l'ajout des affiliations lors du dépôt dans Hal pour les auteurs de son institution. https://github.com/ml4rrieu/AureHalStructQual

Requêtes sur les ressources de HAL

2020-09-15T08:28:04Z

Mlarrieu : ajout requete pour avoir les doc qui ne sont pas en accès ouvert

=== Remarques générales ===
Les champs retournés par défaut sont docid, label_s et uri_s

Les résultats sont limités à 30 lignes par défaut

Le format de retour par défaut est JSON (installer un visualiseur json dans son navigateur)

Les requêtes ci-dessous sont toutes appliquées à une collection (ou un portail), on peut donc changer cet identifiant pour appliquer la requête à son contexte

== Requêtes simples pour récupérer des listes ==
=== Liste des dépôts d'une institution ou d'un regroupement ===
Dans ce cas on utilise simplement l'identifiant de l'institution. Dans Auréhal le niveau regroupement existe : https://doc.archives-ouvertes.fr/gerer-un-portail/referentiels/structures-de-recherche/.

La configuration du regroupement se fait donc dans Auréhal

Exemple pour le regroupement Comue Paris-Est (https://aurehal.archives-ouvertes.fr/structure/read/id/303512)
<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/?q=structId_i:303512</pre>

=== Liste des documents en accès ouvert d'une structure ===
Documents en accès ouvert : soit le plein texte est dans Hal, soit il est sur le web via unpaywall, soit dans ArXiv soit dans Pubmed
<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/?&wt=xml&fq=structId_i:303512&fq=(submitType_s:file OR linkExtId_s:(openaccess OR arxiv OR pubmedcentral))</pre>

=== Liste des documents qui ne sont pas en accès ouvert d'une structure===
<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/?fq=structId_i:81173&fq=-(submitType_s:file%20OR%20linkExtId_s:(arxiv%20OR%20pubmedcentral%20OR%20openaccess))&fl=uri_s</pre>

=== Export des 50 derniers dépôts faits dans une collection par date de publication descendante ===
le filtre de tri est producedDate_tdate = date de publication
<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/SIC/?q=*:*&rows=50&wt=csv&sort=producedDate_tdate%20desc </pre>

Cette requête rapporte 50 résultats dans un export CSV

Si on fait la requête au format xml on voit le numreponse à 6122 => si on veut tout voir on peut mettre rows=6200.

=== Export des 50 derniers dépôts faits dans une collection par date de dépôt descendante ===
le filtre de tri est submittedDate_s = date de dépôt
<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/SIC/?q=*:*&rows=100&wt=csv&fl=submittedDate_s,producedDate_s,label_s&sort=submittedDate_s%20desc</pre>

=== Flux rss des dépôts faits dans une collection depuis 1 mois ===
Pour avoir la sortie sous la forme d'un flux RSS il faut indiquer wt=rss
<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/hal/?q=collCode_s:UNIV-ORLEANS&fq=releasedDate_tdate:[NOW%2FDAY-1MONTH+TO+NOW%2FDAY%2B1DAY]&fq=&rows=30&sort=submittedDate_tdate+desc&wt=rss</pre>

le champ rows indique le nombre de résultat qu'on souhaite récupérer (30 ici)

=== Flux rss des 3 derniers dépôts avec texte intégral ===
<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/pasteur/?wt=rss&q=*&sort=submittedDate_tdate+desc&fq=producedDate_tdate:[NOW-1YEARS%20TO%20NOW]&fq=submitType_s:file&fq=collCode_s%3APASTEUR&fq=NOT+status_i%3A111&rows=3</pre>

Dans le champ date, on récupère les 12 derniers mois (de moins 1 an à aujourd'hui) et on limite à 3 résultats (rows=3)

=== Liste des thèses d'une institution ===
<pre style="white-space:pre-wrap;">http://api.archives-ouvertes.fr/search/?q=docType_s:THESE%20AND%20authorityInstitution_s:%22Université%20d'Orléans%22&wt=csv&sort=producedDate_s%20desc&rows=2000&fl=halId_s,defenseDate_s,authFullName_s,thesisSchool_s,labStructAcronym_s,instStructAcronym_s,title_s,label_s</pre>

la liste des champs exportés est : halId_s,defenseDate_s,authFullName_s,thesisSchool_s,labStructAcronym_s,instStructAcronym_s,title_s,label_s

changer rows=2000 pour le nombre de réponses

Il faut indiquer le champ "authorityInstitution_s" : trouver le bon intitulé dans https://api.archives-ouvertes.fr/search/?q=*%3A*&rows=0&wt=xml&indent=true&facet=true&facet.field=authorityInstitution_s

== Requêtes sur les collections ==

=== Récupérer la liste des collections rattachées à son institution ===
Il s'agit là de récupérer par l'API la même liste que celle possible sur le portail : https://hal-univ-orleans.archives-ouvertes.fr/browse/scollection
<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/UNIV-ORLEANS/?q=*:*&rows=0&wt=xml&indent=true&facet=true&facet.field=collIsParentOfCategoryColl_fs&facet.prefix=UNIV-ORLEANS</pre>

Cette requête, comme la page du portail, liste les collections pour lesquelles dans leur configuration il a été complété le champ : Identifiant des collections supérieures.

=== Récupérer la liste des collections qui contiennent au moins un dépôt de son institution ===
<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/UNIV-ORLEANS/?q=*%3A*&rows=0&wt=xml&indent=true&facet=true&facet.field=collIsParentOfCategoryColl_fs</pre>

Le champs collIsParentOfCategoryColl_fs contient les données suivantes : Collection parente + _FacetSep_ + type collection parente + _JoinSep_ + Code de la collection + _FacetSep_ + Nom de la collection

== Requêtes d'analyse du contenu par type de documents ==

=== Connaître le cumul des dépôts de sa collection répartis par type de document ===
Requête à facette affichant une collection, le nombre d’occurrence par type de document
<pre style="white-space:pre-wrap;"> https://api.archives-ouvertes.fr/search/?q=*&fq=collCode_s:UNIV-ORLEANS&fq=NOT+status_i%3A111&start=0&rows=0&omitHeader=true&facet.mincount=1&facet.limit=10000&facet=true&facet.field=docType_s&facet.sort=count</pre>

Les cumuls sont calculés depuis 2011.

liste des types de documents dans HAL (41 en tout) : https://api.archives-ouvertes.fr/ref/doctype

=== Connaître le nombre total de dépôt année par année dans sa collection. Et pour chaque année la répartition des dépôts par type de document ===
Requête affichant le nombre de dépôt par année de publication
<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/UNIV-ORLEANS/?q=*:*&wt=xml&rows=0&facet=true&facet.pivot=submittedDateY_i,submitType_s,docType_s</pre>

Pour chaque année l'arbre xml affiche le nombre total de dépôt, puis l’élément pivot détaille le contenu annuel type de document par type de document.

=== Connaître le nombre de dépôt pour une année donnée dans sa collection présenté par type de documents ===

<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/univ-orleans/?q=*:*&rows=0&fq=submittedDateY_i:2019&facet=true&facet.field=docType_s&wt=xml</pre>

=== Méthode pour repérer les types d'articles (extractions HCERES) ===
Article du blog Carnet'IST. Proposition de requêtes sur le site web HAL pour distinguer, entre autres, les 4 types d’articles suivants : ACL; ACLN, ACSL, AV ou TRANSF
http://carnetist.hypotheses.org/240

== Requêtes d'analyse du contenu par domaine ==

=== Connaître le cumul des dépôts de sa collection répartis par domaines ===
Requête affichant le nombre de notice par domaine pour sa collection
<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/UNIV-ORLEANS/?q=%2A&fq=NOT+status_i%3A111&start=0&rows=0&wt=phps&omitHeader=true&facet.mincount=1&facet.limit=10000&facet=true&facet.field=level0_domain_s&facet.sort=count</pre>

Liste des domaines de HAL (393 en mai 2019) : http://api.archives-ouvertes.fr/ref/domain/?q=*:*&rows=400

== Requêtes d'analyse du contenu des revues (journal) ==

=== Connaître le nombre d'articles déposés par titre de revue dans sa collection ===
La requête affiche pour chaque revue le nombre d'articles déposés dans la collection HAL.
<pre style="white-space:pre-wrap;"> https://api.archives-ouvertes.fr/search/?q=*&fq=collCode_s:UNIV-ORLEANS&fq=NOT+status_i%3A111&start=0&rows=0&omitHeader=true&facet.mincount=1&facet.limit=10000&facet=true&facet.field=journalTitle_s&facet.sort=count</pre>
Le cumul est calculé depuis 2011 et ne concerne que le type "articles".

== Requêtes d'analyse de ses structures ==

=== Liste des structures affiliées à une institution et pas à une autre ===
Il s'agit par exemple de récupérer la liste des laboratoires attachés à l'université de Nancy et pas à l'université de Lorraine

<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/ref/structure/?fq=(parentDocid_i:300292%20AND%20NOT(parentDocid_i:413289))&fl=docid,name_s&wt=csv</pre>

Pour cette requêtes il faut récupérer dans Auréhal structure les identifiants des 2 structures à analyser

=== Liste de toutes les structures qui dépendent d'une structure ===
Requête sur le référentiel structure d'Auréhal
<pre style="white-space:pre-wrap;">http://api.archives-ouvertes.fr/ref/structure/?q=parentDocid_i:"74911"&rows=300&fl=name_s,acronym_s,code_s,docid,address_s,url_s,country_s&sort=acronym_s asc </pre>

* parentDocid = 74911 (université d'Angers)
* rows = 300. Permet d'avoir toutes les réponses, dans le résultat le numFound = 279.
* fl=name_s,acronym_s,code_s,docid,address_s,url_s,country_s : liste des champs demandé en réponse
* sort=acronym_s asc : trié par ordre alphabétique de l'acronyme

== Requêtes d'analyse des contributions ==

=== Nombre de dépôt par contributeur dans un portail, classés par année de dépôt ===
Requête à facette affichant par année, la liste des contributeurs déposant et le nombre de dépôt associé à chaque contributeur
<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/univ-orleans/?q=*:*&facet=true&facet.pivot=submittedDateY_i,contributorFullName_s&rows=0&wt=xml&facet.limit=1000</pre>

== Requêtes d'analyse des auteurs ==

=== Liste des auteurs dont une publication au moins est affiliée à une structure avec indication de leur IDHAL ou de l'absence d'IDHAL ===

Requête à facette listant les auteurs affiliés par un ou plusieurs dépôt à une structure
<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/?q=*:*&rows=0&wt=xml&facet=true&facet.query=structHasAuthIdHal_fs&facet.field=structHasAuthIdHal_fs&facet.prefix=129439_FacetSep_&facet.mincount=1&facet.limit=1000</pre>
ou
https://api.archives-ouvertes.fr/search/?q=*:*&rows=0&facet=true&facet.field=structHasAuthIdHal_fs&facet.prefix=226306_&wt=xml

Le champ facet.prefix indique l'identifiant de la structure d'affiliation voulue (à trouver dans Aurehal structure)

https://api.archives-ouvertes.fr/search/?q=*:*&rows=0&facet=true&facet.field=structHasAuthIdHal_fs&facet.prefix=245758_&wt=xml&fq=structId_i:245758

Pour ceux qui ont un idhal la chaine le représentant est entre ''_JoinSep_'' et ''_FacetSep_''

* Exemple avec Idhal : 226306_FacetSep_Maison des Sciences de l'Homme de Dijon''_JoinSep_'''''lsaligny'''''_FacetSep_''Saligny Laure
* Exemple sans Idhal : 226306_FacetSep_Maison des Sciences de l'Homme de Dijon''_JoinSep__FacetSep_''Alazard Céline

=== Nombre de publications scientifiques hors vulgarisation des auteurs d'une collection et d'un laboratoire spécifique par année universitaire de publication (2015-2016) en affichant uniquement les auteurs affiliés au laboratoire demandé et non pas tous les auteurs présents dans la collection ===
Requête indiquant le nombre de publications scientifiques par auteurs affiliés à une structure spécifique (&fq=authStructId_i:54305 et &facet.field=authIdHasPrimaryStructure_fs&facet.contains=_JoinSep_54305_FacetSep), pour une année universitaire donnée (&fq=producedDate_tdate:), hors vulgarisation (&fq=popularLevel_s:0)

<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/UNIV-REUNION/?q=collection_t:LIM&fq=authStructId_i:54305&fq=popularLevel_s:0&fq=producedDate_tdate:[2015-07-31T00:00:00Z TO 2016-07-31T00:00:00Z]&rows=0&indent=true&facet=true&sort=producedDate_tdate%20asc&facet.field=authIdHasPrimaryStructure_fs&facet.contains=_JoinSep_54305_FacetSep&wt=xml</pre>

Détails des paramètres :
* q=collection_t:LIM
* fq=authStructId_i:54305
* fq=popularLevel_s:0
* fq=producedDate_tdate:[2015-07-31T00:00:00Z%20TO%202016-07-31T00:00:00Z]
* rows=0
* indent=true
* &sort=producedDate_tdate%20asc
* facet.field=authIdHasPrimaryStructure_f
* facet.contains=_JoinSep_54305_FacetSep
* wt=xml

=== Liste des auteurs ayant un dépôt ou plusieurs affilié à une structure ayant créé leur CV HAL ===

Attention, la requête est dans le référentiel auteur, donc n'a pas de rapport avec les documents.
De plus structureId_i dans le référentiel auteur est l'organisme payeur - pas du tout la même chose que l'affiliation d'un auteur à une publication.

Requête effectuée dans le référentiel Auréhal Auteurs
<pre style="white-space:pre-wrap;">http://api.archives-ouvertes.fr/ref/author/?q=structureId_i:198056 AND hasCV_bool:true&rows=10000&sort=lastName_s asc&fl=idHal_s,idHal_i,lastName_s,firstName_s</pre>

Il est également possible de faire cette recherche directement sur Auréhal (https://aurehal.archives-ouvertes.fr/author/index) en indiquant dans le champ de recherche les valeurs de la requête : structureId_i:198056 AND hasCV_bool:true

[[File:Hal_requête_CV.png|800px]]

=== Autre solution ===

==== 1. Trouver tous les auteurs affiliés à la structure : ====

https://api.archives-ouvertes.fr/search/?indent=true&facet.field=structHasAuthIdHal_fs&facet.prefix=44429_FacetSep_&facet=on&indent=on&q=*:*&rows=0&wt=json&facet.limit=5000&facet.mincount=1

dans le résultat prendre ceux qui ont un idhal eg
44429_FacetSep_Laboratoire Interdisciplinaire Solidarités, Sociétés, Territoires_JoinSep_michel-grossetti_FacetSep_Grossetti Michel"

==== 2. chercher dans le référentiel auteur ====

pour chaque idhal chercher si l'auteur a un CV :

https://api.archives-ouvertes.fr/ref/author/?wt=xml&q=(idHal_s:michel-grossetti AND hasCV_bool:true)

si il y a 1 résultat: l'auteur a un CV

== Requêtes sur le contrôle qualité du contenu ==
=== Liste des dépôts effectués dans un portail X mais non affiliés à une structure de la collection XX ===
L'objectif est d'avoir les dépôts qui sont passés par un portail mais qui ne sont pas affiliés à une structure relevant de ce portail (des erreurs de dépôt)
<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/amu/?q=structure_t:*%20NOT%20%28%22Universit%C3%A9%20de%20Provence%20-%20Aix-Marseille%20I%22%20OR%20%22Universit%C3%A9%20de%20la%20M%C3%A9diterran%C3%A9e%20-%20Aix-Marseille%20II%22%20OR%20%22Universit%C3%A9%20Paul%20C%C3%A9zanne%20-%20Aix-Marseille%20III%22%20OR%20%22Universit%C3%A9%20de%20Provence%20-%20Aix-Marseille%201%22%20OR%20%20%22Universit%C3%A9%20de%20la%20M%C3%A9diterran%C3%A9e%20-%20Aix-Marseille%202%22%20OR%20%20%22Universit%C3%A9%20Paul%20C%C3%A9zanne%20-%20Aix-Marseille%203%22%20OR%20%22Aix-Marseille%20Universit%C3%A9%20-%20AMU%22%20OR%20%20%22PRES%20Aix%20Marseille%20Universit%C3%A9%22%20OR%20%22Aix%20Marseille%20Universit%C3%A9%22%29&wt=xml&fl=uri_s</pre>

== Requêtes qui restent à créer ou finaliser ==

=== Récupérer la lise de tous les "codes de collection" (soit collCode_s) de type "REVUE" (soit collCategory_s:REVUE) ===
<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/?q=*:*&rows=0&wt=xml&fq=collCategory_s:REVUE&facet=true&facet.field=collCode_s&facet.limit=10000</pre>

