CasuHAL AtelierAPI : Différence entre versions

De HAL
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== Notes libres pour l'atelier API des journées CasuHAL 2018 ==
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== Atelier API des journées CasuHAL 2019 ==
  
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== 13h30/13h45 : Dire ce qu'est une API ==
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=== Support de la présentation ===  
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*C’est un accès aux données.
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[[:File:CasuhalAtelierAPI2019.pdf]]
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*C’est une source de donnée qui est exposée de manière à être re-exploitée par des tiers.
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=== Mémos ===
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*C’est prendre la main sur les données afin de les organiser et les agencer autrement que sur l’interface standard.
 
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*C’est enrichir son site avec des données
 
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*API ou Webservices qui permettent d'extraire ou d'afficher une information du catalogue à partir d'une URL contenant des critères de recherche. (exemple Le Sudoc met diverses API à la disposition des systèmes locaux pour intégrer à la volée aux fonctions locales des données du système central.)
 
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*Les portails HAL sont une façon d'accéder au réservoir de données qu’est HAL
 
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*l'API donne accès à la base de données : c'est donc logiquement l'accès le plus complet possible (contrairement au site web qui ne permet à l'usager de ne faire que ce qui a été prévu)
 
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*Pour utiliser une API il faut connaître la structure des données, c’est pour ça qu’elles sont toujours accompagnées d’une documentation
 
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*Les formats de données = Json (Utile d'installer Json view dans son navigateur)
 
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*Sparql Endpoint : https://api.archives-ouvertes.fr/sparql
 
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*Des API partout : Isidore, Istex, Sudoc Abes.
 
  
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=== Sword ===
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Formats de réponse [[:File:afficheformatréponses.pdf]]
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*L'API de dépôt SWORD permet l'import automatique de documents dans l'archive ouverte HAL.
 
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*Comprendre qu'il s'agit d'une sorte de module permettant d'entrer des données dans HAL (comme on entre une donnée par le biais du formulaire de dépôt *manuel sur le site web HAL)
 
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*Pour entrer des données il faut respecter d'emblée un ensemble de contraintes. Type format TEI des notices (https://hal.archives-ouvertes.fr/documents/aofr.xsd). Type archive ZIP
 
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*Formulaire en ligne possible pour envoyer ses données : https://api.archives-ouvertes.fr/sword/upload/
 
  
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== 13h45 / 14h : Utiliser l'API d'archives-ouvertes ? démonstrations ==
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Paramètres groupes [[:File:affichegroupes.pdf]]
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*Cadrage : De mon point c'est dans les cas où les autres moyens d'accès aux données de HAL ne "suffisent" pas au besoin exprimé (pour les stats = ne pas oublier le module stats dans l'admin
 
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*Donc : notion de "besoin à exprimer"
 
  
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*On interroge la base donc interroger l'API ne résout pas les éventuels problèmes de qualités des données.
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Métadonnées [[:File:affichemetadonnees.pdf]]
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*Un exemple site web / API :
 
  
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https://hal.archives-ouvertes.fr/search/index : cocher toutes les options (pour comparer on cherche dans tout, voir que le site web ne cherche pas dans tout par défaut) : entrer les 2 mots api hal = 940 résultats. le site par défaut fait api AND hal
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Opérateurs de recherche [[:File:afficheopérateurs.pdf]]
  
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https://api.archives-ouvertes.fr/search/?q=api AND hal = 946 résultats (pourquoi 6 de + ? je ne sais pas : pas exactement la même requête en fait ou bien fraîcheur de la base ?).
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Récapitulatif des paramètres [[:File:afficheparamètres.pdf]]
  
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=== Le cas d'une possibilité d'utilisation de l'API dans un site web ===
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Paramètres des facettes [[:File:afficheparamètresfacettes.pdf]]
  
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Exemple de remontée d'une requête dans une page d'un site web : http://larhra.ish-lyon.cnrs.fr/membre/1. Voir F12 / onglet réseau comment ça fonctionne.
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Types de champs [[:File:affichetypeschamps.pdf]]
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Nécessite une compétence en dévpt web pour la partie mise en forme de la requête dans la page web ?... (voir d'ailleurs si les modules drupal et autres permettent qqchose à la souris ?)
 