<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/?q=(collCategory_s:REVUE%20NOT%20collCategory_s:(SET%20OR%20COLLOQUE%20OR%20ECOLE%20OR%20PRES%20OR%20UNIV%20OR%20LABO%20OR%20THEME%20OR%20INSTITUTION%20OR%20AUTRE))&rows=0&wt=json&facet=true&facet.field=collCode_s&facet.limit=10000&facet.mincount=1&facet.field=collCategory_s</pre>

=== Liste des dépôts par labo d'une université (et uniquement des labos affiliés à l'université), par année de dépôt et par type de document déposé ===
L'objectif est d'avoir les dépôts qui sont passés par un portail mais qui ne sont pas affiliés à une structure relevant de ce portail (des erreurs de dépôt)
<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/</pre>

=== Liste des dépôts pour une plage entre 2 années d'une structure dont les labos sont en statut OLD ===
L'objectif est d'avoir les dépôts qui sont passés par un portail mais qui ne sont pas affiliés à une structure relevant de ce portail (des erreurs de dépôt)
<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/hal/?omitHeader=true&wt=csv&q=*&fq=instStructId_i:300297&fq=labStructValid_s:OLD&fq=producedDateY_i:%5B2000%20TO%202014%5D</pre>

=== Liste des dépôts de texte intégral d'une institution pour une année ===
<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/hal/?omitHeader=true&wt=xml&q=*&fq=instStructId_i:300297&fq=submittedDateY_i:2015&facet=true&facet.mincount=1&facet.pivot.mincount=1&facet.limit=10000&facet.pivot=labStructName_s,submittedDateM_i&rows=0</pre>

=== Liste des identifiants des revues des notices non valides d'une collection ===
<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/hal/?omitHeader=true&wt=xml&q=*&fq=instStructId_i:AAA&fq=submittedDateY_i:BBB&facet=true&facet.mincount=1&facet.pivot.mincount=1&facet.limit=10000&facet.pivot=labStructName_s,submittedDateM_i&rows=0</pre>

=== Liste des identifiants des revues des notices non valides d'une collection ===
<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/3774/?q=*&rows=0&wt=xml&fq=journalValid_s:INCOMING&facet=true&facet.field=journalId_i</pre>

=== Liste, triée par ordre de dépôt décroissante des dépôts, des articles publiées en revue, tamponnés par une collection, avec pour chacun la liste des auteurs, l'année de publication, le nom de la revue, ainsi que toutes les informations de RoMEO/SHERPA à propos de la politique éditoriale de la revue ===
<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/?q=collCode_s:3774%20AND%20docType_s:ART&wt=xml&sort=producedDate_s%20desc&rows=2000&fl=authFullName_s,journalTitle_s,submitType_s,journalSherpaColor_s,journalSherpaCondition_s,journalSherpaDate_s,journalSherpaPostPrint_s,journalSherpaPostRest_s,
journalSherpaPrePrint_s,journalSherpaPreRest_s,producedDateY_i</pre>

=== Liste des publications d'un auteur à partir de son idhal ===
Aller sur le site web du portail : Entrer dans la recherche avancée de HAL la chaîne de caractère de l'idhal de l'auteur / champ IDHAL 
Exporter le résultat (exporte l'ensemble des résultats) : formats d'exports = ceux proposés par HAL

Outils et services développés localement pour améliorer ou faciliter l'utilisation de HAL

2020-09-07T12:18:29Z

Mlarrieu :

Cette page recense des outils et services développés localement pour améliorer et/ou faciliter l’utilisation de [http://hal.archives-ouvertes.fr/ HAL] :
== Outils facilitant le dépôt des publications dans HAL ==

* '''[http://perso.ens-lyon.fr/martin.verot/HAL.php mHALoDOI]''' : une petite série de scripts (javascript) pour vérifier qu'une liste de DOI a bien des notices correspondantes déposées dans HAL avec la bonne affiliation. Plutôt qu'un outil unique avec beaucoup de paramètres, l'accent a été mis sur le fait d'avoir des étapes les plus simples possibles : récupérer les DOI puis chercher les publications sur HAL. Il y a également une option pour vérifier si [http://perso.ens-lyon.fr/martin.verot/DOI_orcid.php des publications ORCID sont sur HAL] ou [http://perso.ens-lyon.fr/martin.verot/HAL_findDOI.php trouver des DOI à partir d'une liste de titres].
:- Un tutoriel vidéo pour expliquer comment utiliser les scripts : https://www.youtube.com/watch?v=_3gjglWNoj8&list=PL_rdrSitJev4QqAUM25x3Nguw8UuBJeOG

* '''X2HAL''' : application web qui permet de déposer un lot de publications dans HAL à partir d’un fichier TEI ou BibTeX. Pour l’utiliser, il suffit d'avoir un compte personnel HAL. L'outil vous facilite le dépôt : en proposant les affiliations des auteurs à partir de celles existant dans HAL, en complétant certaines métadonnées manquantes avec des valeurs par défaut (Ex: x-audience, abstract, ...), en complétant certaines métadonnées manquantes à partir des référentiels. Documentation (Bib2HAL) : https://hal.archives-ouvertes.fr/section/imports-bib2hal Lien : https://x2hal.inria.fr/ (accès via compte personnel HAL)

* '''Bib2HAL et Zotero''' : certains établissements utilisent Bib2HAL couplé à [[Zotero]] pour l'alimentation rétrospective de leurs collections HAL : Zotero permet de construire des collections de documents (par labo, année, type) ; chacune de ces collections est ensuite exportée en format BibTeX, rapidement retravaillée (par exemple avec [http://assessmentlibrarian.fr/?p=2079 ce script]), puis importée dans HAL via Bib2HAL, outil qui facilite notamment le repérage des affiliations.

* '''[http://aigle.sf.net AIGLe]''' : Application web collaborative destinée à faciliter les tâches administratives et à valoriser le travail des chercheurs dans les laboratoires, AIGLe permet, entre autre, la gestion des publications. Une base locale contenant l'ensemble des publications des chercheurs du laboratoire est synchronisée avec HAL via les WebServices. Depuis l'interface, l'auteur peut importer des notices bibliographiques depuis PubMed, ArXiv, WoS, HAL puis après modifications éventuelles et toujours depuis l'interface de AIGLe, les "pousser" sur HAL. Il peut exporter dans de nombreux formats (Bibtex, RTF, Word ...). AIGLe peut informer les auteurs (et/ou les gestionnaires) de l'existence de notices trouvées sur WoS mais qui ne sont ni dans sa base ni sur HAL et les aider à en faire l'importation. AIGLe aide les gestionnaires de publications à détecter les doublons présents sur HAL, les erreurs d'orthographe sur les noms ou prénoms d'auteurs, les erreurs d'affectations etc ... '''AIGLe est compatible avec HAL V3''' depuis sa version 5.0.1

* '''OverHAL''' : version modifiée du programme CouvertureHAL, adaptée par Olivier Troccaz et Laurent Jonchère (Université de Rennes 1). OverHAL permet de comparer HAL et des listes de publications (WoS, Scopus, Zotero, Pubmed, etc.). Objectifs : identifier les publications absentes de HAL, créer un fichier TEI adapté à X2HAL, générer des emails de demande de post-prints aux auteurs correspondants.
:- Exemple d'application (Univ. de Rennes 1) : [https://halur1.univ-rennes1.fr/OverHAL.php https://halur1.univ-rennes1.fr/OverHAL.php]
:- Manuel d'utilisation(PDF) : [https://halur1.univ-rennes1.fr/Manuel-OverHAL.pdf https://halur1.univ-rennes1.fr/Manuel-OverHAL.pdf]
:- Présentation OverHAL mailing (PDF) : [https://halur1.univ-rennes1.fr/OverHAL-mailing.pdf Présentation CasuHAL mars 2019]
:- Plateformes utilisées pour la "veille post-print" (PDF) : [https://halur1.univ-rennes1.fr/OverHAL-liste-plateformes-editeurs.pdf Liste des plateformes éditeurs]
:- Télécharger le fichier et la procédure d'installation (format compressé) : [https://halur1.univ-rennes1.fr/OverHAL.7z https://halur1.univ-rennes1.fr/OverHAL.7z]

== Services et outils basés sur une réutilisation des dépôts HAL ==
=== Pages web dynamiques alimentées par les dépôts HAL ===
Il existe plusieurs outils plus ou moins élaborés permettant d’alimenter automatiquement la page web « publications » d’un laboratoire ou d’une équipe de recherche, à partir des dépôts dans HAL :
* [https://haltools.archives-ouvertes.fr/ HALtools] : outil développé par Inria qui permet de créer une page web de publications associée à un auteur, une équipe, un labo, une collection, un projet ... Solution iframe ou PHP adaptée à tous les CMS. Documentation : https://iww.inria.fr/hal/aide/spip.php%3Frubrique59&lang=fr.html
* Université Grenoble Alpes : Utiliser le service "Créer sa page web" pour intégrer proprement le résultat dans un site web via un plugin ou module adapté au CMS utilisé. Disponible pour Drupal, SPIP, Joomla, TYPO3. En projet, un module pour le CMS KSup. Documentés sur GitHub: https://github.com/Saga-UGA
* LOMA UMR CNRS 5798 : page web de la collection HAL intégrée dans la page du site web de l’unité au moyen d’une iframe. Lien : https://www.loma.cnrs.fr/production-scientifique/
* L’Université de Rennes 1 propose un service similaire, avec des fonctionnalités supplémentaires : moteur de recherche intégré, affichage et export des données au format bibliographique (CSV, RTF), pagination (10 références par page), demande de tiré à part (reprint request), mode affichage labo ou chercheur. Le service fonctionne à partir d’un script PHP mis au point par Olivier Troccaz, ingénieur informaticien à l'OSUR. Exemple : https://micmac.univ-rennes1.fr/nos-publications - Script PHP : télécharger la [https://halur1.univ-rennes1.fr/Publis-HAL-SCD.7z dernière version du script] Pensez à bien modifier les paramètres serveur - Télécharger la [https://halur1.univ-rennes1.fr/Publis-HAL-SCD - Liste des paramètres du script PHP HALv3.doc liste des champs] pour intégration de l'URL dans un iframe Pour tout renseignement, contacter [http://annuaire.univ-rennes1.fr/cvv.asp?nom=Jonchere&prenom=Laurent Laurent Jonchère]
* [http://aigle.sf.net AIGLe] : Application web collaborative destinée à faciliter les tâches administratives, AIGLe permet, entre autre, la '''valorisation''' des publications. Une base locale alimentée localement mais également automatiquement depuis HAL et contenant l'ensemble des publications des chercheurs du laboratoire est synchronisée avec HAL via les WebServices. AIGLe est fourni avec un plugin SPIP, un plugin FastBoil, un composant Joomla, une solution Iframe et un site Web minimaliste. Ces outils permettant d'afficher, dans presque n'importe quelle configuration de site web, la liste des publications produites par les auteurs du laboratoire, les pages web professionnelles des chercheurs incluant la liste de leur publications, les prochains séminaires/colloquiums, les congrès/workshops, un annuaire, un trombinoscope etc... AIGLe utilise MathJax pour le rendu des titres et des résumés de publication.

=== Visualisation d'informations extraites de HAL ===
* [https://github.com/anHALytics AnHALytics] est une plateforme d'analyse de contenu des publications de HAL (moissonage, extraction des métadonnées du texte intégral, analyse sémantique de contenu, normalisation des entités de la recherche : auteurs, affiliations et publications) : [http://traces1.saclay.inria.fr/anHALytics/search/ démo].
* [http://igm.univ-mlv.fr/~gambette/ExtractionHAL/InternationHAL.php InternationHAL] est une page web de visualisation des collaborations internationales, sous forme d'une liste des institutions internationales, rassemblées par pays, qui apparaissent comme affiliations dans une collection donnée selon la base de données de HAL.

=== Extraction et mise en forme des publications ===
* '''ExtractionHAL''' (contact : Philippe Gambette, HAL_UPEMLV@univ-mlv.fr) : Extraction et mise en forme des publications (Université Paris-Est Marne-La-Vallée). La version actuelle, basée sur l'API HAL, a été utilisée par une unité de recherche UPEM (MSME) pour récupérer un bilan bibliographique mis en forme de sa production scientifique : [http://igm.univ-mlv.fr/~gambette/ExtractionHAL/ExtractionHAL.php?team=MSME http://igm.univ-mlv.fr/~gambette/ExtractionHAL/ExtractionHAL.php?team=MSME] (il est possible de remplacer le "MSME" final par le code d'une autre collection). Elle se présente sous forme d'un fichier PHP qui est donc modifiable pour adapter la mise en forme. Evolutions prévues : soulignement des auteurs en fonction de leur affiliation.
* '''ExtrHAL''' : version modifiée du programme créé par Philippe Gambette (voir entrée précédente), adaptée par Olivier Troccaz et Laurent Jonchère (Université de Rennes 1). L'outil propose un choix très large de types de documents (articles, ouvrages, etc.), ainsi qu'un menu permettant de personnaliser la liste. Export des données en RTF, CSV ou Bibtex. Pour utiliser l'outil dans votre établissement, installez le fichier PHP sur votre serveur et appelez le dans une page web (https://nomduserveur/ExtractionHAL.php).
:- Exemple d'application (Univ. de Rennes 1) : [https://halur1.univ-rennes1.fr/ExtractionHAL.php https://halur1.univ-rennes1.fr/ExtractionHAL.php]
:- Télécharger le '''fichier d'installation''' (format compressé) : [https://halur1.univ-rennes1.fr/ExtrHAL.7z https://halur1.univ-rennes1.fr/ExtrHAL.7z]
:- Procédure d'installation (fichier PDF) : [https://halur1.univ-rennes1.fr/installation/Installer-ExtrHAL.pdf https://halur1.univ-rennes1.fr/installation/Installer-ExtrHAL.pdf]
: Pour ajouter les fonctionnalités de soulignement des auteurs et d'affichage des rangs HCERES et CNRS, il faut créer un fichier php pour chaque liste. A titre d'exemple, voici les fichiers créés par Rennes 1 :
:- Revues HCERES en économie-gestion : [https://halur1.univ-rennes1.fr/installation/ExtractionHAL-rang-AERES-SHS.php https://halur1.univ-rennes1.fr/installation/ExtractionHAL-rang-AERES-SHS.php]
:- Revues CNRS en économie-gestion : [https://halur1.univ-rennes1.fr/installation/ExtractionHAL-rang-CNRS.php https://halur1.univ-rennes1.fr/installation/ExtractionHAL-rang-CNRS.php] Pour tout renseignement, contacter [https://www.univ-rennes1.fr/interlocuteurs/laurent-jonchere Laurent Jonchère]
* '''[http://aigle.sf.net AIGLe]''' : Application web collaborative destinée à faciliter les tâches administratives, [http://aigle.sf.net AIGLe] permet, entre autre, la gestion des publications. Une base locale alimentée localement mais également automatiquement depuis HAL et contenant l'ensemble des publications des chercheurs du laboratoire est synchronisées avec HAL via les WebServices. Les utilisateurs peuvent exporter des listes de publications choisies selon de multiples critères et dans divers formats (BibTex, Harvard RTF, Word, HTML etc ...).
* '''HALLO''' : HALLO est un programme PERL multi-plateforme développé par Yannick Parmentier, enseignant-chercheur à l’université d’Orléans. Il permet (i) d'extraire de HAL une liste de publications au format bibtex à partir d'un fichier texte contenant une (ou plusieurs) requête(s) et (ii) de convertir cette liste dans divers formats (e.g. html) au moyen de l'outil JabRef (intégré). HALLO fournit ainsi une alternative en ligne de commande à l'interface web d'interrogation de HAL.
:- Un exemple de page produite par HALLO est disponible à l'adresse suivante : [http://www.univ-orleans.fr/lifo/publications.php http://www.univ-orleans.fr/lifo/publications.php.]
:- Pour plus d'informations : [http://www.univ-orleans.fr/lifo/membres/Yannick.Parmentier/hallo.html http://www.univ-orleans.fr/lifo/membres/Yannick.Parmentier/hallo.html.]
* '''Widget d'export/téléchargement du CV HAL''' : à télécharger [http://igm.univ-mlv.fr/~gambette/ExtractionHAL/WidgetCvHAL.txt ici], et à insérer comme widget personnalisé dans le CV HAL, explications en début de fichier.