  
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=== Le cas d'une autre possibilité -> enrichir un fichier de données avec des données de l'API :===
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== Atelier API des journées CasuHAL 2018 ==
  
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Avec Open Refine = ouvrir un fichier / importer des données en moissonnant l'API
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'''A l'occasion des journées CasuHAL 2018 et de l'atelier sur l'utilisation des API de HAL, nous avons proposé de commencer par lister des actions à mener pour favoriser l'utilisation des API par le réseau CasuHAL.'''
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Ci-dessous la trame de l'atelier
  
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== 14h / 14h15 : Le cas le + répandu = l'interrogation de l'API ==
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=== Explication de ce qu'est une API===
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Les APIs (Application Programming Interface ou interface de programmation) sont des interfaces qui permettent une communication machine à machine. Cela permet à une source de donnée de s'exposer pour un ré-emploi par un autre système informatique.
  
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Déconstruction de requêtes
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-> Ce que ça permet
  
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URL d'entrée
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-> Comment ça le permet
  
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-> Présentation des API Recherche et Référentiels de HAL
  
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critère : ?q=valeur OU ?q=champ:valeur / Séparateur &
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-> Précisions sur l'API d'import Sword et l'entrepôt OAI
  
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=== Supports de formation sur l'API HAL ===
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https://fr.slideshare.net/OAccsd/les-api-de-hal
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https://fr.slideshare.net/OAccsd/usage-des-api-de-hal
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https://www.slideshare.net/OAccsd/les-api-de-recherche-de-hal
 +
https://fr.slideshare.net/OAccsd/les-api-de-hal-formation-ccsd-mars-2016
 +
https://fr.slideshare.net/OAccsd/tei-hal-import-sword
  
−
filtre : fq=champ:valeur / séparateur &
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=== Utiliser l'API d'archives-ouvertes ? démonstrations ===
  
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+
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-> Requête -> Que faire du fichier retourné ?
  
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retour : fl=champ / séparateur ,
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-> Affichage "simple" dans un tableur : démonstration d'un export csv et affichage simple dans libreoffice
  
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les filtres sont sur des listes fermées :
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-> Utilisation de logiciels de traitement de données (pour enrichissement et/ou traitement et/ou nettoyage) : Démonstration avec OpenRefine d'un import de données récupérées, découpage du contenu d'une colonne etc.
  
 +
-> Affichage dans un site web : démonstration d'un affichage site web avec une requête dans l'API
  
−
=== Les types de champs ===
+
-> Autre ? (question à la salle ?)
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https://api.archives-ouvertes.fr/docs/search/schema/field-types/#field-types
 
  
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=== Comprendre les données interrogées ===
+
=== Réaliser des requêtes d'interrogation de l'API ===
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Exemple d'une notice auteur riche => https://api.archives-ouvertes.fr/ref/author/?q=docid:58415&wt=xml&fl=* / champs du référentiel authors => https://api.archives-ouvertes.fr/docs/ref/resource/author/schema/fields/#fields + aurehal + cv
 
  
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Exemple notice structure => https://api.archives-ouvertes.fr/ref/structure/?q=docid:300297&wt=xml&fl=* / champs du référentiel structure => https://api.archives-ouvertes.fr/docs/ref/resource/structure/schema/fields/#fields
+
-> Diaporama de présentation de la syntaxe des requêtes : [[:File:2018-06-01_CASUHAL_Utilisation des API.pdf]]
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===LN===
 
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{{boîte déroulante/début|titre=Informations contenues dans la documentation →|align=left}}
 
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*Il faut au moins un paramètre dans l'URL pour faire une requête, ce paramètre est q
 
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*Ce paramètre contient la requête à effectuer.
 
−
*Le paramètre doit être suivi du nom du champ dans lequel rechercher puis de la valeur à chercher.
 
−
*Si le nom du champ dans lequel chercher est omis, par défaut la recherche porte sur l'index text qui contient les valeurs de plusieurs champs.
 
−
*Pour chercher dans un champ particulier la syntaxe est champ:terme
 
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*Pour chercher plusieurs champs, utiliser (terme1 terme2). L'opérateur booléen par défaut est AND
 
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*Pour OR : Utiliser (terme1 OR terme2)
 
−
*Pour une phrase : Utiliser les guillemets doubles "phrase"
 
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*Troncature ? * ~ proximité
 
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//
 
−
*Le format de réponse par défaut est JSON
 
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*Le format de réponse est spécifié par le paramètre wt : wt=json
 
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*liste des formats dans la doc. Ajouter indent=true pour indenter le format de réponse.
 
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//
 
−
*Par défaut seuls les champs docid et label_s sont retournés dans une réponse. Cependant tous les champs stockés peuvent être retournés dans le format de réponse
 
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*Le paramètre pour choisir les champs à retourner est fl. Les champs demandés doivent être séparés par le signe ,
 
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*Formats de sortie avec fl = JSON, XML et CSV uniquement
 
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*On peut utiliser le caractère * comme troncature de nom de champ, eg fl=cha*
 
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''*fl=* signifie tous les champs possibles''
 
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//
 
−
*Par défaut, les résultats sont triés par pertinence.
 
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*Le tri des résultats peut se faire sur n'importe quel champ en évitant les champs de type text (suffixe "_t") et les champs multi-valués qui donneront des résultats imprévisibles.
 
−
*Le paramètre pour choisir les champs à retourner est sort + le sens de tri asc ou desc
 
−
//
 
−
*Le paramètre pour ajouter des filtres est fq suivi de la requête servant au filtre : fq=submitType_s:file
 
−
*Il est possible de faire des requêtes sur des intervalles avec cette syntaxe champ:[valeurDébut TO valeurFin]
 
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*valeur maximale = * + doc pour les spécificités des calculs de dates
 
−
//
 
−
*Le nombre de réponses à retourner est définit par le paramètre rows .
 
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*Le nombre total de dépôt/notices ne change pas avec ce paramètres, seul le nombre de résultats effectivement retournés varie.
 
−
*Par défaut les requêtes ne retournent que les 30 premiers résultats, le maximum autorisé est 10000. Si vous souhaitez plus de résultats vous devez utiliser la pagination.
 
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*Le paramètre &rows=0 peut permettre de ne retourner que le nombre de résultats et d'enlever les documents du corps de la réponse. Vous pouvez par exemple utiliser ce paramètre à des fins de statistiques ou si vous voulez retourner uniquement des facettes.
 
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//
 
−
*pagination : afficher 50 après les 50 1ers : start=50&rows=50
 
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*Curseurs : si vous devez parcourir plusieurs milliers de résultats, pour des raisons de performance il est fortement recommandé d'utiliser les curseurs
 
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//
 
−
*Les facettes sont des listes de termes extraits en fonction d'une requête.
 
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*On peut les utiliser pour avoir une liste de valeurs distinctes sur un champ donné.
 
−
*Pour générer des facettes, il faut ajouter le paramètre facet=true à une requête.
 
−
*Il faut ensuite ajouter les champs avec lesquel construire les facettes avec le paramètre facet.field=NomDuChamp à une requête.
 
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*facet.sort=index, count, prefix, contains (facet.contains.ignoreCase=true)
 
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*Pivots
 
−
*plage de résultats
 
−
//
 
−
*Vous pouvez obtenir vos résultats de requêtes groupés selon un critère de votre choix, à condition que le critère soit représenté par un champ non multivalué et de type string.
 