=== Contrôle bibliographique des collections HAL ===
* '''OCdHAL''' (Outil de Contrôle des données de HAL) : logiciel de contrôle des données d’une collection HAL, créé par Patricia Reynier (CNRS) et Pascal Bellemain (CNRS), au laboratoire GIPSA-lab. L'application permet de consulter, modifier et synchroniser l'ensemble des articles d'une collection HAL, présentés sous la forme d'un tableau dans lequel les articles s'affichent en ligne et leurs métadonnées en colonnes. L'application est interfacée avec HAL via les protocoles Solr et SWORD. Pour plus d'information ou pour obtenir le manuel d'utilisation contacter patricia.reynier[at]gipsa-lab.grenoble-inp.fr. Pour installer le logiciel, il faut compléter un CLUF (Contrat de Licence de l'Utilisateur Final). Le manuel d'utilisation est téléchargeable une fois l'application installée. OCdHAL est aussi disponible en tant qu'application Web, selon les mêmes conditions. En savoir plus : http://www.gipsa-lab.grenoble-inp.fr/valorisation/logiciels.php?id_valorisation=123 

* '''[http://aigle.sf.net AIGLe]''' : Application web collaborative destinée à faciliter les tâches administratives, [http://aigle.sf.net AIGLe] permet, entre autre, la valorisation des publications. Une base locale de publications (artilces et notices biblio) est synchronisée avec HAL via les WebServices. Lors des dépôts ou des synchronisations, [http://aigle.sf.net AIGLe] est capable de détecter les doublons sur HAL, les erreurs d'orthographes sur les noms ou les prénoms des auteurs du laboratoire, les erreurs d'affectation, de vérifier la conformité des codes DOI, [http://aigle.sf.net AIGLe] aide également le déposant à prendre connaissance des règles de publications édictées par l'éditeur de sa publication. Tous les auteurs du laboratoire peuvent éditer et modifier leurs publications sans avoir de compte sur HAL, les modifications étant automatiquement exportées sur HAL (en asynchrone en cas de problème sur les serveurs HAL).

* '''[http://igm.univ-mlv.fr/~gambette/ExtractionHAL/JournHAL.php JournHAL]''' : pour toute recherche d'une revue, affichage de statistiques à propos de l'audience (nationale ou internationale) de cette revue, en fonction des dépôts dans HAL d'articles de cette revue.

== Autres outils ==
* '''[https://marprod.in2p3.fr/limbra_cppm LIMBRA : LIstes et Métriques BibliogRaphiques Automatisées]''' (CPPM - Centre de Physique des Particules de Marseille )

Outil de bibliométrie pour la création de listes et le comptage des publications, afin d’obtenir un état actualisé de la production scientifique du laboratoire.
C'est une application web écrite en python et javascript. Elle utilise le framework web2py, la librairie javascript Ext JS pour l'interface utilisateur et MathJax pour le rendu des équations. La base de données interne est constituée par moissonnage des métadonnées (bases bibliographiques du [https://cds.cern.ch/ CERN] et [https://inspirehep.net/ Inspire HEP]) et par saisie manuelle. C'est une application générique qui pourrait être utilisée par d'autres institutions. Actuellement elle est en cours de développement dans les laboratoires de l'IN2P3.
'''[http://www.cppm.in2p3.fr CPPM / CNRS — Aix-Marseille Université]''' / contact : [[doc@cppm.in2p3.fr]]

* '''[http://ipag.osug.fr/ IPAG]''' (Institut de Planétologie et d’Astrophysique de Grenoble) : base de données des publications du laboratoire, alimentée par moissonnage de bases externes, dont les références peuvent être validées, corrigées et enrichies par les auteurs eux-mêmes : http://publi-ipag.osug.fr. La base a été conçue pour faciliter la production des rapports et alimenter la [http://ipag.osug.fr/spip.php?page=publi_ipag_short page web « publications »] de l’unité. Il est prévu d’adapter l’outil pour compléter le référencement bibliographique de la collection HAL du laboratoire : http://hal-insu.archives-ouvertes.fr/IPAG

* '''Publesia''' (LESIA - Laboratoire d'études spatiales et d'instrumentation en astrophysique, département de l'Observatoire de Paris) : outil de contrôle de publications, permettant le recensement des publications de l'Observatoire de Paris par les publiants eux-mêmes. L’objectif est de simplifier la saisie par les chercheurs, avec aide à la gestion des affiliations (imports depuis fichiers BibTex et bases bibliographiques : ADS, WOS, HAL…). L’application propose une fonctionnalité d’export des données pour les rapports (RTF), les publiants (BibTeX, EndNote), l’analyse (CSV). Les développements à venir porteront sur l'export vers HAL des notices, du texte intégral (HAL v3). Ce logiciel a été développé au sein du LESIA par Florence Henry et des développements ont été réalisés en partenariat avec l'ESPCI afin de l'étendre à l'ensemble des départements de l'Observatoire de Paris et à l'ESPCI. F. Henry déposera les sources sur [http://sourcesup.renater.fr/ Renater] quand les développements en cours seront jugés suffisants. Affichage des publications via Publesia : http://www.lesia.obspm.fr/-Catalogue-Publesia-.html

* '''CouvertureHAL''' : Outil de comparaison automatique de listes de publication Scopus et HAL. Les données de Scopus sont générées à partir de l'outil d'export de Scopus, et les données de HAL proviennent d'une requête pour l'[https://api.archives-ouvertes.fr/docs API HAL] fournie par l'utilisateur. L'objectif est d'obtenir la liste des résultats de Scopus absents de HAL, pour inciter les chercheurs auteurs de ces publications à les déposer dans HAL. Programmé en PHP et disponible sous licence libre GPL : http://igm.univ-mlv.fr/~gambette/ExtractionHAL/CouvertureHAL/.

* '''StructurHAL''' (École des Ponts - Direction de la Documentation) : Macro VBA Excel pour requêter toutes les structures parentes ou filles d'une structure initiale dans AuréHAL, et visualiser leur arborescence dans draw.io. Les structures AuréHAL sont souvent doublonnées ou mal enrichies et les liens entre elles désordonnés. L'objectif est de permettre de les visualiser pour pouvoir les nettoyer, par exemple pour favoriser l'affiliation correcte des auteurs sur quelques structures validées.
:- Disponible sur GitHub : https://github.com/RomBoistel/structurHAL

* '''Qualité Référentiel Structure ''' (UVSQ) : Un dashboard pour travailler sur la qualité du référentiel structure de son institution. Toutes les structures filles non valides de l'institution sont récupérées, et pour chacune de celles-ci est extrait le nombre de doc associé et la date de mise à jour. Objectif : éliminer toutes les structures non valides d'une institution : gain de visibilité pour les laboratoires, faciliter l'ajout des affiliations lors du dépôt dans Hal pour les auteurs de son institution. https://github.com/ml4rrieu/AureHalStructQual

Accueil

2020-09-04T06:47:55Z

Mlarrieu : ajout pol des établissements

Ce wiki est a la disposition de la communauté des utilisateurs de HAL, afin de permettre un partage des outils, spécifications et bonnes pratiques dans HAL.

{{cadre2|Titre=Informations générales|Couleur=#14235C|Texte=
* [[CasuHAL : club utilisateur de HAL ]]
** [https://casuhal2019.sciencesconf.org/ Journée CasuHal 2019]
** [https://casuhal2018.sciencesconf.org/ Journée CasuHal 2018]
** [[Journée CasuHal 2017]]
* [https://hal.archives-ouvertes.fr/section/documentation Documentation HAL du CCSD]
* [https://doc.archives-ouvertes.fr/wp-content/uploads/2017/12/HAL_admin_portails_doc_janvier2016.pdf Manuel administrateur HAL]
* [[Annuaire des administrateurs HAL]]
* [[Liste des portails HAL]]
* Evénements organisés pour l'[[OpenAccessWeek]]
* [[Loi pour une république numérique]]
* [[Politiques des presses universitaires]]
* [[Politiques des établissements pour la Science Ouverte ]]
}}

{{cadre2|Titre=Synthèse des discussions sur la liste de diffusion|Couleur=#14235C|Texte=
[[Fichier:Synthèse CasuHAL février 2020.pdf|100px|thumb|left|Février 2020]] [[Fichier:Synthèse Casuhal mars 2020.pdf|100px|thumb|left|Mars 2020]][[Fichier:Synthèse CasuHAL avril 2020.pdf|100px|thumb|left|Avril 2020]]
}}

{{cadre2|Titre=Bonnes pratiques et tutoriels de saisie dans HAL|Couleur=#14235C|Texte=
* [[Recommandations pour la saisie des noms de structure]]
* [[Aide à la saisie par type de document]]
* [[Tutoriels sur le dépôt dans HAL]]
* [[Supports de communication]]
* [[Exemples de sites intégrant un flux provenant de HAL]]
* [[Messages-types]]
* [[Modération des dépôts en texte intégral]]
}}

{{cadre2|Titre=Outils pour administrer HAL|Couleur=#14235C|Texte=
* [[Administrer HAL au quotidien]]
* [[Outils pour gérer les structures]]
* [[Outils et services développés localement pour améliorer ou faciliter l'utilisation de HAL]]
* [[Retours d'expérience|Retours d'expérience d'imports/exports et d'utilisation des API de HAL]]
* [[Configuration du site web]] d'un portail ou d'une collection d'un portail ou d'une collection
* [[web semantique et HAL]]
}}

{{cadre2|Titre=API|Couleur=#14235C|Texte=Section ayant pour objectif de créer une entraide au sein de CasuHal sur l'utilisation des API de HAL : http://api.archives-ouvertes.fr/docs
* [[Liste des requêtes de base|Introduction, débuter]]
* [[Requêtes_sur_les_ressources_de_HAL|Requêtes sur les ressources de HAL (ressources et référentiels)]]
* [[CasuHAL_AtelierAPI|Journées CasuHAL : Ateliers API]]
* [[API:Recherche:Hal|Formation API HAL du CCSD 2016 : requêtes sur les documents]]
* [[API:Recherche:Référentiels|Formation API HAL du CCSD 2016 : requêtes sur les auteurs et structures]]
* [[SWORD|Utilisation de sword]]
* [[GT Moissonnage]]
}}

{{cadre2|Titre=Statistiques|Couleur=#14235C|Texte=Section décrivant les possibilités offertes par le module statistique des portail HAL, accessibles aux administrateurs. ATTENTION 2019 : le CCSD développe une nouvelle interface avec Kibana, le suivi statistique va être revu
* [[Statistiques de consultation]]
* [[Statistiques de dépôt]]
* [[esgbu]]
}}

Politiques des établissements pour la Science Ouverte

2020-09-03T16:00:20Z

Mlarrieu :

SWORD

2020-06-09T12:03:59Z

Mlarrieu : ajout de notes d'utilisation

==API Sword==

===Définition===

Sword est un protocole de dialogue

[https://en.wikipedia.org/wiki/SWORD_%28protocol%29 Sword] Simple Web-service Offering Repository Deposit

L'API de dépôt SWORD permet l'import automatique de documents dans l'archive ouverte HAL

===Import Sword sur HAL===

Documentation:
*[http://api.archives-ouvertes.fr/docs/sword Import sword : documentation du CCSD]
*[https://api.archives-ouvertes.fr/documents/all.xml Format XML complet avec documentation intégrée]
*[https://github.com/CCSDForge/HAL/tree/master/Sword Documentation technique et des exemples pour chaque type de document sous github]
*[http://aramis.resinfo.org/wiki/lib/exe/fetch.php?media=ateliers:aramis-hal-v3-le-format-tei_25_02_2015.pdf Description du format TEI pour l'import sword (pdf)]
*[http://aramis.resinfo.org/wiki/lib/exe/fetch.php?media=ateliers:aramis-hal-v3-import-sword_25_02_2015.pdf Description de l'import sword via curl (pdf)]

=== Notes ===
* L'ajout de de l'identifiant ORCID pour les auteurs ne fonctionne pas (2020 06)
* L'ajout d'un ISBN si le doctype est une communication (COMM) engendre une erreur (2020 06)
* Pour le typedoc communication (COMM) légère erreur dans la [https://api.archives-ouvertes.fr/documents/all.xml doc TEI] *<country key="EN"/>* la clé du pays doit être en français ([https://api.archives-ouvertes.fr/search/?q=*%3A*&rows=0&wt=xml&indent=true&facet=true&facet.field=country_s exemple])

SWORD

2020-05-31T11:53:44Z

Mlarrieu : ajout du format XML complet

Outils et services développés localement pour améliorer ou faciliter l'utilisation de HAL

2020-05-17T11:19:16Z

Mlarrieu : ajout outil Qualité Référentiel Structure

Cette page recense des outils et services développés localement pour améliorer et/ou faciliter l’utilisation de [http://hal.archives-ouvertes.fr/ HAL] :
== Outils facilitant le dépôt des publications dans HAL ==

* '''[http://perso.ens-lyon.fr/martin.verot/HAL.php mHALoDOI]''' : une petite série de scripts (javascript) pour vérifier qu'une liste de DOI a bien des notices correspondantes déposées dans HAL avec la bonne affiliation. Plutôt qu'un outil unique avec beaucoup de paramètres, l'accent a été mis sur le fait d'avoir des étapes les plus simples possibles : récupérer les DOI puis chercher les publications sur HAL. Il y a également une option pour vérifier si [http://perso.ens-lyon.fr/martin.verot/DOI_orcid.php des publications ORCID sont sur HAL] ou [http://perso.ens-lyon.fr/martin.verot/HAL_findDOI.php trouver des DOI à partir d'une liste de titres].
:- Un tutoriel vidéo pour expliquer comment utiliser les scripts : https://www.youtube.com/watch?v=_3gjglWNoj8&list=PL_rdrSitJev4QqAUM25x3Nguw8UuBJeOG

* '''X2HAL''' : application web qui permet de déposer un lot de publications dans HAL à partir d’un fichier TEI ou BibTeX. Pour l’utiliser, il suffit d'avoir un compte personnel HAL. L'outil vous facilite le dépôt : en proposant les affiliations des auteurs à partir de celles existant dans HAL, en complétant certaines métadonnées manquantes avec des valeurs par défaut (Ex: x-audience, abstract, ...), en complétant certaines métadonnées manquantes à partir des référentiels. Documentation (Bib2HAL) : https://hal.archives-ouvertes.fr/section/imports-bib2hal Lien : https://x2hal.inria.fr/ (accès via compte personnel HAL)

* '''Bib2HAL et Zotero''' : certains établissements utilisent Bib2HAL couplé à [[Zotero]] pour l'alimentation rétrospective de leurs collections HAL : Zotero permet de construire des collections de documents (par labo, année, type) ; chacune de ces collections est ensuite exportée en format BibTeX, rapidement retravaillée (par exemple avec [http://assessmentlibrarian.fr/?p=2079 ce script]), puis importée dans HAL via Bib2HAL, outil qui facilite notamment le repérage des affiliations.