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{{Boîte déroulante/fin}}
 
  
−
== 14h15 / 14h30 : Analyses de 4 requêtes précises ==
+
-> Scan du contenu de la documentation [[Notes Hélène]]
  
−
Question : pourquoi l'export CSV n'est pas disponible en requête facet ?
+
=== Echange avec la salle et/ou démonstrations de requêtes ===
  
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'''1 / La question d'une liste d'auteur affiliés à un établissement (CF question précise posée sur la liste dans le cadre de la prépa de l'atelier)'''
+
=== Développer un réseau d’entraide autour des API de HAL : on objectif pour CasuHal ? ===
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Pistes / propositions :
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*Utiliser la liste hal.tech pour les questions concernant l’interrogation de l’API
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*Reporter sur le wiki les « réponses »
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*Compléter la documentation des requêtes déjà présentes sur le wiki
 +
*Constituer un inventaire des requêtes fréquemment demandées
 +
*Autre ?
  
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Ils ont réalisé 2 essais. Explication ? = les auteurs ne sont pas affiliés (dans auréhal) comme on pourrait le penser = Donc on cherche en fait dans l'api de recherche de documents et on extrait les affiliations par ce biais là. Ils souhaitent avoir les identifiants (orcid, idref and cie) = impossible en réalité puisque ça c'est stocké dans auréhal author donc il faudrait re requêter 1 à 1...
+
=== Je n'ai pas d'idées : quelles requêtes peuvent être intéressantes pour moi ? ===
 +
 
 +
'''1 / La question d'une liste d'auteurs affiliés à un établissement (CF question précise posée sur la liste dans le cadre de la prépa de l'atelier)'''
  
 
Essai 1 -> https://api.archives-ouvertes.fr/ref/author/?q=structureId_i:81173&fl=docid,label_s,idHal_i,idHal_s,*_id&rows=10000&wt=xml
 
Essai 1 -> https://api.archives-ouvertes.fr/ref/author/?q=structureId_i:81173&fl=docid,label_s,idHal_i,idHal_s,*_id&rows=10000&wt=xml
−
Référentiel auteur
+
Référentiel auteur  
  
 
Essai 2 -> https://api.archives-ouvertes.fr/search/uvsq/?q=*:*&facet=true&facet.field=structHasAuthIdHal_fs&facet.mincount=0&facet.prefix=81173_&rows=0&wt=xml&facet.limit=10000
 
Essai 2 -> https://api.archives-ouvertes.fr/search/uvsq/?q=*:*&facet=true&facet.field=structHasAuthIdHal_fs&facet.mincount=0&facet.prefix=81173_&rows=0&wt=xml&facet.limit=10000
  
−
Noter : Ces exports réalisés d'une machine pour une machine nécessitent un post-traitement pour les reprendre "humainement"
+
Les auteurs ne sont pas affiliés (dans auréhal) comme on pourrait le penser, ce sont dans les notices documents que les affiliations sont appliquées  = Donc on cherche dans l'api de recherche de documents et on extrait les affiliations par ce biais là.
−
Démo OpenRefine?
+
 
 +
Comment obtenir en plus dans cette liste les identifiants accrochés aux auteurs (orcid, idref and cie) = Re requêter 1 à 1 les auteur ?...
  
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=== Ensuite on propose 3 requêtes dont on pense que ce sont celles qui intéressent généralement les admin ===
 
  
 
'''2 / les affiliations : afficher ttes les structures affiliées à un auteur (https://api.archives-ouvertes.fr/docs/ref/resource/authorstructure)'''
 
'''2 / les affiliations : afficher ttes les structures affiliées à un auteur (https://api.archives-ouvertes.fr/docs/ref/resource/authorstructure)'''
Ligne 139 : Ligne 88 :
 
https://api.archives-ouvertes.fr/search/authorstructure/?firstName_t=prenom&lastName_t=nom&i&wt=xml
 
https://api.archives-ouvertes.fr/search/authorstructure/?firstName_t=prenom&lastName_t=nom&i&wt=xml
  
−
'''5 / Je n'ai pas d'idées : quelles requêtes font les usagers ??'''
 