* '''[http://aigle.sf.net AIGLe]''' : Application web collaborative destinée à faciliter les tâches administratives et à valoriser le travail des chercheurs dans les laboratoires, AIGLe permet, entre autre, la gestion des publications. Une base locale contenant l'ensemble des publications des chercheurs du laboratoire est synchronisée avec HAL via les WebServices. Depuis l'interface, l'auteur peut importer des notices bibliographiques depuis PubMed, ArXiv, WoS, HAL puis après modifications éventuelles et toujours depuis l'interface de AIGLe, les "pousser" sur HAL. Il peut exporter dans de nombreux formats (Bibtex, RTF, Word ...). AIGLe peut informer les auteurs (et/ou les gestionnaires) de l'existence de notices trouvées sur WoS mais qui ne sont ni dans sa base ni sur HAL et les aider à en faire l'importation. AIGLe aide les gestionnaires de publications à détecter les doublons présents sur HAL, les erreurs d'orthographe sur les noms ou prénoms d'auteurs, les erreurs d'affectations etc ... '''AIGLe est compatible avec HAL V3''' depuis sa version 5.0.1

* '''OverHAL''' : version modifiée du programme CouvertureHAL, adaptée par Olivier Troccaz et Laurent Jonchère (Université de Rennes 1). OverHAL permet de comparer HAL et des listes de publications (WoS, Scopus, Zotero, Pubmed, etc.). Objectifs : identifier les publications absentes de HAL, créer un fichier TEI adapté à X2HAL, générer des emails de demande de post-prints aux auteurs correspondants.
:- Exemple d'application (Univ. de Rennes 1) : [https://halur1.univ-rennes1.fr/OverHAL.php https://halur1.univ-rennes1.fr/OverHAL.php]
:- Manuel d'utilisation(PDF) : [https://halur1.univ-rennes1.fr/Manuel-OverHAL.pdf https://halur1.univ-rennes1.fr/Manuel-OverHAL.pdf]
:- Présentation OverHAL mailing (PDF) : [https://halur1.univ-rennes1.fr/OverHAL-mailing.pdf Présentation CasuHAL mars 2019]
:- Plateformes utilisées pour la "veille post-print" (PDF) : [https://halur1.univ-rennes1.fr/OverHAL-liste-plateformes-editeurs.pdf Liste des plateformes éditeurs]
:- Télécharger le fichier et la procédure d'installation (format compressé) : [https://halur1.univ-rennes1.fr/OverHAL.7z https://halur1.univ-rennes1.fr/OverHAL.7z]

== Services et outils basés sur une réutilisation des dépôts HAL ==
=== Pages web dynamiques alimentées par les dépôts HAL ===
Il existe plusieurs outils plus ou moins élaborés permettant d’alimenter automatiquement la page web « publications » d’un laboratoire ou d’une équipe de recherche, à partir des dépôts dans HAL :
* [https://haltools.archives-ouvertes.fr/ HALtools] : outil développé par Inria qui permet de créer une page web de publications associée à un auteur, une équipe, un labo, une collection, un projet ... Solution iframe ou PHP adaptée à tous les CMS. Documentation : https://iww.inria.fr/hal/aide/spip.php%3Frubrique59&lang=fr.html
* Université Grenoble Alpes : Utiliser le service "Créer sa page web" pour intégrer proprement le résultat dans un site web via un plugin ou module adapté au CMS utilisé. Disponible pour Drupal, SPIP, Joomla, TYPO3. En projet, un module pour le CMS KSup. Documentés sur GitHub: https://github.com/Saga-UGA
* LOMA UMR CNRS 5798 : page web de la collection HAL intégrée dans la page du site web de l’unité au moyen d’une iframe. Lien : https://www.loma.cnrs.fr/production-scientifique/
* L’Université de Rennes 1 propose un service similaire, avec des fonctionnalités supplémentaires : moteur de recherche intégré, affichage et export des données au format bibliographique (CSV, RTF), pagination (10 références par page), demande de tiré à part (reprint request), mode affichage labo ou chercheur. Le service fonctionne à partir d’un script PHP mis au point par Olivier Troccaz, ingénieur informaticien à l'OSUR. Exemple : https://micmac.univ-rennes1.fr/nos-publications - Script PHP : télécharger la [https://halur1.univ-rennes1.fr/Publis-HAL-SCD.7z dernière version du script] Pensez à bien modifier les paramètres serveur - Télécharger la [https://halur1.univ-rennes1.fr/Publis-HAL-SCD - Liste des paramètres du script PHP HALv3.doc liste des champs] pour intégration de l'URL dans un iframe Pour tout renseignement, contacter [http://annuaire.univ-rennes1.fr/cvv.asp?nom=Jonchere&prenom=Laurent Laurent Jonchère]
* [http://aigle.sf.net AIGLe] : Application web collaborative destinée à faciliter les tâches administratives, AIGLe permet, entre autre, la '''valorisation''' des publications. Une base locale alimentée localement mais également automatiquement depuis HAL et contenant l'ensemble des publications des chercheurs du laboratoire est synchronisée avec HAL via les WebServices. AIGLe est fourni avec un plugin SPIP, un plugin FastBoil, un composant Joomla, une solution Iframe et un site Web minimaliste. Ces outils permettant d'afficher, dans presque n'importe quelle configuration de site web, la liste des publications produites par les auteurs du laboratoire, les pages web professionnelles des chercheurs incluant la liste de leur publications, les prochains séminaires/colloquiums, les congrès/workshops, un annuaire, un trombinoscope etc... AIGLe utilise MathJax pour le rendu des titres et des résumés de publication.

=== Visualisation d'informations extraites de HAL ===
* [https://github.com/anHALytics AnHALytics] est une plateforme d'analyse de contenu des publications de HAL (moissonage, extraction des métadonnées du texte intégral, analyse sémantique de contenu, normalisation des entités de la recherche : auteurs, affiliations et publications) : [http://traces1.saclay.inria.fr/anHALytics/search/ démo].

=== Extraction et mise en forme des publications ===
* '''ExtractionHAL''' (contact : Philippe Gambette, HAL_UPEMLV@univ-mlv.fr) : Extraction et mise en forme des publications (Université Paris-Est Marne-La-Vallée). La version actuelle, basée sur l'API HAL, a été utilisée par une unité de recherche UPEM (MSME) pour récupérer un bilan bibliographique mis en forme de sa production scientifique : [http://igm.univ-mlv.fr/~gambette/ExtractionHAL/ExtractionHAL.php?team=MSME http://igm.univ-mlv.fr/~gambette/ExtractionHAL/ExtractionHAL.php?team=MSME] (il est possible de remplacer le "MSME" final par le code d'une autre collection). Elle se présente sous forme d'un fichier PHP qui est donc modifiable pour adapter la mise en forme. Evolutions prévues : soulignement des auteurs en fonction de leur affiliation.
* '''ExtrHAL''' : version modifiée du programme créé par Philippe Gambette (voir entrée précédente), adaptée par Olivier Troccaz et Laurent Jonchère (Université de Rennes 1). L'outil propose un choix très large de types de documents (articles, ouvrages, etc.), ainsi qu'un menu permettant de personnaliser la liste. Export des données en RTF, CSV ou Bibtex. Pour utiliser l'outil dans votre établissement, installez le fichier PHP sur votre serveur et appelez le dans une page web (https://nomduserveur/ExtractionHAL.php).
:- Exemple d'application (Univ. de Rennes 1) : [https://halur1.univ-rennes1.fr/ExtractionHAL.php https://halur1.univ-rennes1.fr/ExtractionHAL.php]
:- Télécharger le '''fichier d'installation''' (format compressé) : [https://halur1.univ-rennes1.fr/ExtrHAL.7z https://halur1.univ-rennes1.fr/ExtrHAL.7z]
:- Procédure d'installation (fichier PDF) : [https://halur1.univ-rennes1.fr/installation/Installer-ExtrHAL.pdf https://halur1.univ-rennes1.fr/installation/Installer-ExtrHAL.pdf]
: Pour ajouter les fonctionnalités de soulignement des auteurs et d'affichage des rangs HCERES et CNRS, il faut créer un fichier php pour chaque liste. A titre d'exemple, voici les fichiers créés par Rennes 1 :
:- Revues HCERES en économie-gestion : [https://halur1.univ-rennes1.fr/installation/ExtractionHAL-rang-AERES-SHS.php https://halur1.univ-rennes1.fr/installation/ExtractionHAL-rang-AERES-SHS.php]
:- Revues CNRS en économie-gestion : [https://halur1.univ-rennes1.fr/installation/ExtractionHAL-rang-CNRS.php https://halur1.univ-rennes1.fr/installation/ExtractionHAL-rang-CNRS.php] Pour tout renseignement, contacter [https://www.univ-rennes1.fr/interlocuteurs/laurent-jonchere Laurent Jonchère]
* '''[http://aigle.sf.net AIGLe]''' : Application web collaborative destinée à faciliter les tâches administratives, [http://aigle.sf.net AIGLe] permet, entre autre, la gestion des publications. Une base locale alimentée localement mais également automatiquement depuis HAL et contenant l'ensemble des publications des chercheurs du laboratoire est synchronisées avec HAL via les WebServices. Les utilisateurs peuvent exporter des listes de publications choisies selon de multiples critères et dans divers formats (BibTex, Harvard RTF, Word, HTML etc ...).
* '''HALLO''' : HALLO est un programme PERL multi-plateforme développé par Yannick Parmentier, enseignant-chercheur à l’université d’Orléans. Il permet (i) d'extraire de HAL une liste de publications au format bibtex à partir d'un fichier texte contenant une (ou plusieurs) requête(s) et (ii) de convertir cette liste dans divers formats (e.g. html) au moyen de l'outil JabRef (intégré). HALLO fournit ainsi une alternative en ligne de commande à l'interface web d'interrogation de HAL.
:- Un exemple de page produite par HALLO est disponible à l'adresse suivante : [http://www.univ-orleans.fr/lifo/publications.php http://www.univ-orleans.fr/lifo/publications.php.]
:- Pour plus d'informations : [http://www.univ-orleans.fr/lifo/membres/Yannick.Parmentier/hallo.html http://www.univ-orleans.fr/lifo/membres/Yannick.Parmentier/hallo.html.]
* '''Widget d'export/téléchargement du CV HAL''' : à télécharger [http://igm.univ-mlv.fr/~gambette/ExtractionHAL/WidgetCvHAL.txt ici], et à insérer comme widget personnalisé dans le CV HAL, explications en début de fichier.

=== Contrôle bibliographique des collections HAL ===
* '''OCdHAL''' (Outil de Contrôle des données de HAL) : logiciel de contrôle des données d’une collection HAL, créé par Patricia Reynier (CNRS) et Pascal Bellemain (CNRS), au laboratoire GIPSA-lab. L'application permet de consulter, modifier et synchroniser l'ensemble des articles d'une collection HAL, présentés sous la forme d'un tableau dans lequel les articles s'affichent en ligne et leurs métadonnées en colonnes. L'application est interfacée avec HAL via les protocoles Solr et SWORD. Pour plus d'information ou pour obtenir le manuel d'utilisation contacter patricia.reynier[at]gipsa-lab.grenoble-inp.fr. Pour installer le logiciel, il faut compléter un CLUF (Contrat de Licence de l'Utilisateur Final). Le manuel d'utilisation est téléchargeable une fois l'application installée. OCdHAL est aussi disponible en tant qu'application Web, selon les mêmes conditions. En savoir plus : http://www.gipsa-lab.grenoble-inp.fr/valorisation/logiciels.php?id_valorisation=123 

* '''[http://aigle.sf.net AIGLe]''' : Application web collaborative destinée à faciliter les tâches administratives, [http://aigle.sf.net AIGLe] permet, entre autre, la valorisation des publications. Une base locale de publications (artilces et notices biblio) est synchronisée avec HAL via les WebServices. Lors des dépôts ou des synchronisations, [http://aigle.sf.net AIGLe] est capable de détecter les doublons sur HAL, les erreurs d'orthographes sur les noms ou les prénoms des auteurs du laboratoire, les erreurs d'affectation, de vérifier la conformité des codes DOI, [http://aigle.sf.net AIGLe] aide également le déposant à prendre connaissance des règles de publications édictées par l'éditeur de sa publication. Tous les auteurs du laboratoire peuvent éditer et modifier leurs publications sans avoir de compte sur HAL, les modifications étant automatiquement exportées sur HAL (en asynchrone en cas de problème sur les serveurs HAL).

* '''[http://igm.univ-mlv.fr/~gambette/ExtractionHAL/JournHAL.php JournHAL]''' : pour toute recherche d'une revue, affichage de statistiques à propos de l'audience (nationale ou internationale) de cette revue, en fonction des dépôts dans HAL d'articles de cette revue.

== Autres outils ==
* '''[https://marprod.in2p3.fr/limbra_cppm LIMBRA : LIstes et Métriques BibliogRaphiques Automatisées]''' (CPPM - Centre de Physique des Particules de Marseille )

Outil de bibliométrie pour la création de listes et le comptage des publications, afin d’obtenir un état actualisé de la production scientifique du laboratoire.
C'est une application web écrite en python et javascript. Elle utilise le framework web2py, la librairie javascript Ext JS pour l'interface utilisateur et MathJax pour le rendu des équations. La base de données interne est constituée par moissonnage des métadonnées (bases bibliographiques du [https://cds.cern.ch/ CERN] et [https://inspirehep.net/ Inspire HEP]) et par saisie manuelle. C'est une application générique qui pourrait être utilisée par d'autres institutions. Actuellement elle est en cours de développement dans les laboratoires de l'IN2P3.
'''[http://www.cppm.in2p3.fr CPPM / CNRS — Aix-Marseille Université]''' / contact : [[doc@cppm.in2p3.fr]]

* '''[http://ipag.osug.fr/ IPAG]''' (Institut de Planétologie et d’Astrophysique de Grenoble) : base de données des publications du laboratoire, alimentée par moissonnage de bases externes, dont les références peuvent être validées, corrigées et enrichies par les auteurs eux-mêmes : http://publi-ipag.osug.fr. La base a été conçue pour faciliter la production des rapports et alimenter la [http://ipag.osug.fr/spip.php?page=publi_ipag_short page web « publications »] de l’unité. Il est prévu d’adapter l’outil pour compléter le référencement bibliographique de la collection HAL du laboratoire : http://hal-insu.archives-ouvertes.fr/IPAG

* '''Publesia''' (LESIA - Laboratoire d'études spatiales et d'instrumentation en astrophysique, département de l'Observatoire de Paris) : outil de contrôle de publications, permettant le recensement des publications de l'Observatoire de Paris par les publiants eux-mêmes. L’objectif est de simplifier la saisie par les chercheurs, avec aide à la gestion des affiliations (imports depuis fichiers BibTex et bases bibliographiques : ADS, WOS, HAL…). L’application propose une fonctionnalité d’export des données pour les rapports (RTF), les publiants (BibTeX, EndNote), l’analyse (CSV). Les développements à venir porteront sur l'export vers HAL des notices, du texte intégral (HAL v3). Ce logiciel a été développé au sein du LESIA par Florence Henry et des développements ont été réalisés en partenariat avec l'ESPCI afin de l'étendre à l'ensemble des départements de l'Observatoire de Paris et à l'ESPCI. F. Henry déposera les sources sur [http://sourcesup.renater.fr/ Renater] quand les développements en cours seront jugés suffisants. Affichage des publications via Publesia : http://www.lesia.obspm.fr/-Catalogue-Publesia-.html

* '''CouvertureHAL''' : Outil de comparaison automatique de listes de publication Scopus et HAL. Les données de Scopus sont générées à partir de l'outil d'export de Scopus, et les données de HAL proviennent d'une requête pour l'[https://api.archives-ouvertes.fr/docs API HAL] fournie par l'utilisateur. L'objectif est d'obtenir la liste des résultats de Scopus absents de HAL, pour inciter les chercheurs auteurs de ces publications à les déposer dans HAL. Programmé en PHP et disponible sous licence libre GPL : http://igm.univ-mlv.fr/~gambette/ExtractionHAL/CouvertureHAL/.

* '''StructurHAL''' (École des Ponts - Direction de la Documentation) : Macro VBA Excel pour requêter toutes les structures parentes ou filles d'une structure initiale dans AuréHAL, et visualiser leur arborescence dans draw.io. Les structures AuréHAL sont souvent doublonnées ou mal enrichies et les liens entre elles désordonnés. L'objectif est de permettre de les visualiser pour pouvoir les nettoyer, par exemple pour favoriser l'affiliation correcte des auteurs sur quelques structures validées.
:- Disponible sur GitHub : https://github.com/RomBoistel/structurHAL

* '''Qualité Référentiel Structure ''' (UVSQ) : Un dashboard pour travailler sur la qualité du référentiel structure de son institution. Toutes les structures filles non valides de l'institution sont récupérées, et pour chacune de celles-ci est extrait le nombre de doc associé et la date de mise à jour. Objectif : éliminer toutes les structures non valides d'une institution : gain de visibilité pour les laboratoires, faciliter l'ajout des affiliations lors du dépôt dans Hal pour les auteurs de son institution. https://github.com/Podatus/AureHalStructQual

Politiques des établissements pour la Science Ouverte

2020-05-17T10:43:05Z

Mlarrieu : création de la page

* CNRS, 2018-11, [https://www.science-ouverte.cnrs.fr/ Feuille de route pour la Science Ouverte]
* ENPC, 2018-10, [https://espacechercheurs.enpc.fr/fr/plan-science-ouverte Le Plan Science Ouverte de l’École des Ponts ParisTech]
* SU, 2019-03, [https://hal.sorbonne-universite.fr/page/charte-de-sorbonne-universite Charte de Sorbonne Université pour le libre accès aux publications]
* UT2J, 2019-07, [https://blogs.univ-tlse2.fr/vie-etablissement/pour-une-science-ouverte/ Charte de l'université Toulouse Jean-Jaurès pour une Science Ouverte]
* UC2A, 2020-01, [https://alambic.hypotheses.org/6985 Feuille de route pour la Science Ouverte de Université Clermont Auvergne]

Exemples de sites intégrant un flux provenant de HAL

2020-05-17T09:44:24Z

Mlarrieu :

[http://www.uvsq.fr/laboratoire-des-sciences-du-climat-et-de-l-environnement-lsce-umr-8212-cnrs-cea-uvsq--10461.kjsp Les pages laboratoires du site de l'UVSQ] 
[http://devi.recherche.enac.fr/?page_id=1038&lang=fr École Nationale d'Aviation Civile, Equipe de recherche DEVI] 
[https://www.pacte-grenoble.fr/ Laboratoire Pacte (UMR 5194)] 
[http://aau.archi.fr/laboratoire-aau/publications/?type=OUV Laboratoire ambiances architectures urbanités (UMR 1563)] 
[https://bcl.cnrs.fr UMR 7320 : Bases, corpus, langage] 
[http://iramis.cea.fr/ Institut Iramis] 
[http://iramis.cea.fr/nimbe/Phocea/Vie_des_labos/Ast/ast_groupe.php?id_groupe=448&voir=publis Laboratoire LSDRM (UMR 3685 NIMBE)] 
[http://iramis.cea.fr/nimbe/ UMR 3685 NIMBE] 
[https://stl.univ-lille.fr/les-publications/ STL (UMR 8163)] 
Exemples d'utilisation du module HAL / Drupal développé par AMU : 
- publis par labo [https://lce.univ-amu.fr/docs/2019/_1 LCE], [https://lnc.univ-amu.fr/docs/2019/_22 LNC], [https://tagc.univ-amu.fr/docs/2019/_1 TAGC] 
- publis par chercheur [https://tagc.univ-amu.fr/en/users/rihet-pascal] 

[http://framespa.univ-tlse2.fr/actualites/pratique/annuaire/debax-helene-24329.kjsp?RH=annuaire_framespa Annuaire du Framespa (UMR 5136)] 
[http://clle.univ-tlse2.fr/accueil/actualites/annuaire/fabre-cecile-29294.kjsp?RH=Annuaire_CLLE2 Annuaire du CLLE (UMR 5263)] 
[http://artehis.u-bourgogne.fr/annuaire/124-annuaire/membres-titulaires/200-bully-sebastien.html Annuaire Artehis (UMR 6298)] 

[https://pro.univ-lille.fr/fabienne-blaise/publications/#descr Liste de publications de Fabienne BLAISE (UMR 8163)] 
[http://iramis.cea.fr/Pisp/thibault.charpentier/ Page personnelle de Thibault CHARPENTIER (Iramis)]

Requêtes sur les ressources de HAL

2019-10-16T13:02:11Z

Mlarrieu : /* Liste des dépôts en open access d'une structure */

=== Remarques générales ===
Les champs retournés par défaut sont docid, label_s et uri_s

Les résultats sont limités à 30 lignes par défaut

Le format de retour par défaut est JSON (installer un visualiseur json dans son navigateur)

Les requêtes ci-dessous sont toutes appliquées à une collection (ou un portail), on peut donc changer cet identifiant pour appliquer la requête à son contexte

== Requêtes simples pour récupérer des listes ==
=== Liste des dépôts d'une institution ou d'un regroupement ===
Dans ce cas on utilise simplement l'identifiant de l'institution. Dans Auréhal le niveau regroupement existe : https://doc.archives-ouvertes.fr/gerer-un-portail/referentiels/structures-de-recherche/.

La configuration du regroupement se fait donc dans Auréhal

Exemple pour le regroupement Comue Paris-Est (https://aurehal.archives-ouvertes.fr/structure/read/id/303512)
<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/?q=structId_i:303512</pre>

=== Liste des dépôts en open access d'une structure ===
dépôts Open Access : soit le plein texte est dans Hal (le champs ''submitType_s'') , soit il est sur le web via unpaywall, soit dans ArXiv soit dans Pubmed (champs ''linkExtId_s'')
<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/?&wt=xml&fq=structId_i:303512&fq=(submitType_s:file OR linkExtId_s:(openaccess OR arxiv OR pubmedcentral))</pre>

=== Export des 50 derniers dépôts faits dans une collection par date de publication descendante ===
le filtre de tri est producedDate_tdate = date de publication
<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/SIC/?q=*:*&rows=50&wt=csv&sort=producedDate_tdate%20desc </pre>

Cette requête rapporte 50 résultats dans un export CSV

Si on fait la requête au format xml on voit le numreponse à 6122 => si on veut tout voir on peut mettre rows=6200.

=== Export des 50 derniers dépôts faits dans une collection par date de dépôt descendante ===
le filtre de tri est submittedDate_s = date de dépôt
<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/SIC/?q=*:*&rows=100&wt=csv&fl=submittedDate_s,producedDate_s,label_s&sort=submittedDate_s%20desc</pre>

=== Flux rss des dépôts faits dans une collection depuis 1 mois ===
Pour avoir la sortie sous la forme d'un flux RSS il faut indiquer wt=rss
<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/hal/?q=collCode_s:UNIV-ORLEANS&fq=releasedDate_tdate:[NOW%2FDAY-1MONTH+TO+NOW%2FDAY%2B1DAY]&fq=&rows=30&sort=submittedDate_tdate+desc&wt=rss</pre>

le champ rows indique le nombre de résultat qu'on souhaite récupérer (30 ici)

=== Flux rss des 3 derniers dépôts avec texte intégral ===
<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/pasteur/?wt=rss&q=*&sort=submittedDate_tdate+desc&fq=producedDate_tdate:[NOW-1YEARS%20TO%20NOW]&fq=submitType_s:file&fq=collCode_s%3APASTEUR&fq=NOT+status_i%3A111&rows=3</pre>

Dans le champ date, on récupère les 12 derniers mois (de moins 1 an à aujourd'hui) et on limite à 3 résultats (rows=3)

=== Liste des thèses d'une institution ===
<pre style="white-space:pre-wrap;">http://api.archives-ouvertes.fr/search/?q=docType_s:THESE%20AND%20authorityInstitution_s:%22Université%20d'Orléans%22&wt=csv&sort=producedDate_s%20desc&rows=2000&fl=halId_s,defenseDate_s,authFullName_s,thesisSchool_s,labStructAcronym_s,instStructAcronym_s,title_s,label_s</pre>

la liste des champs exportés est : halId_s,defenseDate_s,authFullName_s,thesisSchool_s,labStructAcronym_s,instStructAcronym_s,title_s,label_s

changer rows=2000 pour le nombre de réponses

Il faut indiquer le champ "authorityInstitution_s" : trouver le bon intitulé dans https://api.archives-ouvertes.fr/search/?q=*%3A*&rows=0&wt=xml&indent=true&facet=true&facet.field=authorityInstitution_s

== Requêtes sur les collections ==

=== Récupérer la liste des collections rattachées à son institution ===
Il s'agit là de récupérer par l'API la même liste que celle possible sur le portail : https://hal-univ-orleans.archives-ouvertes.fr/browse/scollection
<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/UNIV-ORLEANS/?q=*:*&rows=0&wt=xml&indent=true&facet=true&facet.field=collIsParentOfCategoryColl_fs&facet.prefix=UNIV-ORLEANS</pre>

Cette requête, comme la page du portail, liste les collections pour lesquelles dans leur configuration il a été complété le champ : Identifiant des collections supérieures.

=== Récupérer la liste des collections qui contiennent au moins un dépôt de son institution ===
<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/UNIV-ORLEANS/?q=*%3A*&rows=0&wt=xml&indent=true&facet=true&facet.field=collIsParentOfCategoryColl_fs</pre>

Le champs collIsParentOfCategoryColl_fs contient les données suivantes : Collection parente + _FacetSep_ + type collection parente + _JoinSep_ + Code de la collection + _FacetSep_ + Nom de la collection

== Requêtes d'analyse du contenu par type de documents ==

=== Connaître le cumul des dépôts de sa collection répartis par type de document ===
Requête à facette affichant une collection, le nombre d’occurrence par type de document
<pre style="white-space:pre-wrap;"> https://api.archives-ouvertes.fr/search/?q=*&fq=collCode_s:UNIV-ORLEANS&fq=NOT+status_i%3A111&start=0&rows=0&omitHeader=true&facet.mincount=1&facet.limit=10000&facet=true&facet.field=docType_s&facet.sort=count</pre>

Les cumuls sont calculés depuis 2011.

liste des types de documents dans HAL (41 en tout) : https://api.archives-ouvertes.fr/ref/doctype

=== Connaître le nombre total de dépôt année par année dans sa collection. Et pour chaque année la répartition des dépôts par type de document ===
Requête affichant le nombre de dépôt par année de publication
<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/UNIV-ORLEANS/?q=*:*&wt=xml&rows=0&facet=true&facet.pivot=submittedDateY_i,submitType_s,docType_s</pre>

Pour chaque année l'arbre xml affiche le nombre total de dépôt, puis l’élément pivot détaille le contenu annuel type de document par type de document.

=== Connaître le nombre de dépôt pour une année donnée dans sa collection présenté par type de documents ===

<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/univ-orleans/?q=*:*&rows=0&fq=submittedDateY_i:2019&facet=true&facet.field=docType_s&wt=xml</pre>

=== Méthode pour repérer les types d'articles (extractions HCERES) ===
Article du blog Carnet'IST. Proposition de requêtes sur le site web HAL pour distinguer, entre autres, les 4 types d’articles suivants : ACL; ACLN, ACSL, AV ou TRANSF
http://carnetist.hypotheses.org/240

== Requêtes d'analyse du contenu par domaine ==

=== Connaître le cumul des dépôts de sa collection répartis par domaines ===
Requête affichant le nombre de notice par domaine pour sa collection
<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/UNIV-ORLEANS/?q=%2A&fq=NOT+status_i%3A111&start=0&rows=0&wt=phps&omitHeader=true&facet.mincount=1&facet.limit=10000&facet=true&facet.field=level0_domain_s&facet.sort=count</pre>

Liste des domaines de HAL (393 en mai 2019) : http://api.archives-ouvertes.fr/ref/domain/?q=*:*&rows=400

== Requêtes d'analyse du contenu des revues (journal) ==

=== Connaître le nombre d'articles déposés par titre de revue dans sa collection ===
La requête affiche pour chaque revue le nombre d'articles déposés dans la collection HAL.
<pre style="white-space:pre-wrap;"> https://api.archives-ouvertes.fr/search/?q=*&fq=collCode_s:UNIV-ORLEANS&fq=NOT+status_i%3A111&start=0&rows=0&omitHeader=true&facet.mincount=1&facet.limit=10000&facet=true&facet.field=journalTitle_s&facet.sort=count</pre>
Le cumul est calculé depuis 2011 et ne concerne que le type "articles".

== Requêtes d'analyse de ses structures ==

=== Liste des structures affiliées à une institution et pas à une autre ===
Il s'agit par exemple de récupérer la liste des laboratoires attachés à l'université de Nancy et pas à l'université de Lorraine

<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/ref/structure/?fq=(parentDocid_i:300292%20AND%20NOT(parentDocid_i:413289))&fl=docid,name_s&wt=csv</pre>

Pour cette requêtes il faut récupérer dans Auréhal structure les identifiants des 2 structures à analyser

=== Liste de toutes les structures qui dépendent d'une structure ===
Requête sur le référentiel structure d'Auréhal
<pre style="white-space:pre-wrap;">http://api.archives-ouvertes.fr/ref/structure/?q=parentDocid_i:"74911"&rows=300&fl=name_s,acronym_s,code_s,docid,address_s,url_s,country_s&sort=acronym_s asc </pre>

* parentDocid = 74911 (université d'Angers)
* rows = 300. Permet d'avoir toutes les réponses, dans le résultat le numFound = 279.
* fl=name_s,acronym_s,code_s,docid,address_s,url_s,country_s : liste des champs demandé en réponse
* sort=acronym_s asc : trié par ordre alphabétique de l'acronyme

== Requêtes d'analyse des contributions ==

=== Nombre de dépôt par contributeur dans un portail, classés par année de dépôt ===
Requête à facette affichant par année, la liste des contributeurs déposant et le nombre de dépôt associé à chaque contributeur
<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/univ-orleans/?q=*:*&facet=true&facet.pivot=submittedDateY_i,contributorFullName_s&rows=0&wt=xml&facet.limit=1000</pre>

== Requêtes d'analyse des auteurs ==

=== Liste des auteurs dont une publication au moins est affiliée à une structure avec indication de leur IDHAL ou de l'absence d'IDHAL ===

Requête à facette listant les auteurs affiliés par un ou plusieurs dépôt à une structure
<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/?q=*:*&rows=0&wt=xml&facet=true&facet.query=structHasAuthIdHal_fs&facet.field=structHasAuthIdHal_fs&facet.prefix=129439_FacetSep_&facet.mincount=1&facet.limit=1000</pre>
ou
https://api.archives-ouvertes.fr/search/?q=*:*&rows=0&facet=true&facet.field=structHasAuthIdHal_fs&facet.prefix=226306_&wt=xml

Le champ facet.prefix indique l'identifiant de la structure d'affiliation voulue (à trouver dans Aurehal structure)

https://api.archives-ouvertes.fr/search/?q=*:*&rows=0&facet=true&facet.field=structHasAuthIdHal_fs&facet.prefix=245758_&wt=xml&fq=structId_i:245758

Pour ceux qui ont un idhal la chaine le représentant est entre ''_JoinSep_'' et ''_FacetSep_''

* Exemple avec Idhal : 226306_FacetSep_Maison des Sciences de l'Homme de Dijon''_JoinSep_'''''lsaligny'''''_FacetSep_''Saligny Laure
* Exemple sans Idhal : 226306_FacetSep_Maison des Sciences de l'Homme de Dijon''_JoinSep__FacetSep_''Alazard Céline

=== Nombre de publications scientifiques hors vulgarisation des auteurs d'une collection et d'un laboratoire spécifique par année universitaire de publication (2015-2016) en affichant uniquement les auteurs affiliés au laboratoire demandé et non pas tous les auteurs présents dans la collection ===
Requête indiquant le nombre de publications scientifiques par auteurs affiliés à une structure spécifique (&fq=authStructId_i:54305 et &facet.field=authIdHasPrimaryStructure_fs&facet.contains=_JoinSep_54305_FacetSep), pour une année universitaire donnée (&fq=producedDate_tdate:), hors vulgarisation (&fq=popularLevel_s:0)

<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/UNIV-REUNION/?q=collection_t:LIM&fq=authStructId_i:54305&fq=popularLevel_s:0&fq=producedDate_tdate:[2015-07-31T00:00:00Z TO 2016-07-31T00:00:00Z]&rows=0&indent=true&facet=true&sort=producedDate_tdate%20asc&facet.field=authIdHasPrimaryStructure_fs&facet.contains=_JoinSep_54305_FacetSep&wt=xml</pre>

Détails des paramètres :
* q=collection_t:LIM
* fq=authStructId_i:54305
* fq=popularLevel_s:0
* fq=producedDate_tdate:[2015-07-31T00:00:00Z%20TO%202016-07-31T00:00:00Z]
* rows=0
* indent=true
* &sort=producedDate_tdate%20asc
* facet.field=authIdHasPrimaryStructure_f
* facet.contains=_JoinSep_54305_FacetSep
* wt=xml

=== Liste des auteurs ayant un dépôt ou plusieurs affilié à une structure ayant créé leur CV HAL ===

Attention, la requête est dans le référentiel auteur, donc n'a pas de rapport avec les documents.
De plus structureId_i dans le référentiel auteur est l'organisme payeur - pas du tout la même chose que l'affiliation d'un auteur à une publication.