−
requête API pour retrouver des doublons potentiels de publication pour une collection donnée pour une année de production donnée
 
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http://api.archives-ouvertes.fr/search/?q=collCode_s:%22INRIA%22%20AND%20producedDateY_i:2015&rows=0&wt=xml&indent=true&facet=true&facet.pivot=title_s,docType_s,halId_s&facet.limit=10&facet.mincount=2
 
  
−
'''1 / ?'''
+
'''3 / retrouver des doublons potentiels de publication pour une collection donnée pour une année de production donnée'''
  
−
https://api.archives-ouvertes.fr/search/?fq=labStructId_i:186732&fq=submittedDate_tdate:[* TO NOW]&fq=docType_s:ART&fl=halId_s&fl=docid&fl=contributorFullName_s&fl=title_s&fl=language_s&fl=docType_s&fl=submittedDate_s&fl=producedDateY_i&fl=journalTitle_s&fl=issue_s&fl=volume_s&fl=page_s&fl=doiId_s&fl=audience_s&fl=comment_s&fl=authLastNameFirstName_s&fl=rteamStructAcronym_s&fl=authId_i&fl=abstract_s&rows=200&wt=xml
+
http://api.archives-ouvertes.fr/search/?q=collCode_s:%22INRIA%22%20AND%20producedDateY_i:2015&rows=0&wt=xml&indent=true&facet=true&facet.pivot=title_s,docType_s,halId_s&facet.limit=10&facet.mincount=2
−
 
 
−
requête de recherche : ?fq puis &fl puis rows et enfin wt
 
−
 
 
−
labstructid = polen (univ orleans)
 
−
 
 
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date : * to now
 
−
 
 
−
NumFound = <result name="response" numFound="146" start="0">
 
−
 
 
−
'''2 / Liste des structures rattachées à une structure de + haut niveau.'''
 
−
 
 
−
https://api.archives-ouvertes.fr/ref/structure/?wt=xml&q=parentDocid_i:300297&fl=*
 
  
−
On a 165 résultats
 
  
−
on veut exporter en csv = https://api.archives-ouvertes.fr/ref/structure/?wt=csv&q=parentDocid_i:300297&fl=*
+
'''4 / Liste des structures rattachées à une structure de + haut niveau.'''
  
−
Attention la conf par défaut limite à 30 = il faut ajouter rows.
+
https://api.archives-ouvertes.fr/ref/structure/?wt=xml&q=parentDocid_i:300297&fl=* ou https://api.archives-ouvertes.fr/ref/structure/?wt=csv&q=parentDocid_i:300297&fl=*
  
−
==> Dire aux participants de poster leurs demandes de requêtes au support / revoir les pages requêtes sur le wiki ensemble ?
+
On a 165 résultats (Attention la conf par défaut limite à 30)

Version actuelle datée du 25 juin 2019 à 16:25

Atelier API des journées CasuHAL 2019

Support de la présentation

File:CasuhalAtelierAPI2019.pdf

Mémos

Formats de réponse File:afficheformatréponses.pdf

Paramètres groupes File:affichegroupes.pdf

Métadonnées File:affichemetadonnees.pdf

Opérateurs de recherche File:afficheopérateurs.pdf

Récapitulatif des paramètres File:afficheparamètres.pdf

Paramètres des facettes File:afficheparamètresfacettes.pdf

Types de champs File:affichetypeschamps.pdf

Atelier API des journées CasuHAL 2018

A l'occasion des journées CasuHAL 2018 et de l'atelier sur l'utilisation des API de HAL, nous avons proposé de commencer par lister des actions à mener pour favoriser l'utilisation des API par le réseau CasuHAL. Ci-dessous la trame de l'atelier

Explication de ce qu'est une API

Les APIs (Application Programming Interface ou interface de programmation) sont des interfaces qui permettent une communication machine à machine. Cela permet à une source de donnée de s'exposer pour un ré-emploi par un autre système informatique.

-> Ce que ça permet

-> Comment ça le permet

-> Présentation des API Recherche et Référentiels de HAL

-> Précisions sur l'API d'import Sword et l'entrepôt OAI

Supports de formation sur l'API HAL

https://fr.slideshare.net/OAccsd/les-api-de-hal
https://fr.slideshare.net/OAccsd/usage-des-api-de-hal
https://www.slideshare.net/OAccsd/les-api-de-recherche-de-hal
https://fr.slideshare.net/OAccsd/les-api-de-hal-formation-ccsd-mars-2016
https://fr.slideshare.net/OAccsd/tei-hal-import-sword

Utiliser l'API d'archives-ouvertes ? démonstrations

-> Requête -> Que faire du fichier retourné ?

-> Affichage "simple" dans un tableur : démonstration d'un export csv et affichage simple dans libreoffice

-> Utilisation de logiciels de traitement de données (pour enrichissement et/ou traitement et/ou nettoyage) : Démonstration avec OpenRefine d'un import de données récupérées, découpage du contenu d'une colonne etc.

-> Affichage dans un site web : démonstration d'un affichage site web avec une requête dans l'API

-> Autre ? (question à la salle ?)

Réaliser des requêtes d'interrogation de l'API

-> Diaporama de présentation de la syntaxe des requêtes : File:2018-06-01_CASUHAL_Utilisation des API.pdf

-> Scan du contenu de la documentation Notes Hélène

Echange avec la salle et/ou démonstrations de requêtes

Développer un réseau d’entraide autour des API de HAL : on objectif pour CasuHal ?

Pistes / propositions :

  • Utiliser la liste hal.tech pour les questions concernant l’interrogation de l’API
  • Reporter sur le wiki les « réponses »
  • Compléter la documentation des requêtes déjà présentes sur le wiki
  • Constituer un inventaire des requêtes fréquemment demandées
  • Autre ?

Je n'ai pas d'idées : quelles requêtes peuvent être intéressantes pour moi ?

1 / La question d'une liste d'auteurs affiliés à un établissement (CF question précise posée sur la liste dans le cadre de la prépa de l'atelier)

Essai 1 -> https://api.archives-ouvertes.fr/ref/author/?q=structureId_i:81173&fl=docid,label_s,idHal_i,idHal_s,*_id&rows=10000&wt=xml Référentiel auteur

Essai 2 -> https://api.archives-ouvertes.fr/search/uvsq/?q=*:*&facet=true&facet.field=structHasAuthIdHal_fs&facet.mincount=0&facet.prefix=81173_&rows=0&wt=xml&facet.limit=10000

Les auteurs ne sont pas affiliés (dans auréhal) comme on pourrait le penser, ce sont dans les notices documents que les affiliations sont appliquées = Donc on cherche dans l'api de recherche de documents et on extrait les affiliations par ce biais là.

Comment obtenir en plus dans cette liste les identifiants accrochés aux auteurs (orcid, idref and cie) = Re requêter 1 à 1 les auteur ?...


2 / les affiliations : afficher ttes les structures affiliées à un auteur (https://api.archives-ouvertes.fr/docs/ref/resource/authorstructure)

https://api.archives-ouvertes.fr/search/authorstructure/?firstName_t=prenom&lastName_t=nom&i&wt=xml


3 / retrouver des doublons potentiels de publication pour une collection donnée pour une année de production donnée

http://api.archives-ouvertes.fr/search/?q=collCode_s:%22INRIA%22%20AND%20producedDateY_i:2015&rows=0&wt=xml&indent=true&facet=true&facet.pivot=title_s,docType_s,halId_s&facet.limit=10&facet.mincount=2


4 / Liste des structures rattachées à une structure de + haut niveau.

https://api.archives-ouvertes.fr/ref/structure/?wt=xml&q=parentDocid_i:300297&fl=* ou https://api.archives-ouvertes.fr/ref/structure/?wt=csv&q=parentDocid_i:300297&fl=*

On a 165 résultats (Attention la conf par défaut limite à 30)

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