Requête effectuée dans le référentiel Auréhal Auteurs
<pre style="white-space:pre-wrap;">http://api.archives-ouvertes.fr/ref/author/?q=structureId_i:198056 AND hasCV_bool:true&rows=10000&sort=lastName_s asc&fl=idHal_s,idHal_i,lastName_s,firstName_s</pre>

Il est également possible de faire cette recherche directement sur Auréhal (https://aurehal.archives-ouvertes.fr/author/index) en indiquant dans le champ de recherche les valeurs de la requête : structureId_i:198056 AND hasCV_bool:true

[[File:Hal_requête_CV.png|800px]]

=== Autre solution ===

==== 1. Trouver tous les auteurs affiliés à la structure : ====

https://api.archives-ouvertes.fr/search/?indent=true&facet.field=structHasAuthIdHal_fs&facet.prefix=44429_FacetSep_&facet=on&indent=on&q=*:*&rows=0&wt=json&facet.limit=5000&facet.mincount=1

dans le résultat prendre ceux qui ont un idhal eg
44429_FacetSep_Laboratoire Interdisciplinaire Solidarités, Sociétés, Territoires_JoinSep_michel-grossetti_FacetSep_Grossetti Michel"

==== 2. chercher dans le référentiel auteur ====

pour chaque idhal chercher si l'auteur a un CV :

https://api.archives-ouvertes.fr/ref/author/?wt=xml&q=(idHal_s:michel-grossetti AND hasCV_bool:true)

si il y a 1 résultat: l'auteur a un CV

== Requêtes sur le contrôle qualité du contenu ==
=== Liste des dépôts effectués dans un portail X mais non affiliés à une structure de la collection XX ===
L'objectif est d'avoir les dépôts qui sont passés par un portail mais qui ne sont pas affiliés à une structure relevant de ce portail (des erreurs de dépôt)
<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/amu/?q=structure_t:*%20NOT%20%28%22Universit%C3%A9%20de%20Provence%20-%20Aix-Marseille%20I%22%20OR%20%22Universit%C3%A9%20de%20la%20M%C3%A9diterran%C3%A9e%20-%20Aix-Marseille%20II%22%20OR%20%22Universit%C3%A9%20Paul%20C%C3%A9zanne%20-%20Aix-Marseille%20III%22%20OR%20%22Universit%C3%A9%20de%20Provence%20-%20Aix-Marseille%201%22%20OR%20%20%22Universit%C3%A9%20de%20la%20M%C3%A9diterran%C3%A9e%20-%20Aix-Marseille%202%22%20OR%20%20%22Universit%C3%A9%20Paul%20C%C3%A9zanne%20-%20Aix-Marseille%203%22%20OR%20%22Aix-Marseille%20Universit%C3%A9%20-%20AMU%22%20OR%20%20%22PRES%20Aix%20Marseille%20Universit%C3%A9%22%20OR%20%22Aix%20Marseille%20Universit%C3%A9%22%29&wt=xml&fl=uri_s</pre>

== Requêtes qui restent à créer ou finaliser ==

=== Récupérer la lise de tous les "codes de collection" (soit collCode_s) de type "REVUE" (soit collCategory_s:REVUE) ===
<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/?q=*:*&rows=0&wt=xml&fq=collCategory_s:REVUE&facet=true&facet.field=collCode_s&facet.limit=10000</pre>

<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/?q=(collCategory_s:REVUE%20NOT%20collCategory_s:(SET%20OR%20COLLOQUE%20OR%20ECOLE%20OR%20PRES%20OR%20UNIV%20OR%20LABO%20OR%20THEME%20OR%20INSTITUTION%20OR%20AUTRE))&rows=0&wt=json&facet=true&facet.field=collCode_s&facet.limit=10000&facet.mincount=1&facet.field=collCategory_s</pre>

=== Liste des dépôts par labo d'une université (et uniquement des labos affiliés à l'université), par année de dépôt et par type de document déposé ===
L'objectif est d'avoir les dépôts qui sont passés par un portail mais qui ne sont pas affiliés à une structure relevant de ce portail (des erreurs de dépôt)
<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/</pre>

=== Liste des dépôts pour une plage entre 2 années d'une structure dont les labos sont en statut OLD ===
L'objectif est d'avoir les dépôts qui sont passés par un portail mais qui ne sont pas affiliés à une structure relevant de ce portail (des erreurs de dépôt)
<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/hal/?omitHeader=true&wt=csv&q=*&fq=instStructId_i:300297&fq=labStructValid_s:OLD&fq=producedDateY_i:%5B2000%20TO%202014%5D</pre>

=== Liste des dépôts de texte intégral d'une institution pour une année ===
<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/hal/?omitHeader=true&wt=xml&q=*&fq=instStructId_i:300297&fq=submittedDateY_i:2015&facet=true&facet.mincount=1&facet.pivot.mincount=1&facet.limit=10000&facet.pivot=labStructName_s,submittedDateM_i&rows=0</pre>

=== Liste des identifiants des revues des notices non valides d'une collection ===
<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/hal/?omitHeader=true&wt=xml&q=*&fq=instStructId_i:AAA&fq=submittedDateY_i:BBB&facet=true&facet.mincount=1&facet.pivot.mincount=1&facet.limit=10000&facet.pivot=labStructName_s,submittedDateM_i&rows=0</pre>

=== Liste des identifiants des revues des notices non valides d'une collection ===
<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/3774/?q=*&rows=0&wt=xml&fq=journalValid_s:INCOMING&facet=true&facet.field=journalId_i</pre>

=== Liste, triée par ordre de dépôt décroissante des dépôts, des articles publiées en revue, tamponnés par une collection, avec pour chacun la liste des auteurs, l'année de publication, le nom de la revue, ainsi que toutes les informations de RoMEO/SHERPA à propos de la politique éditoriale de la revue ===
<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/?q=collCode_s:3774%20AND%20docType_s:ART&wt=xml&sort=producedDate_s%20desc&rows=2000&fl=authFullName_s,journalTitle_s,submitType_s,journalSherpaColor_s,journalSherpaCondition_s,journalSherpaDate_s,journalSherpaPostPrint_s,journalSherpaPostRest_s,
journalSherpaPrePrint_s,journalSherpaPreRest_s,producedDateY_i</pre>

=== Liste des publications d'un auteur à partir de son idhal ===
Aller sur le site web du portail : Entrer dans la recherche avancée de HAL la chaîne de caractère de l'idhal de l'auteur / champ IDHAL 
Exporter le résultat (exporte l'ensemble des résultats) : formats d'exports = ceux proposés par HAL

Requêtes sur les ressources de HAL

2019-07-15T08:58:15Z

Mlarrieu :

=== Remarques générales ===
Les champs retournés par défaut sont docid, label_s et uri_s

Les résultats sont limités à 30 lignes par défaut

Le format de retour par défaut est JSON (installer un visualiseur json dans son navigateur)

Les requêtes ci-dessous sont toutes appliquées à une collection (ou un portail), on peut donc changer cet identifiant pour appliquer la requête à son contexte

== Requêtes simples pour récupérer des listes ==
=== Liste des dépôts d'une institution ou d'un regroupement ===
Dans ce cas on utilise simplement l'identifiant de l'institution. Dans Auréhal le niveau regroupement existe : https://doc.archives-ouvertes.fr/gerer-un-portail/referentiels/structures-de-recherche/.

La configuration du regroupement se fait donc dans Auréhal

Exemple pour le regroupement Comue Paris-Est (https://aurehal.archives-ouvertes.fr/structure/read/id/303512)
<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/?q=structId_i:303512</pre>

=== Liste des dépôts en open access d'une structure ===
dépôts Open Access : soit le plein texte est dans Hal (le champs ''submitType_s'') , soit il est sur le web via unpaywall, soit dans ArXiv soit dans Pubmed (champs ''linkExtId_s'')
<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/?&wt=xml&fq=structId_i:303512&fq=(submitType_s:file OR linkExtId_s:(openaccess OR arxiv OR pubmed))</pre>

=== Export des 50 derniers dépôts faits dans une collection par date de publication descendante ===
le filtre de tri est producedDate_tdate = date de publication
<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/SIC/?q=*:*&rows=50&wt=csv&sort=producedDate_tdate%20desc </pre>

Cette requête rapporte 50 résultats dans un export CSV

Si on fait la requête au format xml on voit le numreponse à 6122 => si on veut tout voir on peut mettre rows=6200.

=== Export des 50 derniers dépôts faits dans une collection par date de dépôt descendante ===
le filtre de tri est submittedDate_s = date de dépôt
<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/SIC/?q=*:*&rows=100&wt=csv&fl=submittedDate_s,producedDate_s,label_s&sort=submittedDate_s%20desc</pre>

=== Flux rss des dépôts faits dans une collection depuis 1 mois ===
Pour avoir la sortie sous la forme d'un flux RSS il faut indiquer wt=rss
<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/hal/?q=collCode_s:UNIV-ORLEANS&fq=releasedDate_tdate:[NOW%2FDAY-1MONTH+TO+NOW%2FDAY%2B1DAY]&fq=&rows=30&sort=submittedDate_tdate+desc&wt=rss</pre>

le champ rows indique le nombre de résultat qu'on souhaite récupérer (30 ici)

=== Flux rss des 3 derniers dépôts avec texte intégral ===
<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/pasteur/?wt=rss&q=*&sort=submittedDate_tdate+desc&fq=producedDate_tdate:[NOW-1YEARS%20TO%20NOW]&fq=submitType_s:file&fq=collCode_s%3APASTEUR&fq=NOT+status_i%3A111&rows=3</pre>

Dans le champ date, on récupère les 12 derniers mois (de moins 1 an à aujourd'hui) et on limite à 3 résultats (rows=3)

=== Liste des thèses d'une institution ===
<pre style="white-space:pre-wrap;">http://api.archives-ouvertes.fr/search/?q=docType_s:THESE%20AND%20authorityInstitution_s:%22Université%20d'Orléans%22&wt=csv&sort=producedDate_s%20desc&rows=2000&fl=halId_s,defenseDate_s,authFullName_s,thesisSchool_s,labStructAcronym_s,instStructAcronym_s,title_s,label_s</pre>

la liste des champs exportés est : halId_s,defenseDate_s,authFullName_s,thesisSchool_s,labStructAcronym_s,instStructAcronym_s,title_s,label_s

changer rows=2000 pour le nombre de réponses

Il faut indiquer le champ "authorityInstitution_s" : trouver le bon intitulé dans https://api.archives-ouvertes.fr/search/?q=*%3A*&rows=0&wt=xml&indent=true&facet=true&facet.field=authorityInstitution_s

== Requêtes sur les collections ==

=== Récupérer la liste des collections rattachées à son institution ===
Il s'agit là de récupérer par l'API la même liste que celle possible sur le portail : https://hal-univ-orleans.archives-ouvertes.fr/browse/scollection
<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/UNIV-ORLEANS/?q=*:*&rows=0&wt=xml&indent=true&facet=true&facet.field=collIsParentOfCategoryColl_fs&facet.prefix=UNIV-ORLEANS</pre>

Cette requête, comme la page du portail, liste les collections pour lesquelles dans leur configuration il a été complété le champ : Identifiant des collections supérieures.

=== Récupérer la liste des collections qui contiennent au moins un dépôt de son institution ===
<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/UNIV-ORLEANS/?q=*%3A*&rows=0&wt=xml&indent=true&facet=true&facet.field=collIsParentOfCategoryColl_fs</pre>

Le champs collIsParentOfCategoryColl_fs contient les données suivantes : Collection parente + _FacetSep_ + type collection parente + _JoinSep_ + Code de la collection + _FacetSep_ + Nom de la collection

== Requêtes d'analyse du contenu par type de documents ==

=== Connaître le cumul des dépôts de sa collection répartis par type de document ===
Requête à facette affichant une collection, le nombre d’occurrence par type de document
<pre style="white-space:pre-wrap;"> https://api.archives-ouvertes.fr/search/?q=*&fq=collCode_s:UNIV-ORLEANS&fq=NOT+status_i%3A111&start=0&rows=0&omitHeader=true&facet.mincount=1&facet.limit=10000&facet=true&facet.field=docType_s&facet.sort=count</pre>

Les cumuls sont calculés depuis 2011.

liste des types de documents dans HAL (41 en tout) : https://api.archives-ouvertes.fr/ref/doctype

=== Connaître le nombre total de dépôt année par année dans sa collection. Et pour chaque année la répartition des dépôts par type de document ===
Requête affichant le nombre de dépôt par année de publication
<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/UNIV-ORLEANS/?q=*:*&wt=xml&rows=0&facet=true&facet.pivot=submittedDateY_i,submitType_s,docType_s</pre>

Pour chaque année l'arbre xml affiche le nombre total de dépôt, puis l’élément pivot détaille le contenu annuel type de document par type de document.

=== Connaître le nombre de dépôt pour une année donnée dans sa collection présenté par type de documents ===

<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/univ-orleans/?q=*:*&rows=0&fq=submittedDateY_i:2019&facet=true&facet.field=docType_s&wt=xml</pre>

=== Méthode pour repérer les types d'articles (extractions HCERES) ===
Article du blog Carnet'IST. Proposition de requêtes sur le site web HAL pour distinguer, entre autres, les 4 types d’articles suivants : ACL; ACLN, ACSL, AV ou TRANSF
http://carnetist.hypotheses.org/240

== Requêtes d'analyse du contenu par domaine ==

=== Connaître le cumul des dépôts de sa collection répartis par domaines ===
Requête affichant le nombre de notice par domaine pour sa collection
<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/UNIV-ORLEANS/?q=%2A&fq=NOT+status_i%3A111&start=0&rows=0&wt=phps&omitHeader=true&facet.mincount=1&facet.limit=10000&facet=true&facet.field=level0_domain_s&facet.sort=count</pre>

Liste des domaines de HAL (393 en mai 2019) : http://api.archives-ouvertes.fr/ref/domain/?q=*:*&rows=400

== Requêtes d'analyse du contenu des revues (journal) ==

=== Connaître le nombre d'articles déposés par titre de revue dans sa collection ===
La requête affiche pour chaque revue le nombre d'articles déposés dans la collection HAL.
<pre style="white-space:pre-wrap;"> https://api.archives-ouvertes.fr/search/?q=*&fq=collCode_s:UNIV-ORLEANS&fq=NOT+status_i%3A111&start=0&rows=0&omitHeader=true&facet.mincount=1&facet.limit=10000&facet=true&facet.field=journalTitle_s&facet.sort=count</pre>
Le cumul est calculé depuis 2011 et ne concerne que le type "articles".

== Requêtes d'analyse de ses structures ==

=== Liste des structures affiliées à une institution et pas à une autre ===
Il s'agit par exemple de récupérer la liste des laboratoires attachés à l'université de Nancy et pas à l'université de Lorraine

<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/ref/structure/?fq=(parentDocid_i:300292%20AND%20NOT(parentDocid_i:413289))&fl=docid,name_s&wt=csv</pre>

Pour cette requêtes il faut récupérer dans Auréhal structure les identifiants des 2 structures à analyser

=== Liste de toutes les structures qui dépendent d'une structure ===
Requête sur le référentiel structure d'Auréhal
<pre style="white-space:pre-wrap;">http://api.archives-ouvertes.fr/ref/structure/?q=parentDocid_i:"74911"&rows=300&fl=name_s,acronym_s,code_s,docid,address_s,url_s,country_s&sort=acronym_s asc </pre>

* parentDocid = 74911 (université d'Angers)
* rows = 300. Permet d'avoir toutes les réponses, dans le résultat le numFound = 279.
* fl=name_s,acronym_s,code_s,docid,address_s,url_s,country_s : liste des champs demandé en réponse
* sort=acronym_s asc : trié par ordre alphabétique de l'acronyme

== Requêtes d'analyse des contributions ==

=== Nombre de dépôt par contributeur dans un portail, classés par année de dépôt ===
Requête à facette affichant par année, la liste des contributeurs déposant et le nombre de dépôt associé à chaque contributeur
<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/univ-orleans/?q=*:*&facet=true&facet.pivot=submittedDateY_i,contributorFullName_s&rows=0&wt=xml&facet.limit=1000</pre>

== Requêtes d'analyse des auteurs ==

=== Liste des auteurs dont une publication au moins est affiliée à une structure avec indication de leur IDHAL ou de l'absence d'IDHAL ===

Requête à facette listant les auteurs affiliés par un ou plusieurs dépôt à une structure
<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/?q=*:*&rows=0&wt=xml&facet=true&facet.query=structHasAuthIdHal_fs&facet.field=structHasAuthIdHal_fs&facet.prefix=129439_FacetSep_&facet.mincount=1&facet.limit=1000</pre>
ou
https://api.archives-ouvertes.fr/search/?q=*:*&rows=0&facet=true&facet.field=structHasAuthIdHal_fs&facet.prefix=226306_&wt=xml

Le champ facet.prefix indique l'identifiant de la structure d'affiliation voulue (à trouver dans Aurehal structure)

https://api.archives-ouvertes.fr/search/?q=*:*&rows=0&facet=true&facet.field=structHasAuthIdHal_fs&facet.prefix=245758_&wt=xml&fq=structId_i:245758

Pour ceux qui ont un idhal la chaine le représentant est entre ''_JoinSep_'' et ''_FacetSep_''

* Exemple avec Idhal : 226306_FacetSep_Maison des Sciences de l'Homme de Dijon''_JoinSep_'''''lsaligny'''''_FacetSep_''Saligny Laure
* Exemple sans Idhal : 226306_FacetSep_Maison des Sciences de l'Homme de Dijon''_JoinSep__FacetSep_''Alazard Céline

=== Nombre de publications scientifiques hors vulgarisation des auteurs d'une collection et d'un laboratoire spécifique par année universitaire de publication (2015-2016) en affichant uniquement les auteurs affiliés au laboratoire demandé et non pas tous les auteurs présents dans la collection ===
Requête indiquant le nombre de publications scientifiques par auteurs affiliés à une structure spécifique (&fq=authStructId_i:54305 et &facet.field=authIdHasPrimaryStructure_fs&facet.contains=_JoinSep_54305_FacetSep), pour une année universitaire donnée (&fq=producedDate_tdate:), hors vulgarisation (&fq=popularLevel_s:0)

<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/UNIV-REUNION/?q=collection_t:LIM&fq=authStructId_i:54305&fq=popularLevel_s:0&fq=producedDate_tdate:[2015-07-31T00:00:00Z TO 2016-07-31T00:00:00Z]&rows=0&indent=true&facet=true&sort=producedDate_tdate%20asc&facet.field=authIdHasPrimaryStructure_fs&facet.contains=_JoinSep_54305_FacetSep&wt=xml</pre>

Détails des paramètres :
* q=collection_t:LIM
* fq=authStructId_i:54305
* fq=popularLevel_s:0
* fq=producedDate_tdate:[2015-07-31T00:00:00Z%20TO%202016-07-31T00:00:00Z]
* rows=0
* indent=true
* &sort=producedDate_tdate%20asc
* facet.field=authIdHasPrimaryStructure_f
* facet.contains=_JoinSep_54305_FacetSep
* wt=xml

=== Liste des auteurs ayant un dépôt ou plusieurs affilié à une structure ayant créé leur CV HAL ===

Attention, la requête est dans le référentiel auteur, donc n'a pas de rapport avec les documents.
De plus structureId_i dans le référentiel auteur est l'organisme payeur - pas du tout la même chose que l'affiliation d'un auteur à une publication.

Requête effectuée dans le référentiel Auréhal Auteurs
<pre style="white-space:pre-wrap;">http://api.archives-ouvertes.fr/ref/author/?q=structureId_i:198056 AND hasCV_bool:true&rows=10000&sort=lastName_s asc&fl=idHal_s,idHal_i,lastName_s,firstName_s</pre>

Il est également possible de faire cette recherche directement sur Auréhal (https://aurehal.archives-ouvertes.fr/author/index) en indiquant dans le champ de recherche les valeurs de la requête : structureId_i:198056 AND hasCV_bool:true

[[File:Hal_requête_CV.png|800px]]

=== Autre solution ===

==== 1. Trouver tous les auteurs affiliés à la structure : ====

https://api.archives-ouvertes.fr/search/?indent=true&facet.field=structHasAuthIdHal_fs&facet.prefix=44429_FacetSep_&facet=on&indent=on&q=*:*&rows=0&wt=json&facet.limit=5000&facet.mincount=1

dans le résultat prendre ceux qui ont un idhal eg
44429_FacetSep_Laboratoire Interdisciplinaire Solidarités, Sociétés, Territoires_JoinSep_michel-grossetti_FacetSep_Grossetti Michel"

==== 2. chercher dans le référentiel auteur ====

pour chaque idhal chercher si l'auteur a un CV :

https://api.archives-ouvertes.fr/ref/author/?wt=xml&q=(idHal_s:michel-grossetti AND hasCV_bool:true)

si il y a 1 résultat: l'auteur a un CV

== Requêtes sur le contrôle qualité du contenu ==
=== Liste des dépôts effectués dans un portail X mais non affiliés à une structure de la collection XX ===
L'objectif est d'avoir les dépôts qui sont passés par un portail mais qui ne sont pas affiliés à une structure relevant de ce portail (des erreurs de dépôt)
<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/amu/?q=structure_t:*%20NOT%20%28%22Universit%C3%A9%20de%20Provence%20-%20Aix-Marseille%20I%22%20OR%20%22Universit%C3%A9%20de%20la%20M%C3%A9diterran%C3%A9e%20-%20Aix-Marseille%20II%22%20OR%20%22Universit%C3%A9%20Paul%20C%C3%A9zanne%20-%20Aix-Marseille%20III%22%20OR%20%22Universit%C3%A9%20de%20Provence%20-%20Aix-Marseille%201%22%20OR%20%20%22Universit%C3%A9%20de%20la%20M%C3%A9diterran%C3%A9e%20-%20Aix-Marseille%202%22%20OR%20%20%22Universit%C3%A9%20Paul%20C%C3%A9zanne%20-%20Aix-Marseille%203%22%20OR%20%22Aix-Marseille%20Universit%C3%A9%20-%20AMU%22%20OR%20%20%22PRES%20Aix%20Marseille%20Universit%C3%A9%22%20OR%20%22Aix%20Marseille%20Universit%C3%A9%22%29&wt=xml&fl=uri_s</pre>

== Requêtes qui restent à créer ou finaliser ==

=== Récupérer la lise de tous les "codes de collection" (soit collCode_s) de type "REVUE" (soit collCategory_s:REVUE) ===
<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/?q=*:*&rows=0&wt=xml&fq=collCategory_s:REVUE&facet=true&facet.field=collCode_s&facet.limit=10000</pre>

<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/?q=(collCategory_s:REVUE%20NOT%20collCategory_s:(SET%20OR%20COLLOQUE%20OR%20ECOLE%20OR%20PRES%20OR%20UNIV%20OR%20LABO%20OR%20THEME%20OR%20INSTITUTION%20OR%20AUTRE))&rows=0&wt=json&facet=true&facet.field=collCode_s&facet.limit=10000&facet.mincount=1&facet.field=collCategory_s</pre>

=== Liste des dépôts par labo d'une université (et uniquement des labos affiliés à l'université), par année de dépôt et par type de document déposé ===
L'objectif est d'avoir les dépôts qui sont passés par un portail mais qui ne sont pas affiliés à une structure relevant de ce portail (des erreurs de dépôt)
<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/</pre>

=== Liste des dépôts pour une plage entre 2 années d'une structure dont les labos sont en statut OLD ===
L'objectif est d'avoir les dépôts qui sont passés par un portail mais qui ne sont pas affiliés à une structure relevant de ce portail (des erreurs de dépôt)
<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/hal/?omitHeader=true&wt=csv&q=*&fq=instStructId_i:300297&fq=labStructValid_s:OLD&fq=producedDateY_i:%5B2000%20TO%202014%5D</pre>

=== Liste des dépôts de texte intégral d'une institution pour une année ===
<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/hal/?omitHeader=true&wt=xml&q=*&fq=instStructId_i:300297&fq=submittedDateY_i:2015&facet=true&facet.mincount=1&facet.pivot.mincount=1&facet.limit=10000&facet.pivot=labStructName_s,submittedDateM_i&rows=0</pre>

=== Liste des identifiants des revues des notices non valides d'une collection ===
<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/hal/?omitHeader=true&wt=xml&q=*&fq=instStructId_i:AAA&fq=submittedDateY_i:BBB&facet=true&facet.mincount=1&facet.pivot.mincount=1&facet.limit=10000&facet.pivot=labStructName_s,submittedDateM_i&rows=0</pre>

=== Liste des identifiants des revues des notices non valides d'une collection ===
<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/3774/?q=*&rows=0&wt=xml&fq=journalValid_s:INCOMING&facet=true&facet.field=journalId_i</pre>

=== Liste, triée par ordre de dépôt décroissante des dépôts, des articles publiées en revue, tamponnés par une collection, avec pour chacun la liste des auteurs, l'année de publication, le nom de la revue, ainsi que toutes les informations de RoMEO/SHERPA à propos de la politique éditoriale de la revue ===
<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/?q=collCode_s:3774%20AND%20docType_s:ART&wt=xml&sort=producedDate_s%20desc&rows=2000&fl=authFullName_s,journalTitle_s,submitType_s,journalSherpaColor_s,journalSherpaCondition_s,journalSherpaDate_s,journalSherpaPostPrint_s,journalSherpaPostRest_s,
journalSherpaPrePrint_s,journalSherpaPreRest_s,producedDateY_i</pre>

=== Liste des publications d'un auteur à partir de son idhal ===
Aller sur le site web du portail : Entrer dans la recherche avancée de HAL la chaîne de caractère de l'idhal de l'auteur / champ IDHAL 
Exporter le résultat (exporte l'ensemble des résultats) : formats d'exports = ceux proposés par HAL

Requêtes sur les ressources de HAL

2019-07-15T08:02:59Z

Mlarrieu : ajoutde *Liste des dépôts en open access d'une structure*

=== Remarques générales ===
Les champs retournés par défaut sont docid, label_s et uri_s

Les résultats sont limités à 30 lignes par défaut

Le format de retour par défaut est JSON (installer un visualiseur json dans son navigateur)

Les requêtes ci-dessous sont toutes appliquées à une collection (ou un portail), on peut donc changer cet identifiant pour appliquer la requête à son contexte

== Requêtes simples pour récupérer des listes ==
=== Liste des dépôts d'une institution ou d'un regroupement ===
Dans ce cas on utilise simplement l'identifiant de l'institution. Dans Auréhal le niveau regroupement existe : https://doc.archives-ouvertes.fr/gerer-un-portail/referentiels/structures-de-recherche/.

La configuration du regroupement se fait donc dans Auréhal

Exemple pour le regroupement Comue Paris-Est (https://aurehal.archives-ouvertes.fr/structure/read/id/303512)
<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/?q=structId_i:303512</pre>

=== Liste des dépôts en open access d'une structure ===
dépôts Open Access : soit le plein texte est dans Hal (le chanmps ''submitType_s'') , soit il est sur le web via unpaywall, soit dans ArXiv soit dans Pubmed (champs ''linkExtId_s'')
<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/?&wt=xml&fq=structId_i:303512&fq=(submitType_s:file OR linkExtId_s:(openaccess OR arxiv OR pubmed))</pre>

=== Export des 50 derniers dépôts faits dans une collection par date de publication descendante ===
le filtre de tri est producedDate_tdate = date de publication
<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/SIC/?q=*:*&rows=50&wt=csv&sort=producedDate_tdate%20desc </pre>

Cette requête rapporte 50 résultats dans un export CSV

Si on fait la requête au format xml on voit le numreponse à 6122 => si on veut tout voir on peut mettre rows=6200.

=== Export des 50 derniers dépôts faits dans une collection par date de dépôt descendante ===
le filtre de tri est submittedDate_s = date de dépôt
<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/SIC/?q=*:*&rows=100&wt=csv&fl=submittedDate_s,producedDate_s,label_s&sort=submittedDate_s%20desc</pre>

=== Flux rss des dépôts faits dans une collection depuis 1 mois ===
Pour avoir la sortie sous la forme d'un flux RSS il faut indiquer wt=rss
<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/hal/?q=collCode_s:UNIV-ORLEANS&fq=releasedDate_tdate:[NOW%2FDAY-1MONTH+TO+NOW%2FDAY%2B1DAY]&fq=&rows=30&sort=submittedDate_tdate+desc&wt=rss</pre>

le champ rows indique le nombre de résultat qu'on souhaite récupérer (30 ici)

=== Flux rss des 3 derniers dépôts avec texte intégral ===
<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/pasteur/?wt=rss&q=*&sort=submittedDate_tdate+desc&fq=producedDate_tdate:[NOW-1YEARS%20TO%20NOW]&fq=submitType_s:file&fq=collCode_s%3APASTEUR&fq=NOT+status_i%3A111&rows=3</pre>

Dans le champ date, on récupère les 12 derniers mois (de moins 1 an à aujourd'hui) et on limite à 3 résultats (rows=3)

=== Liste des thèses d'une institution ===
<pre style="white-space:pre-wrap;">http://api.archives-ouvertes.fr/search/?q=docType_s:THESE%20AND%20authorityInstitution_s:%22Université%20d'Orléans%22&wt=csv&sort=producedDate_s%20desc&rows=2000&fl=halId_s,defenseDate_s,authFullName_s,thesisSchool_s,labStructAcronym_s,instStructAcronym_s,title_s,label_s</pre>

la liste des champs exportés est : halId_s,defenseDate_s,authFullName_s,thesisSchool_s,labStructAcronym_s,instStructAcronym_s,title_s,label_s

changer rows=2000 pour le nombre de réponses

Il faut indiquer le champ "authorityInstitution_s" : trouver le bon intitulé dans https://api.archives-ouvertes.fr/search/?q=*%3A*&rows=0&wt=xml&indent=true&facet=true&facet.field=authorityInstitution_s

== Requêtes sur les collections ==

=== Récupérer la liste des collections rattachées à son institution ===
Il s'agit là de récupérer par l'API la même liste que celle possible sur le portail : https://hal-univ-orleans.archives-ouvertes.fr/browse/scollection
<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/UNIV-ORLEANS/?q=*:*&rows=0&wt=xml&indent=true&facet=true&facet.field=collIsParentOfCategoryColl_fs&facet.prefix=UNIV-ORLEANS</pre>

Cette requête, comme la page du portail, liste les collections pour lesquelles dans leur configuration il a été complété le champ : Identifiant des collections supérieures.

=== Récupérer la liste des collections qui contiennent au moins un dépôt de son institution ===
<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/UNIV-ORLEANS/?q=*%3A*&rows=0&wt=xml&indent=true&facet=true&facet.field=collIsParentOfCategoryColl_fs</pre>

Le champs collIsParentOfCategoryColl_fs contient les données suivantes : Collection parente + _FacetSep_ + type collection parente + _JoinSep_ + Code de la collection + _FacetSep_ + Nom de la collection

== Requêtes d'analyse du contenu par type de documents ==

=== Connaître le cumul des dépôts de sa collection répartis par type de document ===
Requête à facette affichant une collection, le nombre d’occurrence par type de document
<pre style="white-space:pre-wrap;"> https://api.archives-ouvertes.fr/search/?q=*&fq=collCode_s:UNIV-ORLEANS&fq=NOT+status_i%3A111&start=0&rows=0&omitHeader=true&facet.mincount=1&facet.limit=10000&facet=true&facet.field=docType_s&facet.sort=count</pre>

Les cumuls sont calculés depuis 2011.

liste des types de documents dans HAL (41 en tout) : https://api.archives-ouvertes.fr/ref/doctype

=== Connaître le nombre total de dépôt année par année dans sa collection. Et pour chaque année la répartition des dépôts par type de document ===
Requête affichant le nombre de dépôt par année de publication
<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/UNIV-ORLEANS/?q=*:*&wt=xml&rows=0&facet=true&facet.pivot=submittedDateY_i,submitType_s,docType_s</pre>

Pour chaque année l'arbre xml affiche le nombre total de dépôt, puis l’élément pivot détaille le contenu annuel type de document par type de document.

=== Connaître le nombre de dépôt pour une année donnée dans sa collection présenté par type de documents ===

<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/univ-orleans/?q=*:*&rows=0&fq=submittedDateY_i:2019&facet=true&facet.field=docType_s&wt=xml</pre>

=== Méthode pour repérer les types d'articles (extractions HCERES) ===
Article du blog Carnet'IST. Proposition de requêtes sur le site web HAL pour distinguer, entre autres, les 4 types d’articles suivants : ACL; ACLN, ACSL, AV ou TRANSF
http://carnetist.hypotheses.org/240

== Requêtes d'analyse du contenu par domaine ==

=== Connaître le cumul des dépôts de sa collection répartis par domaines ===
Requête affichant le nombre de notice par domaine pour sa collection
<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/UNIV-ORLEANS/?q=%2A&fq=NOT+status_i%3A111&start=0&rows=0&wt=phps&omitHeader=true&facet.mincount=1&facet.limit=10000&facet=true&facet.field=level0_domain_s&facet.sort=count</pre>

Liste des domaines de HAL (393 en mai 2019) : http://api.archives-ouvertes.fr/ref/domain/?q=*:*&rows=400

== Requêtes d'analyse du contenu des revues (journal) ==

=== Connaître le nombre d'articles déposés par titre de revue dans sa collection ===
La requête affiche pour chaque revue le nombre d'articles déposés dans la collection HAL.
<pre style="white-space:pre-wrap;"> https://api.archives-ouvertes.fr/search/?q=*&fq=collCode_s:UNIV-ORLEANS&fq=NOT+status_i%3A111&start=0&rows=0&omitHeader=true&facet.mincount=1&facet.limit=10000&facet=true&facet.field=journalTitle_s&facet.sort=count</pre>
Le cumul est calculé depuis 2011 et ne concerne que le type "articles".

== Requêtes d'analyse de ses structures ==

=== Liste des structures affiliées à une institution et pas à une autre ===
Il s'agit par exemple de récupérer la liste des laboratoires attachés à l'université de Nancy et pas à l'université de Lorraine

<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/ref/structure/?fq=(parentDocid_i:300292%20AND%20NOT(parentDocid_i:413289))&fl=docid,name_s&wt=csv</pre>

Pour cette requêtes il faut récupérer dans Auréhal structure les identifiants des 2 structures à analyser

=== Liste de toutes les structures qui dépendent d'une structure ===
Requête sur le référentiel structure d'Auréhal
<pre style="white-space:pre-wrap;">http://api.archives-ouvertes.fr/ref/structure/?q=parentDocid_i:"74911"&rows=300&fl=name_s,acronym_s,code_s,docid,address_s,url_s,country_s&sort=acronym_s asc </pre>

* parentDocid = 74911 (université d'Angers)
* rows = 300. Permet d'avoir toutes les réponses, dans le résultat le numFound = 279.
* fl=name_s,acronym_s,code_s,docid,address_s,url_s,country_s : liste des champs demandé en réponse
* sort=acronym_s asc : trié par ordre alphabétique de l'acronyme

== Requêtes d'analyse des contributions ==

=== Nombre de dépôt par contributeur dans un portail, classés par année de dépôt ===
Requête à facette affichant par année, la liste des contributeurs déposant et le nombre de dépôt associé à chaque contributeur
<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/univ-orleans/?q=*:*&facet=true&facet.pivot=submittedDateY_i,contributorFullName_s&rows=0&wt=xml&facet.limit=1000</pre>

== Requêtes d'analyse des auteurs ==

=== Liste des auteurs dont une publication au moins est affiliée à une structure avec indication de leur IDHAL ou de l'absence d'IDHAL ===

Requête à facette listant les auteurs affiliés par un ou plusieurs dépôt à une structure
<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/?q=*:*&rows=0&wt=xml&facet=true&facet.query=structHasAuthIdHal_fs&facet.field=structHasAuthIdHal_fs&facet.prefix=129439_FacetSep_&facet.mincount=1&facet.limit=1000</pre>
ou
https://api.archives-ouvertes.fr/search/?q=*:*&rows=0&facet=true&facet.field=structHasAuthIdHal_fs&facet.prefix=226306_&wt=xml

Le champ facet.prefix indique l'identifiant de la structure d'affiliation voulue (à trouver dans Aurehal structure)

https://api.archives-ouvertes.fr/search/?q=*:*&rows=0&facet=true&facet.field=structHasAuthIdHal_fs&facet.prefix=245758_&wt=xml&fq=structId_i:245758

Pour ceux qui ont un idhal la chaine le représentant est entre ''_JoinSep_'' et ''_FacetSep_''

* Exemple avec Idhal : 226306_FacetSep_Maison des Sciences de l'Homme de Dijon''_JoinSep_'''''lsaligny'''''_FacetSep_''Saligny Laure
* Exemple sans Idhal : 226306_FacetSep_Maison des Sciences de l'Homme de Dijon''_JoinSep__FacetSep_''Alazard Céline

=== Nombre de publications scientifiques hors vulgarisation des auteurs d'une collection et d'un laboratoire spécifique par année universitaire de publication (2015-2016) en affichant uniquement les auteurs affiliés au laboratoire demandé et non pas tous les auteurs présents dans la collection ===
Requête indiquant le nombre de publications scientifiques par auteurs affiliés à une structure spécifique (&fq=authStructId_i:54305 et &facet.field=authIdHasPrimaryStructure_fs&facet.contains=_JoinSep_54305_FacetSep), pour une année universitaire donnée (&fq=producedDate_tdate:), hors vulgarisation (&fq=popularLevel_s:0)

<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/UNIV-REUNION/?q=collection_t:LIM&fq=authStructId_i:54305&fq=popularLevel_s:0&fq=producedDate_tdate:[2015-07-31T00:00:00Z TO 2016-07-31T00:00:00Z]&rows=0&indent=true&facet=true&sort=producedDate_tdate%20asc&facet.field=authIdHasPrimaryStructure_fs&facet.contains=_JoinSep_54305_FacetSep&wt=xml</pre>

Détails des paramètres :
* q=collection_t:LIM
* fq=authStructId_i:54305
* fq=popularLevel_s:0
* fq=producedDate_tdate:[2015-07-31T00:00:00Z%20TO%202016-07-31T00:00:00Z]
* rows=0
* indent=true
* &sort=producedDate_tdate%20asc
* facet.field=authIdHasPrimaryStructure_f
* facet.contains=_JoinSep_54305_FacetSep
* wt=xml

=== Liste des auteurs ayant un dépôt ou plusieurs affilié à une structure ayant créé leur CV HAL ===

Attention, la requête est dans le référentiel auteur, donc n'a pas de rapport avec les documents.
De plus structureId_i dans le référentiel auteur est l'organisme payeur - pas du tout la même chose que l'affiliation d'un auteur à une publication.

Requête effectuée dans le référentiel Auréhal Auteurs
<pre style="white-space:pre-wrap;">http://api.archives-ouvertes.fr/ref/author/?q=structureId_i:198056 AND hasCV_bool:true&rows=10000&sort=lastName_s asc&fl=idHal_s,idHal_i,lastName_s,firstName_s</pre>

Il est également possible de faire cette recherche directement sur Auréhal (https://aurehal.archives-ouvertes.fr/author/index) en indiquant dans le champ de recherche les valeurs de la requête : structureId_i:198056 AND hasCV_bool:true

[[File:Hal_requête_CV.png|800px]]

=== Autre solution ===

==== 1. Trouver tous les auteurs affiliés à la structure : ====

https://api.archives-ouvertes.fr/search/?indent=true&facet.field=structHasAuthIdHal_fs&facet.prefix=44429_FacetSep_&facet=on&indent=on&q=*:*&rows=0&wt=json&facet.limit=5000&facet.mincount=1

dans le résultat prendre ceux qui ont un idhal eg
44429_FacetSep_Laboratoire Interdisciplinaire Solidarités, Sociétés, Territoires_JoinSep_michel-grossetti_FacetSep_Grossetti Michel"

==== 2. chercher dans le référentiel auteur ====

pour chaque idhal chercher si l'auteur a un CV :

https://api.archives-ouvertes.fr/ref/author/?wt=xml&q=(idHal_s:michel-grossetti AND hasCV_bool:true)

si il y a 1 résultat: l'auteur a un CV

== Requêtes sur le contrôle qualité du contenu ==
=== Liste des dépôts effectués dans un portail X mais non affiliés à une structure de la collection XX ===
L'objectif est d'avoir les dépôts qui sont passés par un portail mais qui ne sont pas affiliés à une structure relevant de ce portail (des erreurs de dépôt)
<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/amu/?q=structure_t:*%20NOT%20%28%22Universit%C3%A9%20de%20Provence%20-%20Aix-Marseille%20I%22%20OR%20%22Universit%C3%A9%20de%20la%20M%C3%A9diterran%C3%A9e%20-%20Aix-Marseille%20II%22%20OR%20%22Universit%C3%A9%20Paul%20C%C3%A9zanne%20-%20Aix-Marseille%20III%22%20OR%20%22Universit%C3%A9%20de%20Provence%20-%20Aix-Marseille%201%22%20OR%20%20%22Universit%C3%A9%20de%20la%20M%C3%A9diterran%C3%A9e%20-%20Aix-Marseille%202%22%20OR%20%20%22Universit%C3%A9%20Paul%20C%C3%A9zanne%20-%20Aix-Marseille%203%22%20OR%20%22Aix-Marseille%20Universit%C3%A9%20-%20AMU%22%20OR%20%20%22PRES%20Aix%20Marseille%20Universit%C3%A9%22%20OR%20%22Aix%20Marseille%20Universit%C3%A9%22%29&wt=xml&fl=uri_s</pre>

== Requêtes qui restent à créer ou finaliser ==

=== Récupérer la lise de tous les "codes de collection" (soit collCode_s) de type "REVUE" (soit collCategory_s:REVUE) ===
<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/?q=*:*&rows=0&wt=xml&fq=collCategory_s:REVUE&facet=true&facet.field=collCode_s&facet.limit=10000</pre>

<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/?q=(collCategory_s:REVUE%20NOT%20collCategory_s:(SET%20OR%20COLLOQUE%20OR%20ECOLE%20OR%20PRES%20OR%20UNIV%20OR%20LABO%20OR%20THEME%20OR%20INSTITUTION%20OR%20AUTRE))&rows=0&wt=json&facet=true&facet.field=collCode_s&facet.limit=10000&facet.mincount=1&facet.field=collCategory_s</pre>

=== Liste des dépôts par labo d'une université (et uniquement des labos affiliés à l'université), par année de dépôt et par type de document déposé ===
L'objectif est d'avoir les dépôts qui sont passés par un portail mais qui ne sont pas affiliés à une structure relevant de ce portail (des erreurs de dépôt)
<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/</pre>

=== Liste des dépôts pour une plage entre 2 années d'une structure dont les labos sont en statut OLD ===
L'objectif est d'avoir les dépôts qui sont passés par un portail mais qui ne sont pas affiliés à une structure relevant de ce portail (des erreurs de dépôt)
<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/hal/?omitHeader=true&wt=csv&q=*&fq=instStructId_i:300297&fq=labStructValid_s:OLD&fq=producedDateY_i:%5B2000%20TO%202014%5D</pre>

=== Liste des dépôts de texte intégral d'une institution pour une année ===
<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/hal/?omitHeader=true&wt=xml&q=*&fq=instStructId_i:300297&fq=submittedDateY_i:2015&facet=true&facet.mincount=1&facet.pivot.mincount=1&facet.limit=10000&facet.pivot=labStructName_s,submittedDateM_i&rows=0</pre>

=== Liste des identifiants des revues des notices non valides d'une collection ===
<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/hal/?omitHeader=true&wt=xml&q=*&fq=instStructId_i:AAA&fq=submittedDateY_i:BBB&facet=true&facet.mincount=1&facet.pivot.mincount=1&facet.limit=10000&facet.pivot=labStructName_s,submittedDateM_i&rows=0</pre>

=== Liste des identifiants des revues des notices non valides d'une collection ===
<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/3774/?q=*&rows=0&wt=xml&fq=journalValid_s:INCOMING&facet=true&facet.field=journalId_i</pre>

=== Liste, triée par ordre de dépôt décroissante des dépôts, des articles publiées en revue, tamponnés par une collection, avec pour chacun la liste des auteurs, l'année de publication, le nom de la revue, ainsi que toutes les informations de RoMEO/SHERPA à propos de la politique éditoriale de la revue ===
<pre style="white-space:pre-wrap;">https://api.archives-ouvertes.fr/search/?q=collCode_s:3774%20AND%20docType_s:ART&wt=xml&sort=producedDate_s%20desc&rows=2000&fl=authFullName_s,journalTitle_s,submitType_s,journalSherpaColor_s,journalSherpaCondition_s,journalSherpaDate_s,journalSherpaPostPrint_s,journalSherpaPostRest_s,
journalSherpaPrePrint_s,journalSherpaPreRest_s,producedDateY_i</pre>

=== Liste des publications d'un auteur à partir de son idhal ===
Aller sur le site web du portail : Entrer dans la recherche avancée de HAL la chaîne de caractère de l'idhal de l'auteur / champ IDHAL 
Exporter le résultat (exporte l'ensemble des résultats) : formats d'exports = ceux proposés par HAL

OpenAccessWeek

2019-07-04T09:45:17Z

Mlarrieu : ajout de OAW 2018 à Angers

=== Présentations des événements mis en place pour l'OA Week dans les établissements ===
== • Université d'Angers ==
'''''Contexte :''' 25 structures de recherche, 11 écoles doctorales , 850 Enseignant-chercheurs et chercheurs, 520 doctorants'' 
[[Fichier:oaua2018.PNG|200px|thumb|right|#OAUA2018]]
[[File:44881145775_8c14323042_m.jpg|200px|thumb|right|goodies]]
===== Dates OAW 2018 =====
du 22 au 27 octobre 2018
===== Format =====
- 1/2 journée d'étude avec intervenants + collation cf. [http://oaua2018.sciencesconf.org/ oaua2018.sciencesconf.org/] 
- 4 ateliers par Structure fédératrice de la recherche (groupement de laboratoire par thématique) 
- 1 ou 1/2 journée par ateliers 
- atelier libre : le chercheur vient avec une liste de publications et on l'accompagne pour le dépôt (plusieurs PC à disposition + goodies) 
===== Lieu =====
Chez les laboratoires, dans leurs locaux
===== Bilan =====
- 100 visiteurs 
- tous domaines rencontrés 
- +65 fichiers, +165 références (avec ou sans le texte) 
===== Points forts =====
Pour les ateliers : échange/rencontre avec la communauté, sensibilisation "personnelle" à l'Open Access, aux bonnes pratiques de publication 
Pour la Journée d'Étude : approfondissement des connaissances sur l'Open Access/Science auprès de la communauté scientifique, sensibilisation auprès des doctorants, engagement plus marqué auprès des chercheurs déjà investit. 

===== Questions récurrentes =====
L'intérêt d'Okina ? 
Je suis déjà dans ArXiv (ou autre) pourquoi déposer dans votre plateforme ? 
Ai-je le droit de déposer ? 
Comment trouver une revue en Open Access ? 
Les revues en Open Access n'ont pas de notoriété/visibilité 
 
cf. [http://oaua2018.sciencesconf.org/ oaua2018.sciencesconf.org/]

== • Université Clermont Auvergne ==
'''''Contexte :''' 39 structures de recherche / 3320 personnels (1281 chercheurs ou ens.-chercheurs / 1937 personnels techniques et administratifs) / 858 doctorants'' 
[[File:Flyer.jpg|200px]]
===== Dates OAW 2017 =====
du 6 au 17 novembre 
===== Format =====
- 16 ateliers sur 10 jours 
- 3h par atelier 
- forme de stands-ateliers libres (1 espace de démo sur PC / 1 espace de documentation + goodies / 1 espace de collations) 
===== Lieu =====
Sur l'ensemble du site de l'Université (12 dans des laboratoires, 4 dans des hall d'UFR ou d'écoles) 
===== Bilan =====
- 121 visiteurs 
- 60% des structures de recherche rencontrées 
===== Points forts =====
- L'installation au sein d'un laboratoire ciblé 
- Un contact interne au laboratoire 
- Le format "convivial" 
===== Questions récurrentes =====
- Quels droits encadrent le dépôt en archive ouverte (versions d’articles, monographies, embargos, etc.) ? 
- Comment récupérer une version post print ? 
- Quel intérêt au dépôt en archive ouverte ? 
- Quelle différence entre un réseau social académique (Researchgate, Academia, etc.) et une archive ouverte ?

== • Université Paris Nanterre ==
'''''Contexte :''' 41 laboratoires et 6 écoles doctorales / 1342 enseignants-chercheurs 
[[Fichier:UPN OAWeek2017_affiche_OpenCafe.jpg |200px|thumb|right|Affiche des Open Café, 2017]]
[[Fichier:UPN_OAWeek2017_affiche_HALathon.jpg |200px|thumb|right|Affiche du HALathon, 2017]]
===== Dates OAW 2017 =====
du 4 au 8 décembre 
===== Format =====
- Dépôt Party avec les Vice-Président(e)s de l’Université (formations, [https://www.youtube.com/watch?v=kAAkvyVdl-Q captation vidéo]) 
- Open Café dans les URF (ateliers libres), 3 jours, 4h par ateliers (Formation HAL sur PC, collation, documentation) 
- 2 expositions sur l'Open Access: [https://oam.biu-montpellier.fr/?page_id=1015 Open Access] (BIU de Montpellier) et [http://openaccess.parisnanterre.fr/open-access-week-2017/exposition-open-science-816657.kjsp Open Science] (Pierre-Carl Langlais) 
- HALathon jusqu’au 31 décembre 2017 (recueils de publications, et dépôts) 
===== Lieu =====
- Open Café : Maison Archéologie & l’Ethnologie, UFR de langue 
- Expositions : BU et Crous 
===== Bilan =====
- Dépot Party: Participation du Président de l’Université et de huit Vice-Président(e)s / La captation vidéo comptabilise plus de 400 vues (le 19 décembre 2017) 
- Open Café: environ 60 participants 
- HALathon: 52 participants / 600 publications déposées dans HAL (dont 500 sur le portail HAL Nanterre) 

===== Points forts =====
- Proximité avec les laboratoires et les chercheurs 
- Des ateliers informels et conviviaux 
===== Questions récurrentes =====
- Quels droits encadrent le dépôt en archive ouverte (versions d’articles, monographies, embargos, etc.) ? 
- Quelle différence entre un réseau social académique (Researchgate, Academia, etc.) et une archive ouverte ? 
- Quelle est la visibilité de HAL sur le plan international ?

Fichier:44881145775 8c14323042 m.jpg

2019-07-04T09:35:06Z

Mlarrieu : MsUpload

MsUpload

Fichier:Oaua2018.PNG

2019-07-04T08:40:39Z

Mlarrieu : MsUpload

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